103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2592 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2592  peptidase S58 DmpA  100 
 
 		 368 aa  743    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119043 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45210  hypothetical protein  75.96 
 
 		 366 aa  545  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3840  hypothetical protein  75.68 
 
 		 366 aa  544  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3737  peptidase S58, DmpA  71.39 
 
 		 369 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0673701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6180  peptidase S58 DmpA  67.76 
 
 		 375 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0592  putative D-aminopeptidase  66.49 
 
 		 376 aa  454  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1684  aminopeptidase DmpA  71.12 
 
 		 369 aa  457  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  0.901493 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0875  putative D-aminopeptidase  66.49 
 
 		 376 aa  454  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1842  putative D-aminopeptidase  66.49 
 
 		 376 aa  454  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3199  peptidase S58 DmpA  71.12 
 
 		 369 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4211  peptidase S58 DmpA  71.12 
 
 		 369 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.131306 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3844  D-aminopeptidase putative  65.3 
 
 		 377 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4044  peptidase S58, DmpA  70.57 
 
 		 369 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181806  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4322  peptidase S58, DmpA  70.57 
 
 		 369 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.810072  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0605  peptidase S58 DmpA  69.02 
 
 		 369 aa  453  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4288  peptidase S58 DmpA  70.03 
 
 		 369 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.443184 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1108  putative D-aminopeptidase  67.3 
 
 		 376 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1022  putative D-aminopeptidase  67.3 
 
 		 376 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2326  peptidase  67.03 
 
 		 376 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3533  peptidase S58, DmpA  64.21 
 
 		 372 aa  430  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1650  D-aminopeptidase, putative  65.95 
 
 		 407 aa  430  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5206  aminopeptidase DmpA  52.83 
 
 		 367 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5294  aminopeptidase DmpA  52.83 
 
 		 367 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.660356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5586  aminopeptidase DmpA  52.83 
 
 		 367 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.237816 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3656  aminopeptidase DmpA  47.65 
 
 		 371 aa  290  3e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.950122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1047  aminopeptidase DmpA  46.61 
 
 		 370 aa  263  3e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0633499  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2806  peptidase S58 DmpA  44.5 
 
 		 375 aa  262  6.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6011  peptidase S58 DmpA  45.72 
 
 		 373 aa  259  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3384  peptidase S58, DmpA  43.38 
 
 		 394 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266715 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3141  peptidase S58, DmpA  44.33 
 
 		 393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.478527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4251  aminopeptidase DmpA  48.96 
 
 		 372 aa  251  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2448  aminopeptidase DmpA  45.8 
 
 		 489 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.357188  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1507  peptidase S58 DmpA  45.8 
 
 		 489 aa  248  9e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1419  peptidase S58 DmpA  44.13 
 
 		 463 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1411  peptidase S58 DmpA  45.8 
 
 		 489 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5706  peptidase S58 DmpA  43.77 
 
 		 375 aa  247  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3571  peptidase S58 DmpA  42.11 
 
 		 372 aa  239  4e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985399  normal  0.76681 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2046  peptidase S58 DmpA  40.77 
 
 		 376 aa  229  6e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173525  hitchhiker  0.00567247 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2417  peptidase S58 DmpA  44.22 
 
 		 365 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0995  aminopeptidase DmpA  42.58 
 
 		 387 aa  213  4.9999999999999996e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2891  peptidase S58 DmpA  36.61 
 
 		 373 aa  199  6e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2559  peptidase S58 DmpA  46.53 
 
 		 367 aa  198  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117376 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0304  peptidase S58 DmpA  38.4 
 
 		 345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3561  peptidase S58 DmpA  39.53 
 
 		 358 aa  193  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.949161  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2464  aminopeptidase  40.44 
 
 		 348 aa  192  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00184488  normal  0.106032 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17440  L-aminopeptidase DmpA  41.46 
 
 		 381 aa  192  8e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.558769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4200  peptidase S58, DmpA  42.9 
 
 		 360 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381793  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4166  peptidase S58, DmpA  42.9 
 
 		 360 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735465 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1411  peptidase S58, DmpA  44.55 
 
 		 352 aa  190  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.704657  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4055  peptidase S58 DmpA  42.03 
 
