95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3574 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4055  peptidase S58 DmpA  96.67 
 
 		 360 aa  658    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3574  peptidase S58, DmpA  100 
 
 		 360 aa  711    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0115434  normal  0.141356 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4166  peptidase S58, DmpA  92.68 
 
 		 360 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735465 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4200  peptidase S58, DmpA  92.68 
 
 		 360 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381793  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3350  peptidase S58 DmpA  92.7 
 
 		 360 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.013595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1864  aminopeptidase DmpA  92.13 
 
 		 360 aa  609  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4423  peptidase S58 DmpA  84.62 
 
 		 357 aa  555  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.405309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4222  peptidase S58 DmpA  70.37 
 
 		 352 aa  482  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3127  peptidase S58 DmpA  70.57 
 
 		 366 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0839  aminopeptidase DmpA  71.43 
 
 		 364 aa  461  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0193478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1322  peptidase S58 DmpA  67.16 
 
 		 341 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0281785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1256  peptidase S58 DmpA  66.67 
 
 		 341 aa  408  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0136  aminopeptidase DmpA  63.61 
 
 		 358 aa  401  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1923  aminopeptidase DmpA  64.69 
 
 		 346 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3106  peptidase S58, DmpA  63.5 
 
 		 364 aa  393  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1411  peptidase S58, DmpA  65.09 
 
 		 352 aa  392  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.704657  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4594  peptidase S58, DmpA  62.06 
 
 		 354 aa  379  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1661  aminopeptidase DmpA  65.36 
 
 		 354 aa  381  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3006  peptidase S58 DmpA  63.25 
 
 		 350 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1383  D-aminopeptidase protein  64.46 
 
 		 341 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.306178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3240  peptidase S58 DmpA  63.58 
 
 		 357 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0321  aminopeptidase DmpA  78.85 
 
 		 442 aa  329  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1355  aminopeptidase DmpA  78.85 
 
 		 448 aa  329  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.275545  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1764  aminopeptidase DmpA  78.85 
 
 		 451 aa  329  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0242  D-aminopeptidase  78.85 
 
 		 448 aa  329  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.547192  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0398  L-aminopeptidase/D-esterase  78.85 
 
 		 448 aa  329  4e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.343359  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1849  L-aminopeptidase/D-esterase  78.85 
 
 		 442 aa  328  7e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0143  peptidase S58 DmpA  55.03 
 
 		 352 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0984939  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1116  D-aminopeptidase, putative  76.39 
 
 		 446 aa  326  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3974  peptidase S58 DmpA  53.96 
 
 		 351 aa  323  2e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4401  peptidase S58 DmpA  54.35 
 
 		 360 aa  321  9.999999999999999e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4112  peptidase S58 DmpA  54.46 
 
 		 358 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.971314  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3561  peptidase S58 DmpA  52.87 
 
 		 358 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.949161  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0051  L-aminopeptidase/D-esterase  46.71 
 
 		 369 aa  305  6e-82  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0531  D-aminopeptidase, putative  51.66 
 
 		 340 aa  302  5.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0461  putative D-aminopeptidase  51.66 
 
 		 340 aa  302  6.000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.509897  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1200  peptidase S58 DmpA  49.41 
 
 		 347 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0304  peptidase S58 DmpA  44.38 
 
 		 345 aa  277  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5170  peptidase S58 DmpA  50.6 
 
 		 345 aa  275  7e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.935854  normal  0.481324 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2891  peptidase S58 DmpA  40.48 
 
 		 373 aa  257  3e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3094  peptidase S58 DmpA  42.12 
 
 		 352 aa  247  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0856606  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5706  peptidase S58 DmpA  46.09 
 
 		 375 aa  246  6e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3571  peptidase S58 DmpA  42.05 
 
 		 372 aa  239  4e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985399  normal  0.76681 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1419  peptidase S58 DmpA  39.66 
 
 		 463 aa  233  5e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1507  peptidase S58 DmpA  40.79 
 
 		 489 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1411  peptidase S58 DmpA  40.79 
 
