125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2889 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2889  putative peptidase  100 
 
 		 327 aa  636    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00143546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0772  peptidase S58, DmpA  73.23 
 
 		 356 aa  430  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.904933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2667  peptidase S58, DmpA  67.06 
 
 		 340 aa  404  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0620  peptidase S58, DmpA  66.46 
 
 		 327 aa  366  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.975766  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1488  peptidase S58 DmpA  62.24 
 
 		 335 aa  342  5e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0291995 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1287  peptidase S58, DmpA  58.01 
 
 		 335 aa  328  7e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0721739  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2683  peptidase S58 DmpA  58.38 
 
 		 342 aa  315  5e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4768  peptidase S58 DmpA  58.61 
 
 		 329 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0972  peptidase S58 DmpA  59.7 
 
 		 358 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.898884  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1091  peptidase S58 DmpA  58.12 
 
 		 328 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2156  peptidase S58 DmpA  59.29 
 
 		 340 aa  296  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4248  peptidase S58 DmpA  58.66 
 
 		 329 aa  295  5e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3882  hypothetical protein  57.83 
 
 		 333 aa  295  5e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.482216  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2093  peptidase S58 DmpA  58.72 
 
 		 363 aa  293  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201096  normal  0.024132 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4493  peptidase S58 DmpA  58.97 
 
 		 331 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4618  peptidase S58 DmpA  57.75 
 
 		 329 aa  285  5e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1773  peptidase S58, DmpA  51.68 
 
 		 331 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.800376  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4338  peptidase S58 DmpA  52.6 
 
 		 334 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4121  peptidase S58 DmpA  56.96 
 
 		 353 aa  279  4e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246913  normal  0.677622 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4203  peptidase S58 DmpA  59.29 
 
 		 331 aa  278  8e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3687  peptidase S58, DmpA  51.84 
 
 		 331 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1616  peptidase S58, DmpA  52.13 
 
 		 332 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5330  hypothetical protein  53.35 
 
 		 332 aa  267  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12369  normal  0.395647 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2215  peptidase S58, DmpA  50.9 
 
 		 332 aa  265  8e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4655  peptidase S58 DmpA  51.31 
 
 		 347 aa  265  8e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.505511 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2617  peptidase S58, DmpA  52.12 
 
 		 332 aa  260  2e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0311  peptidase S58 DmpA  50.31 
 
 		 345 aa  243  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3189  peptidase S58 DmpA  52.28 
 
 		 339 aa  233  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0463  peptidase S58, DmpA  49.24 
 
 		 331 aa  218  1e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2943  peptidase S58 DmpA  47.84 
 
 		 323 aa  216  5e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3851  peptidase S58, DmpA  49.12 
 
 		 340 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3925  peptidase S58, DmpA  49.12 
 
 		 340 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3837  peptidase S58, DmpA  49.12 
 
 		 340 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.449487  normal  0.0858293 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2797  peptidase S58 DmpA  43.24 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2351  peptidase S58, DmpA  48.25 
 
 		 340 aa  185  8e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0168  peptidase S58 DmpA  39.25 
 
 		 319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0482  peptidase S58 DmpA  37.65 
 
 		 316 aa  182  7e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000526803  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3716  peptidase S58 DmpA  43.51 
 
 		 329 aa  177  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00511947 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3050  peptidase S58 DmpA  41.27 
 
 		 363 aa  176  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578156  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1410  T4 family peptidase  38.36 
 
 		 325 aa  176  5e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568813  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4294  peptidase S58, DmpA  50.71 
 
 		 340 aa  176  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29210  L-aminopeptidase/D-esterase  44.19 
 
 		 345 aa  173  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1675  T4 family peptidase  37.77 
 
 		 325 aa  172  5e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135147  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0317  hypothetical protein  41.44 
 
 		 368 aa  170  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3228  peptidase S58, DmpA  42.35 
 
 		 318 aa  170  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0349  hypothetical protein  41.44 
 
