95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2264 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2264  peptidase S58 DmpA  100 
 
 
311 aa  572  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2945  peptidase S58, DmpA  43.92 
 
 
349 aa  188  9e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29210  L-aminopeptidase/D-esterase  43.8 
 
 
345 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2797  peptidase S58 DmpA  41.62 
 
 
331 aa  162  7e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2660  peptidase S58 DmpA  43.56 
 
 
322 aa  161  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3837  peptidase S58, DmpA  44.52 
 
 
340 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.449487  normal  0.0858293 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3925  peptidase S58, DmpA  44.52 
 
 
340 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3851  peptidase S58, DmpA  44.52 
 
 
340 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2351  peptidase S58, DmpA  45.61 
 
 
340 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260537  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0168  peptidase S58 DmpA  35.58 
 
 
319 aa  150  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2943  peptidase S58 DmpA  43.09 
 
 
323 aa  145  6e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4294  peptidase S58, DmpA  45.61 
 
 
340 aa  143  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0349  hypothetical protein  38.24 
 
 
368 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3050  peptidase S58 DmpA  36.58 
 
 
363 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578156  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0317  hypothetical protein  37.94 
 
 
368 aa  139  4.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11365  hydrolase  44.98 
 
 
344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003196  normal  0.48244 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1488  peptidase S58 DmpA  39.44 
 
 
335 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0291995 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2683  peptidase S58 DmpA  38.58 
 
 
342 aa  134  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1287  peptidase S58, DmpA  39.93 
 
 
335 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0721739  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4121  peptidase S58 DmpA  38.53 
 
 
353 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246913  normal  0.677622 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3677  peptidase S58 DmpA  40.92 
 
 
350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04100  L-aminopeptidase/D-esterase  45.02 
 
 
348 aa  130  3e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.037097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3716  peptidase S58 DmpA  42.03 
 
 
329 aa  129  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00511947 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1962  peptidase S58 DmpA  41.14 
 
 
352 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0972  peptidase S58 DmpA  40.71 
 
 
358 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.898884  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2319  peptidase S58 DmpA  38.78 
 
 
361 aa  127  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212071  decreased coverage  0.00000119169 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1773  peptidase S58, DmpA  36.72 
 
 
331 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.800376  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3228  peptidase S58, DmpA  38.78 
 
 
318 aa  126  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4338  peptidase S58 DmpA  37.66 
 
 
334 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2093  peptidase S58 DmpA  39.7 
 
 
363 aa  124  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201096  normal  0.024132 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0482  peptidase S58 DmpA  32.8 
 
 
316 aa  124  3e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000526803  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1091  peptidase S58 DmpA  37.27 
 
 
328 aa  123  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2156  peptidase S58 DmpA  43.51 
 
 
340 aa  122  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1616  peptidase S58, DmpA  37.98 
 
 
332 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108778  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4655  peptidase S58 DmpA  35.19 
 
 
347 aa  119  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.505511 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1410  T4 family peptidase  32.21 
 
 
325 aa  119  7e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568813  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1669  peptidase S58, DmpA  40.97 
 
 
334 aa  119  7.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3687  peptidase S58, DmpA  36.2 
 
 
331 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0311  peptidase S58 DmpA  39.2 
 
 
345 aa  118  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4768  peptidase S58 DmpA  41.12 
 
 
329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49009  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1675  T4 family peptidase  31.69 
 
 
325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135147  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1077  peptidase S58 DmpA  31.31 
 
 
328 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.234138  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2617  peptidase S58, DmpA  38.87 
 
 
332 aa  116  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4248  peptidase S58 DmpA  41.55 
 
 
329 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0836973  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5330  hypothetical protein  37.54 
 
 
332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12369  normal  0.395647 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3189  peptidase S58 DmpA  38.39 
 
 
339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2906  peptidase S58 DmpA  40.06 
 
 
336 aa  114  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0174879 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0620  peptidase S58, DmpA  39.88 
 
