102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3677 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3677  peptidase S58 DmpA  100 
 
 		 350 aa  679    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2605  peptidase S58, DmpA  73.9 
 
 		 337 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.47844 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1203  peptidase S58 DmpA  72.73 
 
 		 337 aa  437  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.794666  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2906  peptidase S58 DmpA  71.18 
 
 		 336 aa  420  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174879 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1669  peptidase S58, DmpA  67.57 
 
 		 334 aa  400  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1804  peptidase S58, DmpA  69.86 
 
 		 350 aa  395  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374201 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3050  peptidase S58 DmpA  54.35 
 
 		 363 aa  342  8e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578156  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0349  hypothetical protein  53.61 
 
 		 368 aa  332  8e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0317  hypothetical protein  53.31 
 
 		 368 aa  330  3e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0168  peptidase S58 DmpA  51.58 
 
 		 319 aa  305  8.000000000000001e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2943  peptidase S58 DmpA  54.82 
 
 		 323 aa  282  5.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3716  peptidase S58 DmpA  54.97 
 
 		 329 aa  280  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00511947 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1410  T4 family peptidase  43.99 
 
 		 325 aa  276  3e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568813  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1675  T4 family peptidase  44.3 
 
 		 325 aa  276  4e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135147  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3228  peptidase S58, DmpA  53.65 
 
 		 318 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0087  peptidase S58 DmpA  50.65 
 
 		 313 aa  269  7e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3246  peptidase S58, DmpA  47.42 
 
 		 322 aa  267  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2797  peptidase S58 DmpA  49.07 
 
 		 331 aa  261  2e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0482  peptidase S58 DmpA  43.45 
 
 		 316 aa  258  2e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000526803  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2221  peptidase S58 DmpA  39.83 
 
 		 361 aa  256  5e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010872  hitchhiker  4.545e-18 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1959  peptidase S58, DmpA  50 
 
 		 306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1077  peptidase S58 DmpA  40.75 
 
 		 328 aa  253  3e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.234138  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29210  L-aminopeptidase/D-esterase  50 
 
 		 345 aa  244  9.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2351  peptidase S58, DmpA  51.34 
 
 		 340 aa  230  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4294  peptidase S58, DmpA  52.43 
 
 		 340 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2004  peptidase S58 DmpA  45.16 
 
 		 334 aa  210  3e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00577301  hitchhiker  0.0000000124631 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3851  peptidase S58, DmpA  46.72 
 
 		 340 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3925  peptidase S58, DmpA  46.72 
 
 		 340 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3837  peptidase S58, DmpA  46.72 
 
 		 340 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.449487  normal  0.0858293 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2945  peptidase S58, DmpA  45.99 
 
 		 349 aa  205  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11365  hydrolase  50 
 
 		 344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003196  normal  0.48244 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0972  peptidase S58 DmpA  46.3 
 
 		 358 aa  189  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.898884  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1962  peptidase S58 DmpA  44.8 
 
 		 352 aa  189  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2133  peptidase S58, DmpA  41.77 
 
 		 301 aa  188  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.74532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4338  peptidase S58 DmpA  42.99 
 
 		 334 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0198  peptidase S58 DmpA  44.2 
 
 		 287 aa  186  5e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2660  peptidase S58 DmpA  45.4 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1287  peptidase S58, DmpA  46.13 
 
 		 335 aa  183  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0721739  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0772  peptidase S58, DmpA  43.81 
 
 		 356 aa  183  4.0000000000000006e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.904933  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3087  peptidase S58 DmpA  43.8 
 
 		 291 aa  183  4.0000000000000006e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.145217 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2093  peptidase S58 DmpA  45.31 
 
 		 363 aa  182  7e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201096  normal  0.024132 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4768  peptidase S58 DmpA  45.94 
 
 		 329 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2156  peptidase S58 DmpA  47.74 
 
 		 340 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4618  peptidase S58 DmpA  46.58 
 
 		 329 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4248  peptidase S58 DmpA  46.58 
 
 		 329 aa  179  9e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1488  peptidase S58 DmpA  44.76 
 
