110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3106 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3106  peptidase S58, DmpA  100 
 
 		 364 aa  734    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0136  aminopeptidase DmpA  83.24 
 
 		 358 aa  580  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4594  peptidase S58, DmpA  75.29 
 
 		 354 aa  516  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3006  peptidase S58 DmpA  76.19 
 
 		 350 aa  505  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1322  peptidase S58 DmpA  68.04 
 
 		 341 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0281785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1661  aminopeptidase DmpA  70.59 
 
 		 354 aa  448  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3240  peptidase S58 DmpA  70.93 
 
 		 357 aa  451  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1256  peptidase S58 DmpA  68.62 
 
 		 341 aa  451  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1383  D-aminopeptidase protein  67.64 
 
 		 341 aa  433  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.306178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1923  aminopeptidase DmpA  67.94 
 
 		 346 aa  432  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1411  peptidase S58, DmpA  66.47 
 
 		 352 aa  421  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.704657  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4222  peptidase S58 DmpA  61.52 
 
 		 352 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0839  aminopeptidase DmpA  63.51 
 
 		 364 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0193478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3127  peptidase S58 DmpA  62.86 
 
 		 366 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4055  peptidase S58 DmpA  62.72 
 
 		 360 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4200  peptidase S58, DmpA  62.94 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381793  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4166  peptidase S58, DmpA  62.94 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735465 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1864  aminopeptidase DmpA  63.61 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3574  peptidase S58, DmpA  62.61 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0115434  normal  0.141356 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3350  peptidase S58 DmpA  63.02 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.013595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4423  peptidase S58 DmpA  63.13 
 
 		 357 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.405309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0143  peptidase S58 DmpA  53.73 
 
 		 352 aa  312  3.9999999999999997e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0984939  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3561  peptidase S58 DmpA  50.74 
 
 		 358 aa  312  6.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.949161  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4112  peptidase S58 DmpA  52.49 
 
 		 358 aa  308  8e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.971314  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4401  peptidase S58 DmpA  53.92 
 
 		 360 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3974  peptidase S58 DmpA  52.84 
 
 		 351 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0531  D-aminopeptidase, putative  50.59 
 
 		 340 aa  302  6.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0461  putative D-aminopeptidase  50.59 
 
 		 340 aa  302  6.000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.509897  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0051  L-aminopeptidase/D-esterase  46.18 
 
 		 369 aa  300  3e-80  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1200  peptidase S58 DmpA  47.61 
 
 		 347 aa  287  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5170  peptidase S58 DmpA  48.7 
 
 		 345 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.935854  normal  0.481324 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0304  peptidase S58 DmpA  46.78 
 
 		 345 aa  278  9e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0321  aminopeptidase DmpA  64.95 
 
 		 442 aa  275  8e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0398  L-aminopeptidase/D-esterase  64.95 
 
 		 448 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.343359  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0242  D-aminopeptidase  64.95 
 
 		 448 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.547192  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1764  aminopeptidase DmpA  64.95 
 
 		 451 aa  275  8e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1355  aminopeptidase DmpA  64.95 
 
 		 448 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.275545  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1849  L-aminopeptidase/D-esterase  64.95 
 
 		 442 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1116  D-aminopeptidase, putative  64.81 
 
 		 446 aa  271  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3571  peptidase S58 DmpA  46.18 
 
 		 372 aa  256  4e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985399  normal  0.76681 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2891  peptidase S58 DmpA  38.54 
 
 		 373 aa  253  3e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5706  peptidase S58 DmpA  46.08 
 
 		 375 aa  242  7.999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2046  peptidase S58 DmpA  42.65 
 
 		 376 aa  230  4e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173525  hitchhiker  0.00567247 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5913  aminopeptidase  44.94 
 
 		 349 aa  229  5e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1507  peptidase S58 DmpA  42.05 
 
 		 489 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2448  aminopeptidase DmpA  42.05 
 
 		 489 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.357188  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1411  peptidase S58 DmpA  42.05 
 
 		 489 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2417  peptidase S58 DmpA  47.58 
 
 		 365 aa  226  6e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1419  peptidase S58 DmpA  40.5 
 
