92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2617 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2617  peptidase S58, DmpA  100 
 
 		 332 aa  639    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2215  peptidase S58, DmpA  87.05 
 
 		 332 aa  535  1e-151  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4338  peptidase S58 DmpA  76.97 
 
 		 334 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1616  peptidase S58, DmpA  77.71 
 
 		 332 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5330  hypothetical protein  76.67 
 
 		 332 aa  483  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12369  normal  0.395647 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1773  peptidase S58, DmpA  73.8 
 
 		 331 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.800376  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3687  peptidase S58, DmpA  71.99 
 
 		 331 aa  461  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0972  peptidase S58 DmpA  65.47 
 
 		 358 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.898884  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2093  peptidase S58 DmpA  64.86 
 
 		 363 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201096  normal  0.024132 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2683  peptidase S58 DmpA  57.83 
 
 		 342 aa  371  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4768  peptidase S58 DmpA  62.92 
 
 		 329 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4248  peptidase S58 DmpA  63.64 
 
 		 329 aa  348  9e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4618  peptidase S58 DmpA  63.64 
 
 		 329 aa  347  2e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2156  peptidase S58 DmpA  61.18 
 
 		 340 aa  341  8e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4121  peptidase S58 DmpA  57.44 
 
 		 353 aa  337  9.999999999999999e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246913  normal  0.677622 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1091  peptidase S58 DmpA  54.93 
 
 		 328 aa  331  9e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4493  peptidase S58 DmpA  56.46 
 
 		 331 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3882  hypothetical protein  56.1 
 
 		 333 aa  320  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.482216  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1287  peptidase S58, DmpA  55.89 
 
 		 335 aa  318  1e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0721739  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4203  peptidase S58 DmpA  57.96 
 
 		 331 aa  315  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1488  peptidase S58 DmpA  54.85 
 
 		 335 aa  310  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0291995 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0772  peptidase S58, DmpA  52.4 
 
 		 356 aa  293  3e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.904933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2667  peptidase S58, DmpA  51.04 
 
 		 340 aa  277  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2889  putative peptidase  52.12 
 
 		 327 aa  271  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00143546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0311  peptidase S58 DmpA  49.27 
 
 		 345 aa  263  3e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0620  peptidase S58, DmpA  54.41 
 
 		 327 aa  262  6.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.975766  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4655  peptidase S58 DmpA  47.88 
 
 		 347 aa  254  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.505511 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0463  peptidase S58, DmpA  50 
 
 		 331 aa  242  7e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3189  peptidase S58 DmpA  53.03 
 
 		 339 aa  239  6.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2943  peptidase S58 DmpA  45.24 
 
 		 323 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2797  peptidase S58 DmpA  40.77 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3228  peptidase S58, DmpA  46.73 
 
 		 318 aa  210  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3716  peptidase S58 DmpA  45.18 
 
 		 329 aa  206  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00511947 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3837  peptidase S58, DmpA  46.31 
 
 		 340 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.449487  normal  0.0858293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3851  peptidase S58, DmpA  46.31 
 
 		 340 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3925  peptidase S58, DmpA  46.31 
 
 		 340 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0317  hypothetical protein  38.64 
 
 		 368 aa  190  4e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2351  peptidase S58, DmpA  45.67 
 
 		 340 aa  189  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260537  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0349  hypothetical protein  38.64 
 
 		 368 aa  189  5.999999999999999e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4294  peptidase S58, DmpA  47 
 
 		 340 aa  188  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3050  peptidase S58 DmpA  38.71 
 
 		 363 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578156  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29210  L-aminopeptidase/D-esterase  43.97 
 
 		 345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3677  peptidase S58 DmpA  45.23 
 
 		 350 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0168  peptidase S58 DmpA  37.76 
 
 		 319 aa  178  1e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2945  peptidase S58, DmpA  39.82 
 
 		 349 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0087  peptidase S58 DmpA  39.02 
 
 		 313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11365  hydrolase  46.64 
 
 		 344 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003196  normal  0.48244 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3246  peptidase S58, DmpA  40.29 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2605  peptidase S58, DmpA  42.23 
 
 		 337 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.47844 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1675  T4 family peptidase  34.48 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135147  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1077  peptidase S58 DmpA  35.17 
 
 		 328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.234138  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1669  peptidase S58, DmpA  42.32 
 
 		 334 aa  166  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1203  peptidase S58 DmpA  39.94 
 
 		 337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.794666  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1410  T4 family peptidase  33.86 
 
 		 325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568813  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2906  peptidase S58 DmpA  40.43 
 
 		 336 aa  163  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174879 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1959  peptidase S58, DmpA  42.22 
 
 		 306 aa  162  9e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1804  peptidase S58, DmpA  40.12 
 
 		 350 aa  161  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374201 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2660  peptidase S58 DmpA  40.68 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0482  peptidase S58 DmpA  33.02 
 
 		 316 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000526803  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2133  peptidase S58, DmpA  42.25 
 
 		 301 aa  155  7e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.74532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2221  peptidase S58 DmpA  36.41 
 
 		 361 aa  155  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010872  hitchhiker  4.545e-18 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04100  L-aminopeptidase/D-esterase  44 
 
 		 348 aa  153  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.037097 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1962  peptidase S58 DmpA  41.37 
 
 		 352 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2004  peptidase S58 DmpA  35.71 
 
 		 334 aa  145  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00577301  hitchhiker  0.0000000124631 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2319  peptidase S58 DmpA  40.85 
 
 		 361 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212071  decreased coverage  0.00000119169 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3087  peptidase S58 DmpA  39.53 
 
 		 291 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.145217 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0198  peptidase S58 DmpA  38.83 
 
 		 287 aa  125  7e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2264  peptidase S58 DmpA  38.28 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2376  peptidase S58 DmpA  31.23 
 
 		 282 aa  105  7e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.90605  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1456  peptidase S58 DmpA  35.03 
 
 		 300 aa  99.8  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.749732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6005  peptidase S58, DmpA  34.3 
 
 		 330 aa  90.1  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4346  peptidase S58 DmpA  53.33 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3006  peptidase S58 DmpA  28 
 
 		 350 aa  57  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1007  peptidase S58, DmpA  51.39 
 
 		 204 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442944  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0592  putative D-aminopeptidase  29.49 
 
 		 376 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1842  putative D-aminopeptidase  29.49 
 
 		 376 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0875  putative D-aminopeptidase  29.49 
 
 		 376 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0304  peptidase S58 DmpA  26.01 
 
 		 345 aa  49.3  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1108  putative D-aminopeptidase  30 
 
 		 376 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1022  putative D-aminopeptidase  30 
 
 		 376 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2326  peptidase  30 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5586  aminopeptidase DmpA  29.08 
 
 		 367 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.237816 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5294  aminopeptidase DmpA  29.08 
 
 		 367 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.660356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5206  aminopeptidase DmpA  29.08 
 
 		 367 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0839  aminopeptidase DmpA  30.58 
 
 		 364 aa  47.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0193478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1419  peptidase S58 DmpA  27.33 
 
 		 463 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3840  hypothetical protein  27.94 
 
 		 366 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45210  hypothetical protein  27.94 
 
 		 366 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4594  peptidase S58, DmpA  27.71 
 
 		 354 aa  44.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3094  peptidase S58 DmpA  29.72 
 
 		 352 aa  43.1  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0856606  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1200  peptidase S58 DmpA  27.08 
 
 		 347 aa  43.1  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4222  peptidase S58 DmpA  30.39 
 
 		 352 aa  42.7  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>