134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1923 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1923  aminopeptidase DmpA  100 
 
 
346 aa  692    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1411  peptidase S58, DmpA  75.15 
 
 
352 aa  489  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.704657  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1322  peptidase S58 DmpA  73.16 
 
 
341 aa  479  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0281785  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1256  peptidase S58 DmpA  72.35 
 
 
341 aa  472  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0136  aminopeptidase DmpA  69.08 
 
 
358 aa  456  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1383  D-aminopeptidase protein  70.96 
 
 
341 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.306178  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3106  peptidase S58, DmpA  68.82 
 
 
364 aa  450  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4594  peptidase S58, DmpA  68.73 
 
 
354 aa  443  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1661  aminopeptidase DmpA  70.26 
 
 
354 aa  435  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4222  peptidase S58 DmpA  66.28 
 
 
352 aa  436  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3006  peptidase S58 DmpA  67.66 
 
 
350 aa  434  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0839  aminopeptidase DmpA  68.39 
 
 
364 aa  428  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0193478  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3240  peptidase S58 DmpA  68.13 
 
 
357 aa  423  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3127  peptidase S58 DmpA  65.63 
 
 
366 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4055  peptidase S58 DmpA  65.68 
 
 
360 aa  401  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1864  aminopeptidase DmpA  65.8 
 
 
360 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4200  peptidase S58, DmpA  65.99 
 
 
360 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381793  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4166  peptidase S58, DmpA  65.99 
 
 
360 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00735465 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4423  peptidase S58 DmpA  67.54 
 
 
357 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.405309  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3350  peptidase S58 DmpA  66.28 
 
 
360 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.013595  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3574  peptidase S58, DmpA  64.69 
 
 
360 aa  378  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0115434  normal  0.141356 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3561  peptidase S58 DmpA  53.61 
 
 
358 aa  331  1e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.949161  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0143  peptidase S58 DmpA  54.08 
 
 
352 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0984939  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4401  peptidase S58 DmpA  54.1 
 
 
360 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4112  peptidase S58 DmpA  54.1 
 
 
358 aa  325  6e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.971314  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3974  peptidase S58 DmpA  52.87 
 
 
351 aa  321  9.999999999999999e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0531  D-aminopeptidase, putative  53.08 
 
 
340 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0461  putative D-aminopeptidase  53.08 
 
 
340 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.509897  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1116  D-aminopeptidase, putative  51.72 
 
 
446 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0051  L-aminopeptidase/D-esterase  47.43 
 
 
369 aa  314  1.9999999999999998e-84  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1200  peptidase S58 DmpA  51.79 
 
 
347 aa  298  9e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0304  peptidase S58 DmpA  48.36 
 
 
345 aa  296  4e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3571  peptidase S58 DmpA  48.49 
 
 
372 aa  267  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985399  normal  0.76681 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0321  aminopeptidase DmpA  67.61 
 
 
442 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0398  L-aminopeptidase/D-esterase  67.61 
 
 
448 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.343359  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0242  D-aminopeptidase  67.61 
 
 
448 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.547192  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1764  aminopeptidase DmpA  67.61 
 
 
451 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1355  aminopeptidase DmpA  67.61 
 
 
448 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.275545  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1849  L-aminopeptidase/D-esterase  67.61 
 
 
442 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5170  peptidase S58 DmpA  48.2 
 
 
345 aa  263  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.935854  normal  0.481324 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2891  peptidase S58 DmpA  42.04 
 
 
373 aa  254  2.0000000000000002e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5706  peptidase S58 DmpA  46.22 
 
 
375 aa  246  4.9999999999999997e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1507  peptidase S58 DmpA  44.16 
 
 
489 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1411  peptidase S58 DmpA  44.16 
 
 
489 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2448  aminopeptidase DmpA  44.16 
 
 
489 aa  235  8e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.357188  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1419  peptidase S58 DmpA  42.82 
 
 
463 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2046  peptidase S58 DmpA  44.79 
 
 
376 aa  231  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173525  hitchhiker  0.00567247 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0995  aminopeptidase DmpA  44.02 
 
 
387 aa  225  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5913  aminopeptidase  45.23 
 
