99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3189 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3189  peptidase S58 DmpA  100 
 
 
339 aa  647    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0463  peptidase S58, DmpA  57.06 
 
 
331 aa  299  5e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4655  peptidase S58 DmpA  54.65 
 
 
347 aa  298  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.505511 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2667  peptidase S58, DmpA  52.41 
 
 
340 aa  291  1e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0311  peptidase S58 DmpA  53.03 
 
 
345 aa  277  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2156  peptidase S58 DmpA  57.36 
 
 
340 aa  272  7e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0620  peptidase S58, DmpA  55.12 
 
 
327 aa  267  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.975766  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0972  peptidase S58 DmpA  55.21 
 
 
358 aa  264  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.898884  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1287  peptidase S58, DmpA  52.9 
 
 
335 aa  264  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0721739  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0772  peptidase S58, DmpA  50.45 
 
 
356 aa  262  4.999999999999999e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.904933  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4768  peptidase S58 DmpA  54.6 
 
 
329 aa  261  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49009  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4338  peptidase S58 DmpA  50.91 
 
 
334 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4618  peptidase S58 DmpA  55.83 
 
 
329 aa  253  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4248  peptidase S58 DmpA  55.52 
 
 
329 aa  253  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0836973  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2889  putative peptidase  52.28 
 
 
327 aa  252  5.000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00143546  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1488  peptidase S58 DmpA  50.92 
 
 
335 aa  253  5.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0291995 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5330  hypothetical protein  50.61 
 
 
332 aa  252  7e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12369  normal  0.395647 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4121  peptidase S58 DmpA  52.6 
 
 
353 aa  251  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246913  normal  0.677622 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2093  peptidase S58 DmpA  52.6 
 
 
363 aa  251  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201096  normal  0.024132 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1616  peptidase S58, DmpA  50.61 
 
 
332 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108778  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1773  peptidase S58, DmpA  50.46 
 
 
331 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.800376  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2215  peptidase S58, DmpA  52.73 
 
 
332 aa  251  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2617  peptidase S58, DmpA  53.03 
 
 
332 aa  249  3e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2683  peptidase S58 DmpA  48.34 
 
 
342 aa  248  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1091  peptidase S58 DmpA  47.13 
 
 
328 aa  247  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3687  peptidase S58, DmpA  49.54 
 
 
331 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3882  hypothetical protein  48.34 
 
 
333 aa  223  4.9999999999999996e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.482216  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2797  peptidase S58 DmpA  44.51 
 
 
331 aa  217  2.9999999999999998e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2943  peptidase S58 DmpA  45.92 
 
 
323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4493  peptidase S58 DmpA  45.92 
 
 
331 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3716  peptidase S58 DmpA  47.55 
 
 
329 aa  206  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00511947 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0168  peptidase S58 DmpA  40.18 
 
 
319 aa  206  4e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3228  peptidase S58, DmpA  46.34 
 
 
318 aa  202  5e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4203  peptidase S58 DmpA  42.99 
 
 
331 aa  199  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3837  peptidase S58, DmpA  47.44 
 
 
340 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.449487  normal  0.0858293 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3925  peptidase S58, DmpA  47.44 
 
 
340 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3851  peptidase S58, DmpA  47.44 
 
 
340 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29210  L-aminopeptidase/D-esterase  44.13 
 
 
345 aa  189  7e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2351  peptidase S58, DmpA  48.5 
 
 
340 aa  188  9e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260537  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4294  peptidase S58, DmpA  48.01 
 
 
340 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3050  peptidase S58 DmpA  40.06 
 
 
363 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578156  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2945  peptidase S58, DmpA  42.53 
 
 
349 aa  180  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3677  peptidase S58 DmpA  43.07 
 
 
350 aa  179  7e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0317  hypothetical protein  40.54 
 
 
368 aa  178  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0349  hypothetical protein  40.54 
 
 
368 aa  177  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1410  T4 family peptidase  37.91 
 
 
325 aa  176  5e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568813  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1675  T4 family peptidase  37.91 
 
 
325 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135147  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2906  peptidase S58 DmpA  43.43 
 
 
336 aa  172  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0174879 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1669  peptidase S58, DmpA  42.27 
 
 
334 aa  166  6.9999999999999995e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0087  peptidase S58 DmpA  40.88 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11365  hydrolase  46.44 
 
