97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2683 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2683  peptidase S58 DmpA  100 
 
 		 342 aa  677    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1091  peptidase S58 DmpA  65.96 
 
 		 328 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4338  peptidase S58 DmpA  59.64 
 
 		 334 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1773  peptidase S58, DmpA  58.73 
 
 		 331 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.800376  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2215  peptidase S58, DmpA  58.13 
 
 		 332 aa  361  9e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1616  peptidase S58, DmpA  56.93 
 
 		 332 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3687  peptidase S58, DmpA  58.13 
 
 		 331 aa  355  5e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2093  peptidase S58 DmpA  60.6 
 
 		 363 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201096  normal  0.024132 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2617  peptidase S58, DmpA  57.83 
 
 		 332 aa  354  1e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5330  hypothetical protein  58.43 
 
 		 332 aa  353  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12369  normal  0.395647 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0972  peptidase S58 DmpA  58.94 
 
 		 358 aa  349  4e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.898884  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2156  peptidase S58 DmpA  57.48 
 
 		 340 aa  318  7e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4493  peptidase S58 DmpA  57.66 
 
 		 331 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4768  peptidase S58 DmpA  56.67 
 
 		 329 aa  315  6e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1488  peptidase S58 DmpA  56.5 
 
 		 335 aa  312  6.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0291995 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1287  peptidase S58, DmpA  56.36 
 
 		 335 aa  311  2e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0721739  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2889  putative peptidase  58.38 
 
 		 327 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00143546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4203  peptidase S58 DmpA  58.26 
 
 		 331 aa  309  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3882  hypothetical protein  57.27 
 
 		 333 aa  309  5.9999999999999995e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.482216  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4121  peptidase S58 DmpA  55.69 
 
 		 353 aa  307  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246913  normal  0.677622 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0772  peptidase S58, DmpA  58.18 
 
 		 356 aa  305  6e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.904933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4618  peptidase S58 DmpA  56.97 
 
 		 329 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4248  peptidase S58 DmpA  56.36 
 
 		 329 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2667  peptidase S58, DmpA  54.57 
 
 		 340 aa  298  7e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0311  peptidase S58 DmpA  52.99 
 
 		 345 aa  296  4e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0620  peptidase S58, DmpA  54.79 
 
 		 327 aa  263  3e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.975766  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4655  peptidase S58 DmpA  50.44 
 
 		 347 aa  256  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.505511 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3189  peptidase S58 DmpA  48.34 
 
 		 339 aa  222  8e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2797  peptidase S58 DmpA  43.32 
 
 		 331 aa  215  9e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0463  peptidase S58, DmpA  44.95 
 
 		 331 aa  208  9e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2943  peptidase S58 DmpA  43.75 
 
 		 323 aa  207  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0317  hypothetical protein  42.09 
 
 		 368 aa  200  3.9999999999999996e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0349  hypothetical protein  42.09 
 
 		 368 aa  199  7e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3050  peptidase S58 DmpA  39.88 
 
 		 363 aa  192  6e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578156  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3837  peptidase S58, DmpA  44.01 
 
 		 340 aa  189  8e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.449487  normal  0.0858293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3851  peptidase S58, DmpA  44.01 
 
 		 340 aa  189  8e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3925  peptidase S58, DmpA  44.01 
 
 		 340 aa  189  8e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3228  peptidase S58, DmpA  40.92 
 
 		 318 aa  187  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0168  peptidase S58 DmpA  37.05 
 
 		 319 aa  186  4e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3716  peptidase S58 DmpA  41.98 
 
 		 329 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00511947 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29210  L-aminopeptidase/D-esterase  42.05 
 
 		 345 aa  172  5.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4294  peptidase S58, DmpA  43.81 
 
 		 340 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0087  peptidase S58 DmpA  37.5 
 
 		 313 aa  172  9e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2351  peptidase S58, DmpA  43.48 
 
 		 340 aa  170  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1410  T4 family peptidase  35.58 
 
 		 325 aa  170  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568813  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1675  T4 family peptidase  35.26 
 
 		 325 aa  169  8e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135147  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0482  peptidase S58 DmpA  35.71 
 
 		 316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000526803  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1669  peptidase S58, DmpA  41.64 
 