 		 360 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0051  L-aminopeptidase/D-esterase  35.29 
 
 		 369 aa  189  9e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0136  aminopeptidase DmpA  44.01 
 
 		 358 aa  188  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1661  aminopeptidase DmpA  43.3 
 
 		 354 aa  188  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3574  peptidase S58, DmpA  42.03 
 
 		 360 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0115434  normal  0.141356 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4594  peptidase S58, DmpA  44.1 
 
 		 354 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3350  peptidase S58 DmpA  42.6 
 
 		 360 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.013595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3006  peptidase S58 DmpA  43.98 
 
 		 350 aa  186  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1864  aminopeptidase DmpA  42.9 
 
 		 360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4222  peptidase S58 DmpA  38.59 
 
 		 352 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1200  peptidase S58 DmpA  38.79 
 
 		 347 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0839  aminopeptidase DmpA  41.86 
 
 		 364 aa  182  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0193478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3094  peptidase S58 DmpA  35.99 
 
 		 352 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0856606  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1923  aminopeptidase DmpA  42.01 
 
 		 346 aa  176  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4423  peptidase S58 DmpA  43.64 
 
 		 357 aa  176  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.405309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1256  peptidase S58 DmpA  41.92 
 
 		 341 aa  176  7e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1322  peptidase S58 DmpA  41.39 
 
 		 341 aa  176  8e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0281785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5913  aminopeptidase  39.64 
 
 		 349 aa  173  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0531  D-aminopeptidase, putative  40.24 
 
 		 340 aa  170  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4401  peptidase S58 DmpA  37.8 
 
 		 360 aa  169  7e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0461  putative D-aminopeptidase  40.59 
 
 		 340 aa  169  8e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.509897  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3240  peptidase S58 DmpA  42.64 
 
 		 357 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3127  peptidase S58 DmpA  40.06 
 
 		 366 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1383  D-aminopeptidase protein  41.4 
 
 		 341 aa  168  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.306178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3106  peptidase S58, DmpA  40.3 
 
 		 364 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1479  peptidase S58 DmpA  38.73 
 
 		 318 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4112  peptidase S58 DmpA  37.91 
 
 		 358 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.971314  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3974  peptidase S58 DmpA  38.51 
 
 		 351 aa  160  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5170  peptidase S58 DmpA  38.2 
 
 		 345 aa  160  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.935854  normal  0.481324 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0143  peptidase S58 DmpA  37.25 
 
 		 352 aa  155  7e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0984939  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0321  aminopeptidase DmpA  42.51 
 
 		 442 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0398  L-aminopeptidase/D-esterase  42.51 
 
 		 448 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.343359  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0242  D-aminopeptidase  42.51 
 
 		 448 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.547192  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1764  aminopeptidase DmpA  42.51 
 
 		 451 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1355  aminopeptidase DmpA  42.51 
 
 		 448 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.275545  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1849  L-aminopeptidase/D-esterase  42.51 
 
 		 442 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1116  D-aminopeptidase, putative  40.85 
 
 		 446 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08608  D-aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03710)  38.86 
 
 		 184 aa  89  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.344807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2797  peptidase S58 DmpA  31.13 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1488  peptidase S58 DmpA  28.17 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0291995 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0620  peptidase S58, DmpA  29.33 
 
 		 327 aa  52.8  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.975766  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3677  peptidase S58 DmpA  29.72 
 
 		 350 aa  52.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3851  peptidase S58, DmpA  36.3 
 
 		 340 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3925  peptidase S58, DmpA  36.3 
 
 		 340 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3837  peptidase S58, DmpA  36.3 
 
 		 340 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.449487  normal  0.0858293 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0463  peptidase S58, DmpA  29.49 
 
 		 331 aa  50.1  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2156  peptidase S58 DmpA  30.74 
 
 		 340 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0087  peptidase S58 DmpA  29.11 
 
 		 313 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2667  peptidase S58, DmpA  28.08 
 
 		 340 aa  47.8  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2889  putative peptidase  31.86 
 
 		 327 aa  48.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00143546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2945  peptidase S58, DmpA  29.83 
 
 		 349 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>