123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3882 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3882  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  660    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.482216  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4493  peptidase S58 DmpA  73.48 
 
 		 331 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4203  peptidase S58 DmpA  73.17 
 
 		 331 aa  435  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4338  peptidase S58 DmpA  57.93 
 
 		 334 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2683  peptidase S58 DmpA  57.27 
 
 		 342 aa  330  1e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1488  peptidase S58 DmpA  60.75 
 
 		 335 aa  329  4e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0291995 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1773  peptidase S58, DmpA  55.35 
 
 		 331 aa  328  6e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.800376  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5330  hypothetical protein  56.53 
 
 		 332 aa  328  6e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12369  normal  0.395647 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1091  peptidase S58 DmpA  56.75 
 
 		 328 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3687  peptidase S58, DmpA  55.05 
 
 		 331 aa  322  8e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2617  peptidase S58, DmpA  56.1 
 
 		 332 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1616  peptidase S58, DmpA  54.27 
 
 		 332 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2215  peptidase S58, DmpA  54.27 
 
 		 332 aa  318  6e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4768  peptidase S58 DmpA  57.14 
 
 		 329 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4248  peptidase S58 DmpA  58.31 
 
 		 329 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0972  peptidase S58 DmpA  55.52 
 
 		 358 aa  311  6.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.898884  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2156  peptidase S58 DmpA  59.06 
 
 		 340 aa  311  9e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2093  peptidase S58 DmpA  56.13 
 
 		 363 aa  310  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201096  normal  0.024132 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4618  peptidase S58 DmpA  57.7 
 
 		 329 aa  309  5e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1287  peptidase S58, DmpA  56.16 
 
 		 335 aa  308  6.999999999999999e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0721739  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2889  putative peptidase  57.53 
 
 		 327 aa  306  3e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00143546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2667  peptidase S58, DmpA  54.93 
 
 		 340 aa  305  9.000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0772  peptidase S58, DmpA  56.6 
 
 		 356 aa  301  7.000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.904933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4121  peptidase S58 DmpA  55.26 
 
 		 353 aa  300  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246913  normal  0.677622 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0620  peptidase S58, DmpA  54.68 
 
 		 327 aa  283  3.0000000000000004e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.975766  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0311  peptidase S58 DmpA  50.14 
 
 		 345 aa  256  4e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4655  peptidase S58 DmpA  45.51 
 
 		 347 aa  227  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.505511 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2797  peptidase S58 DmpA  43.15 
 
 		 331 aa  217  2.9999999999999998e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3189  peptidase S58 DmpA  48.34 
 
 		 339 aa  214  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0463  peptidase S58, DmpA  46.63 
 
 		 331 aa  212  9e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2943  peptidase S58 DmpA  44.58 
 
 		 323 aa  182  7e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29210  L-aminopeptidase/D-esterase  42.39 
 
 		 345 aa  178  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3050  peptidase S58 DmpA  40.54 
 
 		 363 aa  176  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578156  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0349  hypothetical protein  40.5 
 
 		 368 aa  176  7e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3851  peptidase S58, DmpA  45.52 
 
 		 340 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3925  peptidase S58, DmpA  45.52 
 
 		 340 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3837  peptidase S58, DmpA  45.52 
 
 		 340 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.449487  normal  0.0858293 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0317  hypothetical protein  40.19 
 
 		 368 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3716  peptidase S58 DmpA  39.63 
 
 		 329 aa  166  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00511947 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2906  peptidase S58 DmpA  42.91 
 
 		 336 aa  165  8e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174879 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0482  peptidase S58 DmpA  38.08 
 
 		 316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000526803  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2351  peptidase S58, DmpA  44.64 
 
 		 340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1410  T4 family peptidase  37.23 
 
 		 325 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568813  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1675  T4 family peptidase  37.04 
 
 		 325 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135147  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3228  peptidase S58, DmpA  39.32 
 
 		 318 aa  161  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0087  peptidase S58 DmpA  40.07 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0168  peptidase S58 DmpA  35.74 
 
 		 319 aa  157  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1669  peptidase S58, DmpA  42.23 
 
 		 334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1077  peptidase S58 DmpA  33.95 
 