 		 489 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2448  aminopeptidase DmpA  40.79 
 
 		 489 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.357188  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2417  peptidase S58 DmpA  43.86 
 
 		 365 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0995  aminopeptidase DmpA  43.62 
 
 		 387 aa  220  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2046  peptidase S58 DmpA  40.75 
 
 		 376 aa  211  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173525  hitchhiker  0.00567247 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3656  aminopeptidase DmpA  41.57 
 
 		 371 aa  209  5e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.950122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17440  L-aminopeptidase DmpA  43.68 
 
 		 381 aa  204  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.558769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2559  peptidase S58 DmpA  42.94 
 
 		 367 aa  203  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117376 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5913  aminopeptidase  42.77 
 
 		 349 aa  202  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6011  peptidase S58 DmpA  40.55 
 
 		 373 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3844  D-aminopeptidase putative  41.14 
 
 		 377 aa  199  9e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3533  peptidase S58, DmpA  40.83 
 
 		 372 aa  192  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5206  aminopeptidase DmpA  41.74 
 
 		 367 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5294  aminopeptidase DmpA  41.74 
 
 		 367 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.660356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5586  aminopeptidase DmpA  41.74 
 
 		 367 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.237816 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0605  peptidase S58 DmpA  42.48 
 
 		 369 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0592  putative D-aminopeptidase  42.38 
 
 		 376 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1842  putative D-aminopeptidase  42.38 
 
 		 376 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0875  putative D-aminopeptidase  42.38 
 
 		 376 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2806  peptidase S58 DmpA  38.65 
 
 		 375 aa  186  8e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3141  peptidase S58, DmpA  39.03 
 
 		 393 aa  182  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.478527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1479  peptidase S58 DmpA  41.28 
 
 		 318 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3384  peptidase S58, DmpA  38.33 
 
 		 394 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266715 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3840  hypothetical protein  41.42 
 
 		 366 aa  179  8e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45210  hypothetical protein  41.42 
 
 		 366 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1108  putative D-aminopeptidase  43.47 
 
 		 376 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1022  putative D-aminopeptidase  43.47 
 
 		 376 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2326  peptidase  42.86 
 
 		 376 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6180  peptidase S58 DmpA  41.02 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2464  aminopeptidase  41.52 
 
 		 348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00184488  normal  0.106032 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3737  peptidase S58, DmpA  46.84 
 
 		 369 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0673701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4211  peptidase S58 DmpA  46.47 
 
 		 369 aa  170  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.131306 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4288  peptidase S58 DmpA  46.52 
 
 		 369 aa  169  7e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.443184 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2592  peptidase S58 DmpA  42.03 
 
 		 368 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119043 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1650  D-aminopeptidase, putative  42.64 
 
 		 407 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1684  aminopeptidase DmpA  45.76 
 
 		 369 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  0.901493 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3199  peptidase S58 DmpA  45.72 
 
 		 369 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4044  peptidase S58, DmpA  45.72 
 
 		 369 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181806  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4322  peptidase S58, DmpA  45.72 
 
 		 369 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.810072  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4251  aminopeptidase DmpA  37.65 
 
 		 372 aa  161  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1047  aminopeptidase DmpA  36.63 
 
 		 370 aa  155  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0633499  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2683  peptidase S58 DmpA  31.4 
 
 		 342 aa  47.4  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1287  peptidase S58, DmpA  29.38 
 
 		 335 aa  46.6  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0721739  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1091  peptidase S58 DmpA  30.77 
 
 		 328 aa  46.2  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3189  peptidase S58 DmpA  34.02 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4618  peptidase S58 DmpA  37.9 
 
 		 329 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1488  peptidase S58 DmpA  32.34 
 
 		 335 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0291995 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0772  peptidase S58, DmpA  34.56 
 
 		 356 aa  45.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.904933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0087  peptidase S58 DmpA  30.1 
 
 		 313 aa  44.3  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2093  peptidase S58 DmpA  35.96 
 
 		 363 aa  42.7  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201096  normal  0.024132 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>