74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2004 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2004  peptidase S58 DmpA  100 
 
 
334 aa  658    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00577301  hitchhiker  0.0000000124631 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1675  T4 family peptidase  41.46 
 
 
325 aa  243  3e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135147  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1410  T4 family peptidase  40.85 
 
 
325 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568813  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1077  peptidase S58 DmpA  40.3 
 
 
328 aa  242  7.999999999999999e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.234138  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2943  peptidase S58 DmpA  46.9 
 
 
323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0482  peptidase S58 DmpA  41.69 
 
 
316 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000526803  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2221  peptidase S58 DmpA  39.61 
 
 
361 aa  230  3e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010872  hitchhiker  4.545e-18 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0168  peptidase S58 DmpA  40.06 
 
 
319 aa  227  2e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0349  hypothetical protein  43.24 
 
 
368 aa  223  3e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0317  hypothetical protein  42.94 
 
 
368 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3716  peptidase S58 DmpA  45.02 
 
 
329 aa  218  8.999999999999998e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00511947 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3228  peptidase S58, DmpA  45.6 
 
 
318 aa  218  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3677  peptidase S58 DmpA  45 
 
 
350 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3050  peptidase S58 DmpA  41.89 
 
 
363 aa  215  9e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578156  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2906  peptidase S58 DmpA  45 
 
 
336 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0174879 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1959  peptidase S58, DmpA  46.27 
 
 
306 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1669  peptidase S58, DmpA  44.67 
 
 
334 aa  205  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0087  peptidase S58 DmpA  40.51 
 
 
313 aa  195  7e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2605  peptidase S58, DmpA  44.21 
 
 
337 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.47844 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1203  peptidase S58 DmpA  44.51 
 
 
337 aa  192  7e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.794666  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2797  peptidase S58 DmpA  41.42 
 
 
331 aa  188  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3246  peptidase S58, DmpA  38.24 
 
 
322 aa  179  5.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0972  peptidase S58 DmpA  43.92 
 
 
358 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.898884  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2093  peptidase S58 DmpA  44.59 
 
 
363 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201096  normal  0.024132 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0198  peptidase S58 DmpA  42.63 
 
 
287 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1804  peptidase S58, DmpA  42.44 
 
 
350 aa  169  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.374201 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4768  peptidase S58 DmpA  42 
 
 
329 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49009  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4248  peptidase S58 DmpA  42.9 
 
 
329 aa  166  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0836973  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0772  peptidase S58, DmpA  42.12 
 
 
356 aa  165  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.904933  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2667  peptidase S58, DmpA  39.71 
 
 
340 aa  162  8.000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2156  peptidase S58 DmpA  43.43 
 
 
340 aa  162  9e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4618  peptidase S58 DmpA  41.53 
 
 
329 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3851  peptidase S58, DmpA  39.89 
 
 
340 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3925  peptidase S58, DmpA  39.89 
 
 
340 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3837  peptidase S58, DmpA  39.89 
 
 
340 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.449487  normal  0.0858293 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2133  peptidase S58, DmpA  38.08 
 
 
301 aa  151  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.74532  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1488  peptidase S58 DmpA  39.33 
 
 
335 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0291995 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2351  peptidase S58, DmpA  39.45 
 
 
340 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260537  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1287  peptidase S58, DmpA  38.89 
 
 
335 aa  149  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0721739  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2889  putative peptidase  39 
 
 
327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00143546  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2945  peptidase S58, DmpA  38.06 
 
 
349 aa  146  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04100  L-aminopeptidase/D-esterase  41.45 
 
 
348 aa  143  5e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.037097 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3087  peptidase S58 DmpA  36.24 
 
 
291 aa  143  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.145217 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2683  peptidase S58 DmpA  36.04 
 
 
342 aa  142  6e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4338  peptidase S58 DmpA  34.26 
 
 
334 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1456  peptidase S58 DmpA  43.28 
 
 
300 aa  142  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.749732  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29210  L-aminopeptidase/D-esterase  36.86 
 
 
345 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4294  peptidase S58, DmpA  41.73 
 
 
340 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5330  hypothetical protein  35.69 
 
 
332 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12369  normal  0.395647 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0311  peptidase S58 DmpA  40.8 
 
 
345 aa  140  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0620  peptidase S58, DmpA  38.38 
 
 
327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.975766  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1616  peptidase S58, DmpA  35.86 
 
 
332 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108778  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2617  peptidase S58, DmpA  36.2 
 
 
332 aa  136  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2215  peptidase S58, DmpA  35 
 
 
332 aa  136  5e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1962  peptidase S58 DmpA  37.59 
 
 
352 aa  134  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2376  peptidase S58 DmpA  30.64 
 
 
282 aa  133  3e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.90605  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4121  peptidase S58 DmpA  37.31 
 
 
353 aa  132  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246913  normal  0.677622 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2660  peptidase S58 DmpA  36.76 
 
 
322 aa  130  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3882  hypothetical protein  36.78 
 
 
333 aa  130  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.482216  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4655  peptidase S58 DmpA  34.11 
 
 
347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.505511 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1773  peptidase S58, DmpA  35.1 
 
 
331 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.800376  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3687  peptidase S58, DmpA  34.88 
 
 
331 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11365  hydrolase  40.96 
 
 
344 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003196  normal  0.48244 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1091  peptidase S58 DmpA  33.85 
 
 
328 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4493  peptidase S58 DmpA  37.12 
 
 
331 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4203  peptidase S58 DmpA  36.5 
 
 
331 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0463  peptidase S58, DmpA  37.91 
 
 
331 aa  119  7.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3189  peptidase S58 DmpA  39.61 
 
 
339 aa  116  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2319  peptidase S58 DmpA  59.81 
 
 
361 aa  106  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212071  decreased coverage  0.00000119169 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6005  peptidase S58, DmpA  32.8 
 
 
330 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2264  peptidase S58 DmpA  35.91 
 
 
311 aa  89.7  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2021  hypothetical protein  43.33 
 
 
62 aa  61.6  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4346  peptidase S58 DmpA  48.21 
 
 
299 aa  60.1  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1007  peptidase S58, DmpA  45.95 
 
 
204 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>