 		 334 aa  162  6e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2906  peptidase S58 DmpA  40.4 
 
 		 336 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174879 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1077  peptidase S58 DmpA  34.55 
 
 		 328 aa  161  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.234138  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1959  peptidase S58, DmpA  38.11 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3677  peptidase S58 DmpA  38.48 
 
 		 350 aa  159  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1804  peptidase S58, DmpA  39.1 
 
 		 350 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374201 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2945  peptidase S58, DmpA  37.06 
 
 		 349 aa  155  7e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2605  peptidase S58, DmpA  36.61 
 
 		 337 aa  152  7e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.47844 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2660  peptidase S58 DmpA  38.7 
 
 		 322 aa  150  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1203  peptidase S58 DmpA  36.31 
 
 		 337 aa  149  8e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.794666  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11365  hydrolase  40.23 
 
 		 344 aa  147  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003196  normal  0.48244 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2221  peptidase S58 DmpA  34.06 
 
 		 361 aa  142  7e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010872  hitchhiker  4.545e-18 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1962  peptidase S58 DmpA  40.29 
 
 		 352 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3246  peptidase S58, DmpA  35.4 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04100  L-aminopeptidase/D-esterase  40.34 
 
 		 348 aa  135  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.037097 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2004  peptidase S58 DmpA  35.24 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00577301  hitchhiker  0.0000000124631 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2319  peptidase S58 DmpA  35.41 
 
 		 361 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212071  decreased coverage  0.00000119169 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0198  peptidase S58 DmpA  36.59 
 
 		 287 aa  119  6e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2133  peptidase S58, DmpA  34.14 
 
 		 301 aa  119  6e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.74532  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3087  peptidase S58 DmpA  35.93 
 
 		 291 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.145217 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2264  peptidase S58 DmpA  37.98 
 
 		 311 aa  109  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1456  peptidase S58 DmpA  34.04 
 
 		 300 aa  96.3  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.749732  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2376  peptidase S58 DmpA  28.72 
 
 		 282 aa  90.5  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.90605  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6005  peptidase S58, DmpA  28.4 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4346  peptidase S58 DmpA  44.54 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4112  peptidase S58 DmpA  27.83 
 
 		 358 aa  57  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.971314  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3006  peptidase S58 DmpA  31.31 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1923  aminopeptidase DmpA  27.76 
 
 		 346 aa  55.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3106  peptidase S58, DmpA  28.44 
 
 		 364 aa  55.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4222  peptidase S58 DmpA  36.76 
 
 		 352 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4594  peptidase S58, DmpA  31.25 
 
 		 354 aa  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3974  peptidase S58 DmpA  28.75 
 
 		 351 aa  51.2  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4401  peptidase S58 DmpA  26.91 
 
 		 360 aa  49.7  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0839  aminopeptidase DmpA  33.51 
 
 		 364 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0193478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4055  peptidase S58 DmpA  53.12 
 
 		 360 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0304  peptidase S58 DmpA  27.4 
 
 		 345 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3574  peptidase S58, DmpA  53.12 
 
 		 360 aa  46.2  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0115434  normal  0.141356 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0136  aminopeptidase DmpA  28.06 
 
 		 358 aa  46.2  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4423  peptidase S58 DmpA  31.53 
 
 		 357 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.405309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1007  peptidase S58, DmpA  45.78 
 
 		 204 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442944  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3240  peptidase S58 DmpA  27.75 
 
 		 357 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0143  peptidase S58 DmpA  26.22 
 
 		 352 aa  45.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0984939  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45210  hypothetical protein  26.91 
 
 		 366 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3840  hypothetical protein  27.57 
 
 		 366 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3094  peptidase S58 DmpA  28.57 
 
 		 352 aa  43.9  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0856606  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4166  peptidase S58, DmpA  27.73 
 
 		 360 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735465 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4200  peptidase S58, DmpA  27.73 
 
 		 360 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381793  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1864  aminopeptidase DmpA  30.43 
 
 		 360 aa  43.1  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3350  peptidase S58 DmpA  31.63 
 
 		 360 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.013595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0995  aminopeptidase DmpA  34 
 
 		 387 aa  42.7  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0120323 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>