 
327 aa  113  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.975766  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2605  peptidase S58, DmpA  41.1 
 
 
337 aa  112  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.47844 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4618  peptidase S58 DmpA  41.22 
 
 
329 aa  112  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2889  putative peptidase  37.82 
 
 
327 aa  112  9e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00143546  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2667  peptidase S58, DmpA  36.28 
 
 
340 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1959  peptidase S58, DmpA  39.47 
 
 
306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1203  peptidase S58 DmpA  41.39 
 
 
337 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.794666  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2215  peptidase S58, DmpA  36.5 
 
 
332 aa  108  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4346  peptidase S58 DmpA  39.87 
 
 
299 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0772  peptidase S58, DmpA  36.42 
 
 
356 aa  106  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.904933  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0463  peptidase S58, DmpA  36.81 
 
 
331 aa  106  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4203  peptidase S58 DmpA  37.87 
 
 
331 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2004  peptidase S58 DmpA  35.91 
 
 
334 aa  102  7e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00577301  hitchhiker  0.0000000124631 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0087  peptidase S58 DmpA  37.28 
 
 
313 aa  102  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3246  peptidase S58, DmpA  36.79 
 
 
322 aa  102  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4493  peptidase S58 DmpA  34.2 
 
 
331 aa  99  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3882  hypothetical protein  36.23 
 
 
333 aa  97.4  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.482216  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1804  peptidase S58, DmpA  35.12 
 
 
350 aa  95.9  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.374201 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0198  peptidase S58 DmpA  36.93 
 
 
287 aa  91.3  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2221  peptidase S58 DmpA  29.28 
 
 
361 aa  89.4  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010872  hitchhiker  4.545e-18 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2133  peptidase S58, DmpA  38.18 
 
 
301 aa  86.3  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.74532  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1456  peptidase S58 DmpA  34.08 
 
 
300 aa  75.5  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.749732  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3087  peptidase S58 DmpA  36.43 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.145217 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2376  peptidase S58 DmpA  27.82 
 
 
282 aa  68.9  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.90605  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0531  D-aminopeptidase, putative  33.09 
 
 
340 aa  62  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0461  putative D-aminopeptidase  33.45 
 
 
340 aa  61.6  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.509897  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3561  peptidase S58 DmpA  32.34 
 
 
358 aa  57  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.949161  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1411  peptidase S58, DmpA  30.88 
 
 
352 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.704657  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2417  peptidase S58 DmpA  29.55 
 
 
365 aa  52.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2046  peptidase S58 DmpA  35.71 
 
 
376 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173525  hitchhiker  0.00567247 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1200  peptidase S58 DmpA  27.41 
 
 
347 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4594  peptidase S58, DmpA  31.32 
 
 
354 aa  49.7  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3656  aminopeptidase DmpA  29.57 
 
 
371 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.950122  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1923  aminopeptidase DmpA  30.93 
 
 
346 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0304  peptidase S58 DmpA  25.82 
 
 
345 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1661  aminopeptidase DmpA  31.07 
 
 
354 aa  48.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6005  peptidase S58, DmpA  30.69 
 
 
330 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0143  peptidase S58 DmpA  34.97 
 
 
352 aa  47.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0984939  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0136  aminopeptidase DmpA  29.38 
 
 
358 aa  46.2  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5706  peptidase S58 DmpA  28.53 
 
 
375 aa  45.8  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2448  aminopeptidase DmpA  30.12 
 
 
489 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.357188  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1507  peptidase S58 DmpA  30.12 
 
 
489 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5913  aminopeptidase  36.9 
 
 
349 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1411  peptidase S58 DmpA  30.12 
 
 
489 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3974  peptidase S58 DmpA  30.25 
 
 
351 aa  44.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2891  peptidase S58 DmpA  28.66 
 
 
373 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3571  peptidase S58 DmpA  33.83 
 
 
372 aa  43.5  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985399  normal  0.76681 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3840  hypothetical protein  29.66 
 
 
366 aa  42.4  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>