 		 368 aa  169  6e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1669  peptidase S58, DmpA  44.22 
 
 		 334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2945  peptidase S58, DmpA  38.73 
 
 		 349 aa  164  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1804  peptidase S58, DmpA  40.75 
 
 		 350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374201 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0087  peptidase S58 DmpA  41.64 
 
 		 313 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3677  peptidase S58 DmpA  42.06 
 
 		 350 aa  162  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1203  peptidase S58 DmpA  41.32 
 
 		 337 aa  162  7e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.794666  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2605  peptidase S58, DmpA  42.22 
 
 		 337 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.47844 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2906  peptidase S58 DmpA  41.3 
 
 		 336 aa  156  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174879 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1077  peptidase S58 DmpA  32.74 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.234138  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11365  hydrolase  46.58 
 
 		 344 aa  153  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003196  normal  0.48244 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3246  peptidase S58, DmpA  39.58 
 
 		 322 aa  153  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2660  peptidase S58 DmpA  43.12 
 
 		 322 aa  152  7e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1959  peptidase S58, DmpA  41.27 
 
 		 306 aa  149  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2221  peptidase S58 DmpA  32.8 
 
 		 361 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010872  hitchhiker  4.545e-18 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2319  peptidase S58 DmpA  41.48 
 
 		 361 aa  145  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212071  decreased coverage  0.00000119169 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1962  peptidase S58 DmpA  39.76 
 
 		 352 aa  144  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04100  L-aminopeptidase/D-esterase  44.06 
 
 		 348 aa  143  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.037097 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0198  peptidase S58 DmpA  38.52 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2004  peptidase S58 DmpA  38.46 
 
 		 334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00577301  hitchhiker  0.0000000124631 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2133  peptidase S58, DmpA  39.8 
 
 		 301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.74532  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3087  peptidase S58 DmpA  37.28 
 
 		 291 aa  127  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.145217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1456  peptidase S58 DmpA  37.07 
 
 		 300 aa  112  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.749732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2264  peptidase S58 DmpA  37.82 
 
 		 311 aa  94  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2376  peptidase S58 DmpA  29.03 
 
 		 282 aa  92.8  7e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.90605  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6005  peptidase S58, DmpA  31.65 
 
 		 330 aa  75.5  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4346  peptidase S58 DmpA  53.04 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4112  peptidase S58 DmpA  29.78 
 
 		 358 aa  70.9  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.971314  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0592  putative D-aminopeptidase  32.99 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0875  putative D-aminopeptidase  32.99 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1842  putative D-aminopeptidase  32.99 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2326  peptidase  32.53 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1108  putative D-aminopeptidase  32.53 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1022  putative D-aminopeptidase  32.53 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4401  peptidase S58 DmpA  29.41 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3533  peptidase S58, DmpA  30.04 
 
 		 372 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0605  peptidase S58 DmpA  30.63 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3974  peptidase S58 DmpA  27.74 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1923  aminopeptidase DmpA  30.21 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45210  hypothetical protein  29.72 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4594  peptidase S58, DmpA  30.75 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0143  peptidase S58 DmpA  27.47 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0984939  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1650  D-aminopeptidase, putative  33.67 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3840  hypothetical protein  29.72 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3006  peptidase S58 DmpA  30.6 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3844  D-aminopeptidase putative  27.92 
 
 		 377 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2417  peptidase S58 DmpA  29.41 
 
 		 365 aa  55.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6180  peptidase S58 DmpA  28.92 
 
 		 375 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1411  peptidase S58 DmpA  28.7 
 
 		 489 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1507  peptidase S58 DmpA  28.7 
 
 		 489 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5206  aminopeptidase DmpA  29.18 
 
 		 367 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5294  aminopeptidase DmpA  29.18 
 
 		 367 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.660356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5586  aminopeptidase DmpA  29.18 
 
 		 367 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.237816 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2448  aminopeptidase DmpA  29 
 
 		 489 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.357188  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4044  peptidase S58, DmpA  31.36 
 
 		 369 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>