 
349 aa  224  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2417  peptidase S58 DmpA  45.91 
 
 
365 aa  224  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2559  peptidase S58 DmpA  45.18 
 
 
367 aa  222  7e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117376 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17440  L-aminopeptidase DmpA  45.09 
 
 
381 aa  219  7e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.558769  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3094  peptidase S58 DmpA  39.47 
 
 
352 aa  205  9e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0856606  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3656  aminopeptidase DmpA  43.25 
 
 
371 aa  204  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.950122  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1479  peptidase S58 DmpA  43.56 
 
 
318 aa  193  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3384  peptidase S58, DmpA  40.28 
 
 
394 aa  192  7e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.266715 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3141  peptidase S58, DmpA  40.95 
 
 
393 aa  191  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.478527  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6011  peptidase S58 DmpA  41.47 
 
 
373 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3844  D-aminopeptidase putative  40.71 
 
 
377 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3840  hypothetical protein  46.58 
 
 
366 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45210  hypothetical protein  46.58 
 
 
366 aa  186  6e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152868  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3533  peptidase S58, DmpA  40.59 
 
 
372 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0592  putative D-aminopeptidase  42.77 
 
 
376 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0875  putative D-aminopeptidase  42.77 
 
 
376 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1842  putative D-aminopeptidase  42.77 
 
 
376 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2806  peptidase S58 DmpA  39.18 
 
 
375 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2464  aminopeptidase  41.87 
 
 
348 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00184488  normal  0.106032 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6180  peptidase S58 DmpA  42.94 
 
 
375 aa  176  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0605  peptidase S58 DmpA  40.52 
 
 
369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5206  aminopeptidase DmpA  39.94 
 
 
367 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5294  aminopeptidase DmpA  39.94 
 
 
367 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.660356  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5586  aminopeptidase DmpA  39.94 
 
 
367 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.237816 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4288  peptidase S58 DmpA  43.42 
 
 
369 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.443184 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4211  peptidase S58 DmpA  41.44 
 
 
369 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.131306 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3737  peptidase S58, DmpA  41.16 
 
 
369 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0673701  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1684  aminopeptidase DmpA  40.83 
 
 
369 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  0.901493 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1108  putative D-aminopeptidase  42.77 
 
 
376 aa  165  9e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1022  putative D-aminopeptidase  42.77 
 
 
376 aa  165  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2326  peptidase  42.77 
 
 
376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3199  peptidase S58 DmpA  41.85 
 
 
369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448482  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4251  aminopeptidase DmpA  38.78 
 
 
372 aa  164  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4044  peptidase S58, DmpA  45.2 
 
 
369 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181806  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4322  peptidase S58, DmpA  45.2 
 
 
369 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.810072  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1650  D-aminopeptidase, putative  43.1 
 
 
407 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2592  peptidase S58 DmpA  42.86 
 
 
368 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.119043 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1047  aminopeptidase DmpA  37.03 
 
 
370 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0633499  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0772  peptidase S58, DmpA  29.94 
 
 
356 aa  60.8  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.904933  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1488  peptidase S58 DmpA  30.26 
 
 
335 aa  60.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0291995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0972  peptidase S58 DmpA  31.36 
 
 
358 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.898884  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2945  peptidase S58, DmpA  30.09 
 
 
349 aa  60.5  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2683  peptidase S58 DmpA  28.96 
 
 
342 aa  60.1  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2093  peptidase S58 DmpA  29.94 
 
 
363 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201096  normal  0.024132 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1287  peptidase S58, DmpA  30 
 
 
335 aa  57.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0721739  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0620  peptidase S58, DmpA  30.99 
 
 
327 aa  58.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.975766  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1773  peptidase S58, DmpA  29.04 
 
 
331 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.800376  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3716  peptidase S58 DmpA  30.23 
 
 
329 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00511947 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2943  peptidase S58 DmpA  30.29 
 
 
323 aa  54.7  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3851  peptidase S58, DmpA  30.26 
 
 
340 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3925  peptidase S58, DmpA  30.26 
 
 
340 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3837  peptidase S58, DmpA  30.26 
 
 
340 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.449487  normal  0.0858293 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>