78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3228 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3228  peptidase S58, DmpA  100 
 
 		 318 aa  622  1e-177  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3716  peptidase S58 DmpA  84.95 
 
 		 329 aa  529  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00511947 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2943  peptidase S58 DmpA  64.1 
 
 		 323 aa  359  4e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0168  peptidase S58 DmpA  52.85 
 
 		 319 aa  300  3e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3050  peptidase S58 DmpA  49.52 
 
 		 363 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578156  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0317  hypothetical protein  50.16 
 
 		 368 aa  265  7e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0349  hypothetical protein  50.16 
 
 		 368 aa  265  8.999999999999999e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1669  peptidase S58, DmpA  55.1 
 
 		 334 aa  261  8.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3677  peptidase S58 DmpA  53.48 
 
 		 350 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2906  peptidase S58 DmpA  54.11 
 
 		 336 aa  249  6e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174879 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1959  peptidase S58, DmpA  50 
 
 		 306 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1410  T4 family peptidase  43.85 
 
 		 325 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568813  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2797  peptidase S58 DmpA  46.57 
 
 		 331 aa  243  3e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1675  T4 family peptidase  43.53 
 
 		 325 aa  243  3e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135147  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2605  peptidase S58, DmpA  53.63 
 
 		 337 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.47844 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1203  peptidase S58 DmpA  51.25 
 
 		 337 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.794666  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1804  peptidase S58, DmpA  52.45 
 
 		 350 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374201 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1077  peptidase S58 DmpA  41.48 
 
 		 328 aa  232  6e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.234138  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0087  peptidase S58 DmpA  46.62 
 
 		 313 aa  231  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0482  peptidase S58 DmpA  44.04 
 
 		 316 aa  226  4e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000526803  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3246  peptidase S58, DmpA  46.33 
 
 		 322 aa  226  5.0000000000000005e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2221  peptidase S58 DmpA  41.74 
 
 		 361 aa  219  3.9999999999999997e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010872  hitchhiker  4.545e-18 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29210  L-aminopeptidase/D-esterase  49.84 
 
 		 345 aa  218  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2351  peptidase S58, DmpA  51.4 
 
 		 340 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4338  peptidase S58 DmpA  43.25 
 
 		 334 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2004  peptidase S58 DmpA  43.53 
 
 		 334 aa  202  7e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00577301  hitchhiker  0.0000000124631 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3837  peptidase S58, DmpA  48.11 
 
 		 340 aa  202  8e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.449487  normal  0.0858293 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3925  peptidase S58, DmpA  48.11 
 
 		 340 aa  202  8e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3851  peptidase S58, DmpA  48.11 
 
 		 340 aa  202  8e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4294  peptidase S58, DmpA  50.84 
 
 		 340 aa  200  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2093  peptidase S58 DmpA  45.94 
 
 		 363 aa  199  7e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201096  normal  0.024132 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0972  peptidase S58 DmpA  46.81 
 
 		 358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.898884  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2156  peptidase S58 DmpA  48.05 
 
 		 340 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0198  peptidase S58 DmpA  45.62 
 
 		 287 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2133  peptidase S58, DmpA  45.83 
 
 		 301 aa  189  4e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.74532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2617  peptidase S58, DmpA  46.6 
 
 		 332 aa  189  5e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1091  peptidase S58 DmpA  41.07 
 
 		 328 aa  188  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1616  peptidase S58, DmpA  42.64 
 
 		 332 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2683  peptidase S58 DmpA  40.85 
 
 		 342 aa  187  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5330  hypothetical protein  43.56 
 
 		 332 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12369  normal  0.395647 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1488  peptidase S58 DmpA  45.8 
 
 		 335 aa  187  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0291995 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0311  peptidase S58 DmpA  41 
 
 		 345 aa  186  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3087  peptidase S58 DmpA  47.65 
 
 		 291 aa  186  5e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.145217 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11365  hydrolase  49.66 
 
 		 344 aa  185  8e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003196  normal  0.48244 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2667  peptidase S58, DmpA  43.69 
 
 		 340 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2215  peptidase S58, DmpA  44.44 
 
 		 332 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4655  peptidase S58 DmpA  41.49 
 
 		 347 aa  182  6e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.505511 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4768  peptidase S58 DmpA  44.92 
 
 		 329 aa  182  6e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3687  peptidase S58, DmpA  41.98 
 
 		 331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4248  peptidase S58 DmpA  44.98 
 
 		 329 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4618  peptidase S58 DmpA  44.83 
 
 		 329 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4121  peptidase S58 DmpA  43.2 
 
 		 353 aa  178  8e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246913  normal  0.677622 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0772  peptidase S58, DmpA  44.38 
 
 		 356 aa  176  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.904933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1773  peptidase S58, DmpA  41.1 
 
 		 331 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.800376  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1287  peptidase S58, DmpA  43.25 
 
 		 335 aa  176  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0721739  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2945  peptidase S58, DmpA  43.71 
 
 		 349 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0620  peptidase S58, DmpA  43.69 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.975766  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04100  L-aminopeptidase/D-esterase  45.57 
 
 		 348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.037097 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0463  peptidase S58, DmpA  42.55 
 
 		 331 aa  163  5.0000000000000005e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2889  putative peptidase  42.35 
 
 		 327 aa  160  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00143546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3189  peptidase S58 DmpA  46.34 
 
 		 339 aa  160  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1962  peptidase S58 DmpA  42.86 
 
 		 352 aa  158  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2660  peptidase S58 DmpA  42.46 
 
 		 322 aa  150  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3882  hypothetical protein  37.85 
 
 		 333 aa  149  9e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.482216  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4203  peptidase S58 DmpA  38.24 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4493  peptidase S58 DmpA  37.62 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1456  peptidase S58 DmpA  44.29 
 
 		 300 aa  143  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.749732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2319  peptidase S58 DmpA  41.18 
 
 		 361 aa  142  8e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212071  decreased coverage  0.00000119169 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2376  peptidase S58 DmpA  32.86 
 
 		 282 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.90605  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6005  peptidase S58, DmpA  33.57 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2264  peptidase S58 DmpA  37.78 
 
 		 311 aa  94.7  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4346  peptidase S58 DmpA  37.27 
 
 		 299 aa  87.4  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1007  peptidase S58, DmpA  53.1 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442944  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3106  peptidase S58, DmpA  28.61 
 
 		 364 aa  47.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3533  peptidase S58, DmpA  27.33 
 
 		 372 aa  47  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0136  aminopeptidase DmpA  29.45 
 
 		 358 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1923  aminopeptidase DmpA  28.92 
 
 		 346 aa  44.3  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0605  peptidase S58 DmpA  27.56 
 
 		 369 aa  42.7  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>