117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2945 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2945  peptidase S58, DmpA  100 
 
 
349 aa  685    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2660  peptidase S58 DmpA  71.26 
 
 
322 aa  414  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3851  peptidase S58, DmpA  54.08 
 
 
340 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3925  peptidase S58, DmpA  54.08 
 
 
340 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3837  peptidase S58, DmpA  54.08 
 
 
340 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.449487  normal  0.0858293 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04100  L-aminopeptidase/D-esterase  56.35 
 
 
348 aa  248  1e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.037097 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2351  peptidase S58, DmpA  54.21 
 
 
340 aa  236  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260537  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4294  peptidase S58, DmpA  54.58 
 
 
340 aa  233  5e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4346  peptidase S58 DmpA  59.16 
 
 
299 aa  224  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29210  L-aminopeptidase/D-esterase  46.11 
 
 
345 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11365  hydrolase  49.16 
 
 
344 aa  211  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003196  normal  0.48244 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0168  peptidase S58 DmpA  42.3 
 
 
319 aa  206  4e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2943  peptidase S58 DmpA  46.53 
 
 
323 aa  203  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0317  hypothetical protein  40.77 
 
 
368 aa  202  8e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0349  hypothetical protein  40.77 
 
 
368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3050  peptidase S58 DmpA  39.76 
 
 
363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578156  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2797  peptidase S58 DmpA  41.81 
 
 
331 aa  200  3e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3677  peptidase S58 DmpA  45.99 
 
 
350 aa  199  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3716  peptidase S58 DmpA  45.83 
 
 
329 aa  190  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00511947 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1488  peptidase S58 DmpA  43.93 
 
 
335 aa  186  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0291995 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2906  peptidase S58 DmpA  42.69 
 
 
336 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0174879 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1287  peptidase S58, DmpA  43.23 
 
 
335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0721739  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1669  peptidase S58, DmpA  41.62 
 
 
334 aa  183  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3228  peptidase S58, DmpA  44.31 
 
 
318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2156  peptidase S58 DmpA  46.75 
 
 
340 aa  178  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2319  peptidase S58 DmpA  41.6 
 
 
361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212071  decreased coverage  0.00000119169 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0087  peptidase S58 DmpA  41.69 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4655  peptidase S58 DmpA  39.48 
 
 
347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.505511 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2605  peptidase S58, DmpA  41.81 
 
 
337 aa  171  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.47844 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4248  peptidase S58 DmpA  46.15 
 
 
329 aa  169  9e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0836973  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0482  peptidase S58 DmpA  37.92 
 
 
316 aa  169  9e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000526803  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0972  peptidase S58 DmpA  42.35 
 
 
358 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.898884  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1203  peptidase S58 DmpA  41.69 
 
 
337 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.794666  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1773  peptidase S58, DmpA  38.24 
 
 
331 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.800376  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4768  peptidase S58 DmpA  43.79 
 
 
329 aa  166  8e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49009  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1616  peptidase S58, DmpA  38.3 
 
 
332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108778  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4618  peptidase S58 DmpA  44.69 
 
 
329 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0311  peptidase S58 DmpA  39.31 
 
 
345 aa  164  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0772  peptidase S58, DmpA  40.73 
 
 
356 aa  163  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.904933  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4338  peptidase S58 DmpA  37.83 
 
 
334 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2093  peptidase S58 DmpA  41.47 
 
 
363 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201096  normal  0.024132 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1959  peptidase S58, DmpA  41.56 
 
 
306 aa  162  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1804  peptidase S58, DmpA  40.17 
 
 
350 aa  161  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.374201 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2264  peptidase S58 DmpA  43.32 
 
 
311 aa  159  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1675  T4 family peptidase  34.53 
 
 
325 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135147  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2133  peptidase S58, DmpA  41.12 
 
 
301 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.74532  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2667  peptidase S58, DmpA  37.54 
 
 
340 aa  157  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1410  T4 family peptidase  33.93 
 
 
325 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568813  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2889  putative peptidase  39.6 
 
 
327 aa  157  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00143546  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2617  peptidase S58, DmpA  38.35 
 