 
344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003196  normal  0.48244 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2660  peptidase S58 DmpA  42.64 
 
 
322 aa  159  6e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0482  peptidase S58 DmpA  32.44 
 
 
316 aa  158  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000526803  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1962  peptidase S58 DmpA  42.18 
 
 
352 aa  156  4e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2605  peptidase S58, DmpA  42.64 
 
 
337 aa  155  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.47844 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1203  peptidase S58 DmpA  42.33 
 
 
337 aa  151  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.794666  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1804  peptidase S58, DmpA  38.68 
 
 
350 aa  149  7e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.374201 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1959  peptidase S58, DmpA  40.74 
 
 
306 aa  147  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0198  peptidase S58 DmpA  39.67 
 
 
287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2004  peptidase S58 DmpA  39.27 
 
 
334 aa  146  6e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00577301  hitchhiker  0.0000000124631 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1077  peptidase S58 DmpA  31.02 
 
 
328 aa  146  6e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.234138  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2221  peptidase S58 DmpA  34.55 
 
 
361 aa  146  6e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010872  hitchhiker  4.545e-18 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04100  L-aminopeptidase/D-esterase  43.31 
 
 
348 aa  145  9e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.037097 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2133  peptidase S58, DmpA  41.22 
 
 
301 aa  145  9e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.74532  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2319  peptidase S58 DmpA  42.77 
 
 
361 aa  142  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212071  decreased coverage  0.00000119169 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3246  peptidase S58, DmpA  35.01 
 
 
322 aa  136  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3087  peptidase S58 DmpA  40.21 
 
 
291 aa  129  7.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.145217 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2376  peptidase S58 DmpA  29.9 
 
 
282 aa  112  9e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.90605  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2264  peptidase S58 DmpA  38.39 
 
 
311 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1456  peptidase S58 DmpA  34.11 
 
 
300 aa  103  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.749732  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6005  peptidase S58, DmpA  31.63 
 
 
330 aa  87.4  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4346  peptidase S58 DmpA  49.57 
 
 
299 aa  57.4  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1007  peptidase S58, DmpA  50 
 
 
204 aa  53.9  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442944  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1923  aminopeptidase DmpA  31.1 
 
 
346 aa  52.8  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0136  aminopeptidase DmpA  29.1 
 
 
358 aa  52.8  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3840  hypothetical protein  27.88 
 
 
366 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3533  peptidase S58, DmpA  27.01 
 
 
372 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45210  hypothetical protein  27.88 
 
 
366 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152868  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0304  peptidase S58 DmpA  26.38 
 
 
345 aa  50.1  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3574  peptidase S58, DmpA  34.02 
 
 
360 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0115434  normal  0.141356 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2417  peptidase S58 DmpA  29.87 
 
 
365 aa  47  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1411  peptidase S58, DmpA  27.67 
 
 
352 aa  46.6  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.704657  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5586  aminopeptidase DmpA  28.34 
 
 
367 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.237816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5206  aminopeptidase DmpA  28.34 
 
 
367 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5294  aminopeptidase DmpA  28.34 
 
 
367 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.660356  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3974  peptidase S58 DmpA  27.27 
 
 
351 aa  45.8  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1200  peptidase S58 DmpA  32.52 
 
 
347 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3006  peptidase S58 DmpA  29.03 
 
 
350 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4055  peptidase S58 DmpA  29.79 
 
 
360 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4594  peptidase S58, DmpA  29.84 
 
 
354 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4222  peptidase S58 DmpA  32.69 
 
 
352 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6180  peptidase S58 DmpA  30.39 
 
 
375 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4423  peptidase S58 DmpA  34.54 
 
 
357 aa  43.9  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.405309  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0143  peptidase S58 DmpA  28.88 
 
 
352 aa  43.9  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0984939  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4200  peptidase S58, DmpA  33.51 
 
 
360 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381793  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4166  peptidase S58, DmpA  33.51 
 
 
360 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00735465 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3844  D-aminopeptidase putative  24.19 
 
 
377 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0605  peptidase S58 DmpA  28.18 
 
 
369 aa  42.7  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1684  aminopeptidase DmpA  28.62 
 
 
369 aa  42.7  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  0.901493 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>