 		 335 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0291995 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2667  peptidase S58, DmpA  40.63 
 
 		 340 aa  177  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0311  peptidase S58 DmpA  40.6 
 
 		 345 aa  176  7e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1616  peptidase S58, DmpA  42.02 
 
 		 332 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4655  peptidase S58 DmpA  41.72 
 
 		 347 aa  174  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.505511 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2617  peptidase S58, DmpA  45.23 
 
 		 332 aa  172  6.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1773  peptidase S58, DmpA  42.99 
 
 		 331 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.800376  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3687  peptidase S58, DmpA  41.34 
 
 		 331 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4121  peptidase S58 DmpA  42.49 
 
 		 353 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246913  normal  0.677622 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2215  peptidase S58, DmpA  42.64 
 
 		 332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2889  putative peptidase  43.53 
 
 		 327 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00143546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2683  peptidase S58 DmpA  40.18 
 
 		 342 aa  162  6e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5330  hypothetical protein  40.79 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12369  normal  0.395647 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0620  peptidase S58, DmpA  41.09 
 
 		 327 aa  156  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.975766  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2319  peptidase S58 DmpA  42.78 
 
 		 361 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212071  decreased coverage  0.00000119169 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0463  peptidase S58, DmpA  40.95 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1091  peptidase S58 DmpA  38.18 
 
 		 328 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1456  peptidase S58 DmpA  42.51 
 
 		 300 aa  153  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.749732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04100  L-aminopeptidase/D-esterase  44.59 
 
 		 348 aa  150  4e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.037097 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3189  peptidase S58 DmpA  43.82 
 
 		 339 aa  146  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3882  hypothetical protein  38.48 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.482216  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4493  peptidase S58 DmpA  36.86 
 
 		 331 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4203  peptidase S58 DmpA  38.46 
 
 		 331 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2376  peptidase S58 DmpA  32.51 
 
 		 282 aa  125  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.90605  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6005  peptidase S58, DmpA  35.81 
 
 		 330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2264  peptidase S58 DmpA  40.92 
 
 		 311 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4346  peptidase S58 DmpA  52.75 
 
 		 299 aa  79.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1007  peptidase S58, DmpA  50.43 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442944  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3533  peptidase S58, DmpA  30.3 
 
 		 372 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0592  putative D-aminopeptidase  32.86 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0875  putative D-aminopeptidase  32.86 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1842  putative D-aminopeptidase  32.86 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1108  putative D-aminopeptidase  33.44 
 
 		 376 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1022  putative D-aminopeptidase  33.44 
 
 		 376 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2326  peptidase  33.44 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0605  peptidase S58 DmpA  31.58 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3840  hypothetical protein  30.42 
 
 		 366 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1650  D-aminopeptidase, putative  33.03 
 
 		 407 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45210  hypothetical protein  30.1 
 
 		 366 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152868  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3844  D-aminopeptidase putative  29.94 
 
 		 377 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2417  peptidase S58 DmpA  31.14 
 
 		 365 aa  50.1  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2559  peptidase S58 DmpA  30.16 
 
 		 367 aa  50.1  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117376 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1923  aminopeptidase DmpA  34.33 
 
 		 346 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1411  peptidase S58, DmpA  32.06 
 
 		 352 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.704657  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6180  peptidase S58 DmpA  30.22 
 
 		 375 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0304  peptidase S58 DmpA  26.05 
 
 		 345 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2448  aminopeptidase DmpA  29.1 
 
 		 489 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.357188  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4211  peptidase S58 DmpA  31.43 
 
 		 369 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.131306 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1411  peptidase S58 DmpA  29.82 
 
 		 489 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1507  peptidase S58 DmpA  29.82 
 
 		 489 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1684  aminopeptidase DmpA  30.12 
 
 		 369 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  0.901493 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4251  aminopeptidase DmpA  28.37 
 
 		 372 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3737  peptidase S58, DmpA  31.65 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0673701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4044  peptidase S58, DmpA  31.17 
 
 		 369 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181806  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4322  peptidase S58, DmpA  31.17 
 
 		 369 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.810072  normal  0.828723 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>