113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3851 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3851  peptidase S58, DmpA  100 
 
 
340 aa  651    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3925  peptidase S58, DmpA  100 
 
 
340 aa  651    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3837  peptidase S58, DmpA  100 
 
 
340 aa  651    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.449487  normal  0.0858293 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2351  peptidase S58, DmpA  81.42 
 
 
340 aa  502  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260537  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4294  peptidase S58, DmpA  82.89 
 
 
340 aa  497  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11365  hydrolase  74.19 
 
 
344 aa  413  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003196  normal  0.48244 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1962  peptidase S58 DmpA  55.01 
 
 
352 aa  274  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29210  L-aminopeptidase/D-esterase  56.47 
 
 
345 aa  272  6e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2945  peptidase S58, DmpA  51.34 
 
 
349 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2797  peptidase S58 DmpA  49.56 
 
 
331 aa  251  9.000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2943  peptidase S58 DmpA  46.22 
 
 
323 aa  233  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1488  peptidase S58 DmpA  52.8 
 
 
335 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0291995 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2660  peptidase S58 DmpA  51.36 
 
 
322 aa  227  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3716  peptidase S58 DmpA  46.84 
 
 
329 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00511947 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3050  peptidase S58 DmpA  42.69 
 
 
363 aa  211  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578156  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0168  peptidase S58 DmpA  39.15 
 
 
319 aa  209  5e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0772  peptidase S58, DmpA  46.9 
 
 
356 aa  208  9e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.904933  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2156  peptidase S58 DmpA  52.05 
 
 
340 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0972  peptidase S58 DmpA  46.7 
 
 
358 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.898884  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3677  peptidase S58 DmpA  46.84 
 
 
350 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2683  peptidase S58 DmpA  42.46 
 
 
342 aa  206  5e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4768  peptidase S58 DmpA  47.95 
 
 
329 aa  205  8e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49009  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3228  peptidase S58, DmpA  45.59 
 
 
318 aa  205  9e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2667  peptidase S58, DmpA  45.27 
 
 
340 aa  204  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0317  hypothetical protein  42.69 
 
 
368 aa  202  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0349  hypothetical protein  42.69 
 
 
368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1287  peptidase S58, DmpA  47.4 
 
 
335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0721739  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1091  peptidase S58 DmpA  42.73 
 
 
328 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2906  peptidase S58 DmpA  49.15 
 
 
336 aa  200  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0174879 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1669  peptidase S58, DmpA  45.08 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2889  putative peptidase  47.37 
 
 
327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00143546  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2093  peptidase S58 DmpA  46.55 
 
 
363 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201096  normal  0.024132 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0311  peptidase S58 DmpA  45.35 
 
 
345 aa  196  5.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4248  peptidase S58 DmpA  47.66 
 
 
329 aa  194  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0836973  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5330  hypothetical protein  43.34 
 
 
332 aa  193  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12369  normal  0.395647 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4338  peptidase S58 DmpA  40.86 
 
 
334 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1616  peptidase S58, DmpA  41.21 
 
 
332 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108778  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4618  peptidase S58 DmpA  46.65 
 
 
329 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4655  peptidase S58 DmpA  44.48 
 
 
347 aa  189  5.999999999999999e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.505511 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1773  peptidase S58, DmpA  40.4 
 
 
331 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.800376  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2215  peptidase S58, DmpA  42.45 
 
 
332 aa  186  5e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2617  peptidase S58, DmpA  43.87 
 
 
332 aa  186  6e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1959  peptidase S58, DmpA  44.58 
 
 
306 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2605  peptidase S58, DmpA  41.67 
 
 
337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.47844 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1203  peptidase S58 DmpA  41.39 
 
 
337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.794666  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04100  L-aminopeptidase/D-esterase  48.51 
 
 
348 aa  182  6e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.037097 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1675  T4 family peptidase  35.55 
 
 
325 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135147  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4121  peptidase S58 DmpA  46.08 
 
 
353 aa  182  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246913  normal  0.677622 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0463  peptidase S58, DmpA  46.82 
 
