85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1669 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1669  peptidase S58, DmpA  100 
 
 
334 aa  653    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1203  peptidase S58 DmpA  72.89 
 
 
337 aa  434  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.794666  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2605  peptidase S58, DmpA  73.19 
 
 
337 aa  437  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.47844 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2906  peptidase S58 DmpA  71.12 
 
 
336 aa  419  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0174879 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1804  peptidase S58, DmpA  71.6 
 
 
350 aa  420  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.374201 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3677  peptidase S58 DmpA  68.09 
 
 
350 aa  409  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0349  hypothetical protein  53.99 
 
 
368 aa  325  1e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3050  peptidase S58 DmpA  53.07 
 
 
363 aa  324  2e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578156  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0317  hypothetical protein  53.68 
 
 
368 aa  322  4e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3716  peptidase S58 DmpA  54.86 
 
 
329 aa  289  5.0000000000000004e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00511947 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0168  peptidase S58 DmpA  48.55 
 
 
319 aa  284  2.0000000000000002e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3228  peptidase S58, DmpA  54.87 
 
 
318 aa  279  5e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2943  peptidase S58 DmpA  54.49 
 
 
323 aa  275  6e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1410  T4 family peptidase  44.52 
 
 
325 aa  273  3e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568813  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1675  T4 family peptidase  44.19 
 
 
325 aa  271  1e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135147  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1077  peptidase S58 DmpA  41.53 
 
 
328 aa  256  4e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.234138  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0087  peptidase S58 DmpA  51.46 
 
 
313 aa  255  9e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2221  peptidase S58 DmpA  39.39 
 
 
361 aa  251  1e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010872  hitchhiker  4.545e-18 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1959  peptidase S58, DmpA  51.32 
 
 
306 aa  245  6e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3246  peptidase S58, DmpA  46.4 
 
 
322 aa  241  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0482  peptidase S58 DmpA  45.07 
 
 
316 aa  241  2e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000526803  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2797  peptidase S58 DmpA  45.45 
 
 
331 aa  241  2e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29210  L-aminopeptidase/D-esterase  49.32 
 
 
345 aa  213  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2351  peptidase S58, DmpA  48.22 
 
 
340 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260537  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3925  peptidase S58, DmpA  46.03 
 
 
340 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3851  peptidase S58, DmpA  46.03 
 
 
340 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3837  peptidase S58, DmpA  46.03 
 
 
340 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.449487  normal  0.0858293 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2004  peptidase S58 DmpA  42.9 
 
 
334 aa  196  4.0000000000000005e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00577301  hitchhiker  0.0000000124631 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1287  peptidase S58, DmpA  43.82 
 
 
335 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0721739  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4294  peptidase S58, DmpA  47.25 
 
 
340 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3087  peptidase S58 DmpA  44.36 
 
 
291 aa  192  7e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.145217 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2133  peptidase S58, DmpA  43.41 
 
 
301 aa  191  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.74532  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2667  peptidase S58, DmpA  43.42 
 
 
340 aa  191  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1488  peptidase S58 DmpA  43.38 
 
 
335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0291995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0972  peptidase S58 DmpA  45.02 
 
 
358 aa  189  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.898884  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0772  peptidase S58, DmpA  46.4 
 
 
356 aa  187  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.904933  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0198  peptidase S58 DmpA  42.76 
 
 
287 aa  187  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4768  peptidase S58 DmpA  43.98 
 
 
329 aa  187  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49009  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2945  peptidase S58, DmpA  41.33 
 
 
349 aa  186  4e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2156  peptidase S58 DmpA  47.55 
 
 
340 aa  186  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2093  peptidase S58 DmpA  45.33 
 
 
363 aa  185  8e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201096  normal  0.024132 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4618  peptidase S58 DmpA  43.03 
 
 
329 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4248  peptidase S58 DmpA  43.03 
 
 
329 aa  179  9e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0836973  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11365  hydrolase  44.55 
 
 
344 aa  177  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003196  normal  0.48244 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2660  peptidase S58 DmpA  43.24 
 
 
322 aa  176  5e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0311  peptidase S58 DmpA  43.03 
 
 
345 aa  173  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2683  peptidase S58 DmpA  40.72 
 
 
342 aa  171  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4655  peptidase S58 DmpA  38.44 
 
 
347 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.505511 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4121  peptidase S58 DmpA  45 
 
 
353 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246913  normal  0.677622 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2889  putative peptidase  42.17 
 
 
327 aa  166  4e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00143546  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1962  peptidase S58 DmpA  43.51 
 
 
352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1616  peptidase S58, DmpA  40.6 
 
 
332 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108778  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4338  peptidase S58 DmpA  38.7 
 
 
334 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0620  peptidase S58, DmpA  43.51 
 
 
327 aa  158  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.975766  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2617  peptidase S58, DmpA  39.21 
 
 
332 aa  157  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1091  peptidase S58 DmpA  38.56 
 
 
328 aa  157  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1456  peptidase S58 DmpA  41.67 
 
 
300 aa  155  9e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.749732  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2215  peptidase S58, DmpA  37.99 
 
 
332 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04100  L-aminopeptidase/D-esterase  41.06 
 
 
348 aa  151  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.037097 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3687  peptidase S58, DmpA  38.44 
 
 
331 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1773  peptidase S58, DmpA  38.7 
 
 
331 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.800376  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5330  hypothetical protein  39.21 
 
 
332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12369  normal  0.395647 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4203  peptidase S58 DmpA  41.56 
 
 
331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4493  peptidase S58 DmpA  41.25 
 
 
331 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3882  hypothetical protein  40.95 
 
 
333 aa  142  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.482216  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2319  peptidase S58 DmpA  40.4 
 
 
361 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212071  decreased coverage  0.00000119169 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0463  peptidase S58, DmpA  40.9 
 
 
331 aa  139  8.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3189  peptidase S58 DmpA  41.9 
 
 
339 aa  132  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.746127 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2376  peptidase S58 DmpA  30.58 
 
 
282 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.90605  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6005  peptidase S58, DmpA  36.69 
 
 
330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2264  peptidase S58 DmpA  39.13 
 
 
311 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1007  peptidase S58, DmpA  50 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442944  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4346  peptidase S58 DmpA  53.04 
 
 
299 aa  68.9  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0304  peptidase S58 DmpA  26.95 
 
 
345 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2417  peptidase S58 DmpA  27.97 
 
 
365 aa  49.3  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1411  peptidase S58, DmpA  35.33 
 
 
352 aa  49.3  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.704657  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1923  aminopeptidase DmpA  34.42 
 
 
346 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4594  peptidase S58, DmpA  35.48 
 
 
354 aa  48.1  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4222  peptidase S58 DmpA  33.13 
 
 
352 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45210  hypothetical protein  33.73 
 
 
366 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152868  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2891  peptidase S58 DmpA  27.64 
 
 
373 aa  46.6  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3840  hypothetical protein  29.23 
 
 
366 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2559  peptidase S58 DmpA  32.14 
 
 
367 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117376 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0136  aminopeptidase DmpA  35.22 
 
 
358 aa  44.3  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2806  peptidase S58 DmpA  31.48 
 
 
375 aa  42.4  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>