91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0349 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0349  hypothetical protein  100 
 
 		 368 aa  737    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3050  peptidase S58 DmpA  89.47 
 
 		 363 aa  646    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578156  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0317  hypothetical protein  99.73 
 
 		 368 aa  736    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3677  peptidase S58 DmpA  53.61 
 
 		 350 aa  313  3.9999999999999997e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2906  peptidase S58 DmpA  55.52 
 
 		 336 aa  308  8e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174879 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1410  T4 family peptidase  50.61 
 
 		 325 aa  303  3.0000000000000004e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568813  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1669  peptidase S58, DmpA  55.56 
 
 		 334 aa  302  6.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1675  T4 family peptidase  50.93 
 
 		 325 aa  302  8.000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135147  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0168  peptidase S58 DmpA  52.04 
 
 		 319 aa  301  1e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2605  peptidase S58, DmpA  55.49 
 
 		 337 aa  301  1e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.47844 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1203  peptidase S58 DmpA  55.49 
 
 		 337 aa  299  7e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.794666  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3716  peptidase S58 DmpA  52.52 
 
 		 329 aa  276  5e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00511947 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0482  peptidase S58 DmpA  51.41 
 
 		 316 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000526803  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1077  peptidase S58 DmpA  46.03 
 
 		 328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.234138  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1804  peptidase S58, DmpA  51.5 
 
 		 350 aa  269  5.9999999999999995e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374201 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2943  peptidase S58 DmpA  50.77 
 
 		 323 aa  268  1e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3228  peptidase S58, DmpA  50 
 
 		 318 aa  263  3e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2797  peptidase S58 DmpA  47.31 
 
 		 331 aa  261  2e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1959  peptidase S58, DmpA  49.67 
 
 		 306 aa  250  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0087  peptidase S58 DmpA  47.91 
 
 		 313 aa  251  2e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3246  peptidase S58, DmpA  45.68 
 
 		 322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2221  peptidase S58 DmpA  41.16 
 
 		 361 aa  241  2e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010872  hitchhiker  4.545e-18 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2004  peptidase S58 DmpA  41.45 
 
 		 334 aa  211  1e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00577301  hitchhiker  0.0000000124631 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4294  peptidase S58, DmpA  47.44 
 
 		 340 aa  206  5e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29210  L-aminopeptidase/D-esterase  41.64 
 
 		 345 aa  204  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2093  peptidase S58 DmpA  42.86 
 
 		 363 aa  203  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201096  normal  0.024132 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2351  peptidase S58, DmpA  44 
 
 		 340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4768  peptidase S58 DmpA  44.01 
 
 		 329 aa  200  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2683  peptidase S58 DmpA  42.09 
 
 		 342 aa  199  7e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0972  peptidase S58 DmpA  43.45 
 
 		 358 aa  197  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.898884  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2945  peptidase S58, DmpA  40.77 
 
 		 349 aa  195  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1287  peptidase S58, DmpA  47.02 
 
 		 335 aa  194  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0721739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3925  peptidase S58, DmpA  44.71 
 
 		 340 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4248  peptidase S58 DmpA  42.9 
 
 		 329 aa  192  5e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3837  peptidase S58, DmpA  44.71 
 
 		 340 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.449487  normal  0.0858293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3851  peptidase S58, DmpA  44.71 
 
 		 340 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4618  peptidase S58 DmpA  42.9 
 
 		 329 aa  192  7e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2133  peptidase S58, DmpA  41.48 
 
 		 301 aa  188  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.74532  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0198  peptidase S58 DmpA  41.86 
 
 		 287 aa  187  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2660  peptidase S58 DmpA  42.15 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11365  hydrolase  41.71 
 
 		 344 aa  184  3e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003196  normal  0.48244 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4338  peptidase S58 DmpA  37.91 
 
 		 334 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3687  peptidase S58, DmpA  40.77 
 
 		 331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1488  peptidase S58 DmpA  45.33 
 
 		 335 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0291995 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2156  peptidase S58 DmpA  42.81 
 
 		 340 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4655  peptidase S58 DmpA  40 
 
 		 347 aa  176  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.505511 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1773  peptidase S58, DmpA  39.88 
 
 		 331 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.800376  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0772  peptidase S58, DmpA  40.76 
 
 		 356 aa  174  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.904933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2667  peptidase S58, DmpA  39.31 
 
 		 340 aa  172  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2617  peptidase S58, DmpA  37.17 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0311  peptidase S58 DmpA  39.94 
 
 		 345 aa  170  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1962  peptidase S58 DmpA  41.95 
 
 		 352 aa  169  9e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1616  peptidase S58, DmpA  37.76 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2215  peptidase S58, DmpA  38.48 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3087  peptidase S58 DmpA  40.5 
 
 		 291 aa  166  8e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.145217 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1091  peptidase S58 DmpA  37.73 
 
 		 328 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1456  peptidase S58 DmpA  43.71 
 
 		 300 aa  162  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.749732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2889  putative peptidase  41.44 
 
 		 327 aa  162  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00143546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4121  peptidase S58 DmpA  39.02 
 
 		 353 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246913  normal  0.677622 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5330  hypothetical protein  37.17 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12369  normal  0.395647 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3882  hypothetical protein  38.63 
 
 		 333 aa  159  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.482216  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0620  peptidase S58, DmpA  40.24 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.975766  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4493  peptidase S58 DmpA  39.18 
 
 		 331 aa  156  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4203  peptidase S58 DmpA  39.56 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2319  peptidase S58 DmpA  38.51 
 
 		 361 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212071  decreased coverage  0.00000119169 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3189  peptidase S58 DmpA  40.72 
 
 		 339 aa  145  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0463  peptidase S58, DmpA  41.03 
 
 		 331 aa  142  9e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04100  L-aminopeptidase/D-esterase  39.38 
 
 		 348 aa  139  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.037097 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2376  peptidase S58 DmpA  32.26 
 
 		 282 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.90605  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6005  peptidase S58, DmpA  33.02 
 
 		 330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2264  peptidase S58 DmpA  37.17 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4346  peptidase S58 DmpA  54.17 
 
 		 299 aa  87.4  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1007  peptidase S58, DmpA  46.61 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442944  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4594  peptidase S58, DmpA  28.52 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2021  hypothetical protein  42.62 
 
 		 62 aa  56.6  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2046  peptidase S58 DmpA  26.42 
 
 		 376 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173525  hitchhiker  0.00567247 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3974  peptidase S58 DmpA  26.52 
 
 		 351 aa  49.7  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0304  peptidase S58 DmpA  28.15 
 
 		 345 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3384  peptidase S58, DmpA  30.87 
 
 		 394 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266715 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3106  peptidase S58, DmpA  26.49 
 
 		 364 aa  47  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3840  hypothetical protein  27.01 
 
 		 366 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45210  hypothetical protein  27.01 
 
 		 366 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4401  peptidase S58 DmpA  27.62 
 
 		 360 aa  46.2  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4112  peptidase S58 DmpA  25.9 
 
 		 358 aa  46.2  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.971314  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0143  peptidase S58 DmpA  25.38 
 
 		 352 aa  45.4  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0984939  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3561  peptidase S58 DmpA  23.58 
 
 		 358 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.949161  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1923  aminopeptidase DmpA  27.87 
 
 		 346 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3006  peptidase S58 DmpA  25.32 
 
 		 350 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0136  aminopeptidase DmpA  30.95 
 
 		 358 aa  44.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3141  peptidase S58, DmpA  28.52 
 
 		 393 aa  43.1  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.478527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1661  aminopeptidase DmpA  26.3 
 
 		 354 aa  42.7  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>