 
331 aa  181  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0482  peptidase S58 DmpA  38.89 
 
 
316 aa  181  2e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000526803  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3687  peptidase S58, DmpA  40.29 
 
 
331 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0620  peptidase S58, DmpA  45.59 
 
 
327 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.975766  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1410  T4 family peptidase  35.17 
 
 
325 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568813  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3189  peptidase S58 DmpA  45.83 
 
 
339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1804  peptidase S58, DmpA  43.53 
 
 
350 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.374201 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2221  peptidase S58 DmpA  34.74 
 
 
361 aa  172  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010872  hitchhiker  4.545e-18 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0198  peptidase S58 DmpA  45.45 
 
 
287 aa  169  8e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1077  peptidase S58 DmpA  32.67 
 
 
328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.234138  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0087  peptidase S58 DmpA  40.06 
 
 
313 aa  162  9e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3246  peptidase S58, DmpA  41.58 
 
 
322 aa  158  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3882  hypothetical protein  45.52 
 
 
333 aa  158  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.482216  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4203  peptidase S58 DmpA  41.67 
 
 
331 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4493  peptidase S58 DmpA  40.52 
 
 
331 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2319  peptidase S58 DmpA  41.73 
 
 
361 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212071  decreased coverage  0.00000119169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1456  peptidase S58 DmpA  39.65 
 
 
300 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.749732  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3087  peptidase S58 DmpA  38.72 
 
 
291 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.145217 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2004  peptidase S58 DmpA  39.45 
 
 
334 aa  140  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00577301  hitchhiker  0.0000000124631 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2264  peptidase S58 DmpA  40.46 
 
 
311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2133  peptidase S58, DmpA  42.86 
 
 
301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.74532  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2376  peptidase S58 DmpA  34.33 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.90605  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4346  peptidase S58 DmpA  60 
 
 
299 aa  99  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6005  peptidase S58, DmpA  31.47 
 
 
330 aa  75.5  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0304  peptidase S58 DmpA  27.06 
 
 
345 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3656  aminopeptidase DmpA  28.94 
 
 
371 aa  60.1  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.950122  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3840  hypothetical protein  31.21 
 
 
366 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45210  hypothetical protein  31.61 
 
 
366 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152868  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3006  peptidase S58 DmpA  35.83 
 
 
350 aa  57  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0605  peptidase S58 DmpA  29.13 
 
 
369 aa  56.6  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3533  peptidase S58, DmpA  30.94 
 
 
372 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1007  peptidase S58, DmpA  48.89 
 
 
204 aa  56.2  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442944  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1200  peptidase S58 DmpA  31.4 
 
 
347 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1411  peptidase S58, DmpA  37.43 
 
 
352 aa  53.5  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.704657  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1923  aminopeptidase DmpA  29.23 
 
 
346 aa  52.8  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6180  peptidase S58 DmpA  28.62 
 
 
375 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3106  peptidase S58, DmpA  32.14 
 
 
364 aa  51.2  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4594  peptidase S58, DmpA  35.23 
 
 
354 aa  50.8  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2806  peptidase S58 DmpA  29.65 
 
 
375 aa  50.8  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3240  peptidase S58 DmpA  33.18 
 
 
357 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2559  peptidase S58 DmpA  28.71 
 
 
367 aa  50.4  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117376 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0839  aminopeptidase DmpA  36.03 
 
 
364 aa  49.7  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0193478  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0592  putative D-aminopeptidase  33.33 
 
 
376 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0136  aminopeptidase DmpA  35.77 
 
 
358 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0875  putative D-aminopeptidase  33.33 
 
 
376 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1842  putative D-aminopeptidase  33.33 
 
 
376 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3844  D-aminopeptidase putative  31.16 
 
 
377 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2326  peptidase  37.2 
 
 
376 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1108  putative D-aminopeptidase  37.2 
 
 
376 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1022  putative D-aminopeptidase  37.2 
 
 
376 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4222  peptidase S58 DmpA  34.35 
 
 
352 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3384  peptidase S58, DmpA  31.02 
 
 
394 aa  47  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.266715 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>