 		 463 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0995  aminopeptidase DmpA  43.73 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2559  peptidase S58 DmpA  43.96 
 
 		 367 aa  215  9e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117376 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3094  peptidase S58 DmpA  40.41 
 
 		 352 aa  209  5e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0856606  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17440  L-aminopeptidase DmpA  43.3 
 
 		 381 aa  209  6e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.558769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3656  aminopeptidase DmpA  44.11 
 
 		 371 aa  204  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.950122  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3844  D-aminopeptidase putative  40.8 
 
 		 377 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0592  putative D-aminopeptidase  45 
 
 		 376 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0875  putative D-aminopeptidase  45 
 
 		 376 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1842  putative D-aminopeptidase  45 
 
 		 376 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3533  peptidase S58, DmpA  39.94 
 
 		 372 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1108  putative D-aminopeptidase  44.71 
 
 		 376 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1022  putative D-aminopeptidase  44.71 
 
 		 376 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2326  peptidase  44.71 
 
 		 376 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1479  peptidase S58 DmpA  39.27 
 
 		 318 aa  182  8.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6011  peptidase S58 DmpA  40.55 
 
 		 373 aa  182  9.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5206  aminopeptidase DmpA  40.79 
 
 		 367 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5294  aminopeptidase DmpA  40.79 
 
 		 367 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.660356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5586  aminopeptidase DmpA  40.79 
 
 		 367 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.237816 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3141  peptidase S58, DmpA  39.24 
 
 		 393 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.478527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6180  peptidase S58 DmpA  40.8 
 
 		 375 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2464  aminopeptidase  40.06 
 
 		 348 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00184488  normal  0.106032 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1650  D-aminopeptidase, putative  42.9 
 
 		 407 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4251  aminopeptidase DmpA  39.12 
 
 		 372 aa  173  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45210  hypothetical protein  41.14 
 
 		 366 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3840  hypothetical protein  40.57 
 
 		 366 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0605  peptidase S58 DmpA  40.29 
 
 		 369 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2806  peptidase S58 DmpA  37.16 
 
 		 375 aa  170  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3384  peptidase S58, DmpA  37.57 
 
 		 394 aa  168  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266715 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3737  peptidase S58, DmpA  43.57 
 
 		 369 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0673701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3199  peptidase S58 DmpA  43.6 
 
 		 369 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4211  peptidase S58 DmpA  43.4 
 
 		 369 aa  159  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.131306 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4044  peptidase S58, DmpA  43.6 
 
 		 369 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181806  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4322  peptidase S58, DmpA  43.6 
 
 		 369 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.810072  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4288  peptidase S58 DmpA  42.24 
 
 		 369 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.443184 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1684  aminopeptidase DmpA  42.81 
 
 		 369 aa  155  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  0.901493 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1047  aminopeptidase DmpA  38.56 
 
 		 370 aa  149  7e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0633499  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2592  peptidase S58 DmpA  40.54 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119043 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2093  peptidase S58 DmpA  30.07 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201096  normal  0.024132 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1091  peptidase S58 DmpA  29.3 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2683  peptidase S58 DmpA  28.44 
 
 		 342 aa  55.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0972  peptidase S58 DmpA  30.94 
 
 		 358 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.898884  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3851  peptidase S58, DmpA  36.23 
 
 		 340 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3925  peptidase S58, DmpA  36.23 
 
 		 340 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3837  peptidase S58, DmpA  36.23 
 
 		 340 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.449487  normal  0.0858293 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08608  D-aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03710)  32.72 
 
 		 184 aa  50.1  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.344807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1773  peptidase S58, DmpA  27.9 
 
 		 331 aa  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.800376  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1287  peptidase S58, DmpA  31.77 
 
 		 335 aa  50.1  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0721739  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3050  peptidase S58 DmpA  27.52 
 
 		 363 aa  49.3  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578156  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4655  peptidase S58 DmpA  29.74 
 
 		 347 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.505511 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3228  peptidase S58, DmpA  28.79 
 
 		 318 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2156  peptidase S58 DmpA  29.5 
 
 		 340 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>