 		 328 aa  152  8.999999999999999e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.234138  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2221  peptidase S58 DmpA  36.44 
 
 		 361 aa  151  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010872  hitchhiker  4.545e-18 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3677  peptidase S58 DmpA  39.45 
 
 		 350 aa  149  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1959  peptidase S58, DmpA  39.62 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4294  peptidase S58, DmpA  44.56 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2605  peptidase S58, DmpA  37.81 
 
 		 337 aa  143  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.47844 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2945  peptidase S58, DmpA  37.54 
 
 		 349 aa  143  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1203  peptidase S58 DmpA  40.12 
 
 		 337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.794666  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2660  peptidase S58 DmpA  40.43 
 
 		 322 aa  139  8.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0198  peptidase S58 DmpA  40.21 
 
 		 287 aa  138  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11365  hydrolase  42.43 
 
 		 344 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003196  normal  0.48244 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04100  L-aminopeptidase/D-esterase  42.18 
 
 		 348 aa  135  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.037097 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3246  peptidase S58, DmpA  35.86 
 
 		 322 aa  132  7.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2319  peptidase S58 DmpA  37.33 
 
 		 361 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212071  decreased coverage  0.00000119169 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1962  peptidase S58 DmpA  39.1 
 
 		 352 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2004  peptidase S58 DmpA  37.15 
 
 		 334 aa  130  4.0000000000000003e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00577301  hitchhiker  0.0000000124631 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3087  peptidase S58 DmpA  37.59 
 
 		 291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.145217 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2133  peptidase S58, DmpA  35.99 
 
 		 301 aa  109  8.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.74532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4346  peptidase S58 DmpA  35.8 
 
 		 299 aa  106  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1456  peptidase S58 DmpA  36.99 
 
 		 300 aa  102  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.749732  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2376  peptidase S58 DmpA  28.97 
 
 		 282 aa  97.8  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.90605  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2264  peptidase S58 DmpA  35.93 
 
 		 311 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1804  peptidase S58, DmpA  41.61 
 
 		 350 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374201 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1108  putative D-aminopeptidase  31.37 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1022  putative D-aminopeptidase  31.37 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2326  peptidase  31.23 
 
 		 376 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45210  hypothetical protein  29.13 
 
 		 366 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3840  hypothetical protein  29.13 
 
 		 366 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0592  putative D-aminopeptidase  30.91 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0875  putative D-aminopeptidase  30.91 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1842  putative D-aminopeptidase  30.91 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1650  D-aminopeptidase, putative  29.97 
 
 		 407 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6005  peptidase S58, DmpA  27.33 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3533  peptidase S58, DmpA  29.49 
 
 		 372 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1411  peptidase S58, DmpA  30.4 
 
 		 352 aa  53.9  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.704657  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6180  peptidase S58 DmpA  28.67 
 
 		 375 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2448  aminopeptidase DmpA  27.15 
 
 		 489 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.357188  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2891  peptidase S58 DmpA  25.51 
 
 		 373 aa  52.4  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1411  peptidase S58 DmpA  26.85 
 
 		 489 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1507  peptidase S58 DmpA  26.93 
 
 		 489 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3844  D-aminopeptidase putative  26.9 
 
 		 377 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0605  peptidase S58 DmpA  29.17 
 
 		 369 aa  51.2  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4211  peptidase S58 DmpA  29.77 
 
 		 369 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.131306 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3006  peptidase S58 DmpA  27.54 
 
 		 350 aa  50.8  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3384  peptidase S58, DmpA  28.53 
 
 		 394 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266715 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0136  aminopeptidase DmpA  27.76 
 
 		 358 aa  50.4  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3141  peptidase S58, DmpA  30 
 
 		 393 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.478527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4222  peptidase S58 DmpA  28.67 
 
 		 352 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1684  aminopeptidase DmpA  30.1 
 
 		 369 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  0.901493 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1116  D-aminopeptidase, putative  32.32 
 
 		 446 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5206  aminopeptidase DmpA  26.3 
 
 		 367 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1661  aminopeptidase DmpA  31.96 
 
 		 354 aa  48.9  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>