 
332 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1962  peptidase S58 DmpA  40.77 
 
 
352 aa  156  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2683  peptidase S58 DmpA  37.06 
 
 
342 aa  155  8e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5330  hypothetical protein  37.06 
 
 
332 aa  155  9e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12369  normal  0.395647 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3687  peptidase S58, DmpA  37.35 
 
 
331 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0198  peptidase S58 DmpA  40.32 
 
 
287 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1077  peptidase S58 DmpA  32.68 
 
 
328 aa  154  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.234138  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1091  peptidase S58 DmpA  37.24 
 
 
328 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3246  peptidase S58, DmpA  38.72 
 
 
322 aa  153  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0463  peptidase S58, DmpA  40.88 
 
 
331 aa  152  5.9999999999999996e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2215  peptidase S58, DmpA  36.23 
 
 
332 aa  151  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3087  peptidase S58 DmpA  45.56 
 
 
291 aa  147  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.145217 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0620  peptidase S58, DmpA  38.67 
 
 
327 aa  145  8.000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.975766  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3189  peptidase S58 DmpA  42.53 
 
 
339 aa  145  8.000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4121  peptidase S58 DmpA  42.76 
 
 
353 aa  145  9e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246913  normal  0.677622 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1456  peptidase S58 DmpA  39.49 
 
 
300 aa  139  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.749732  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2004  peptidase S58 DmpA  38.06 
 
 
334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00577301  hitchhiker  0.0000000124631 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3882  hypothetical protein  36.34 
 
 
333 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.482216  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4493  peptidase S58 DmpA  36.72 
 
 
331 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4203  peptidase S58 DmpA  37.01 
 
 
331 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2221  peptidase S58 DmpA  39.41 
 
 
361 aa  112  7.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010872  hitchhiker  4.545e-18 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2376  peptidase S58 DmpA  34.47 
 
 
282 aa  110  5e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.90605  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6005  peptidase S58, DmpA  30.52 
 
 
330 aa  71.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0304  peptidase S58 DmpA  27.71 
 
 
345 aa  62.8  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3561  peptidase S58 DmpA  29.71 
 
 
358 aa  61.2  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.949161  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3840  hypothetical protein  28.98 
 
 
366 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1923  aminopeptidase DmpA  29.51 
 
 
346 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3533  peptidase S58, DmpA  28.49 
 
 
372 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3006  peptidase S58 DmpA  27.43 
 
 
350 aa  54.3  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45210  hypothetical protein  27.53 
 
 
366 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152868  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1007  peptidase S58, DmpA  46.51 
 
 
204 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442944  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3844  D-aminopeptidase putative  28.16 
 
 
377 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4594  peptidase S58, DmpA  27.56 
 
 
354 aa  50.1  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1411  peptidase S58, DmpA  27.94 
 
 
352 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.704657  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5913  aminopeptidase  29.53 
 
 
349 aa  48.9  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2448  aminopeptidase DmpA  27.06 
 
 
489 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.357188  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6180  peptidase S58 DmpA  27.63 
 
 
375 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1411  peptidase S58 DmpA  27.06 
 
 
489 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1507  peptidase S58 DmpA  27.06 
 
 
489 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4112  peptidase S58 DmpA  27.83 
 
 
358 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.971314  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0461  putative D-aminopeptidase  32.31 
 
 
340 aa  47.8  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.509897  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1200  peptidase S58 DmpA  30.65 
 
 
347 aa  47.4  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2891  peptidase S58 DmpA  24.45 
 
 
373 aa  47.4  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0531  D-aminopeptidase, putative  35.77 
 
 
340 aa  47  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4222  peptidase S58 DmpA  30.27 
 
 
352 aa  47  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0592  putative D-aminopeptidase  29.64 
 
 
376 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0875  putative D-aminopeptidase  29.64 
 
 
376 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1842  putative D-aminopeptidase  29.64 
 
 
376 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1419  peptidase S58 DmpA  25.74 
 
 
463 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3240  peptidase S58 DmpA  29.57 
 
 
357 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3571  peptidase S58 DmpA  28.08 
 
 
372 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985399  normal  0.76681 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>