89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5913 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5913  aminopeptidase  100 
 
 		 349 aa  699    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2417  peptidase S58 DmpA  58.15 
 
 		 365 aa  371  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0995  aminopeptidase DmpA  54.39 
 
 		 387 aa  331  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2046  peptidase S58 DmpA  53.61 
 
 		 376 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173525  hitchhiker  0.00567247 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3571  peptidase S58 DmpA  51.81 
 
 		 372 aa  309  4e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985399  normal  0.76681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5706  peptidase S58 DmpA  53.61 
 
 		 375 aa  308  8e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17440  L-aminopeptidase DmpA  52.82 
 
 		 381 aa  301  1e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.558769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0304  peptidase S58 DmpA  45.88 
 
 		 345 aa  250  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0136  aminopeptidase DmpA  45.72 
 
 		 358 aa  242  7e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0051  L-aminopeptidase/D-esterase  44.31 
 
 		 369 aa  238  1e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1419  peptidase S58 DmpA  43.13 
 
 		 463 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1200  peptidase S58 DmpA  45.43 
 
 		 347 aa  237  3e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1479  peptidase S58 DmpA  44.81 
 
 		 318 aa  233  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1507  peptidase S58 DmpA  42.62 
 
 		 489 aa  233  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2448  aminopeptidase DmpA  42.16 
 
 		 489 aa  232  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.357188  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1411  peptidase S58 DmpA  42.62 
 
 		 489 aa  232  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3106  peptidase S58, DmpA  44.94 
 
 		 364 aa  229  5e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2464  aminopeptidase  44.48 
 
 		 348 aa  225  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00184488  normal  0.106032 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1923  aminopeptidase DmpA  44.92 
 
 		 346 aa  222  9e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2891  peptidase S58 DmpA  39.11 
 
 		 373 aa  221  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5170  peptidase S58 DmpA  44 
 
 		 345 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.935854  normal  0.481324 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3656  aminopeptidase DmpA  42.54 
 
 		 371 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.950122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3240  peptidase S58 DmpA  45.12 
 
 		 357 aa  219  7e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3561  peptidase S58 DmpA  43.75 
 
 		 358 aa  218  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.949161  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4594  peptidase S58, DmpA  45.21 
 
 		 354 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1411  peptidase S58, DmpA  44.11 
 
 		 352 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.704657  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1661  aminopeptidase DmpA  44.51 
 
 		 354 aa  216  4e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3006  peptidase S58 DmpA  44.82 
 
 		 350 aa  215  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1322  peptidase S58 DmpA  44.88 
 
 		 341 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0281785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1256  peptidase S58 DmpA  45.26 
 
 		 341 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2559  peptidase S58 DmpA  45.19 
 
 		 367 aa  211  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117376 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4222  peptidase S58 DmpA  42.42 
 
 		 352 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0839  aminopeptidase DmpA  43.58 
 
 		 364 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0193478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4055  peptidase S58 DmpA  43.38 
 
 		 360 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0143  peptidase S58 DmpA  43.62 
 
 		 352 aa  204  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0984939  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0531  D-aminopeptidase, putative  42.94 
 
 		 340 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3127  peptidase S58 DmpA  42.23 
 
 		 366 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0461  putative D-aminopeptidase  42.94 
 
 		 340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.509897  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3350  peptidase S58 DmpA  42.64 
 
 		 360 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.013595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4166  peptidase S58, DmpA  42.64 
 
 		 360 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735465 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4200  peptidase S58, DmpA  42.64 
 
 		 360 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381793  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1864  aminopeptidase DmpA  43.08 
 
 		 360 aa  199  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1383  D-aminopeptidase protein  44.28 
 
 		 341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.306178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3574  peptidase S58, DmpA  42.77 
 
 		 360 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0115434  normal  0.141356 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4251  aminopeptidase DmpA  42.6 
 
 		 372 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4112  peptidase S58 DmpA  40.58 
 
 		 358 aa  192  8e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.971314  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5294  aminopeptidase DmpA  38.51 
 
 		 367 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.660356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5586  aminopeptidase DmpA  38.51 
 
 		 367 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.237816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5206  aminopeptidase DmpA  38.51 
 
 		 367 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3974  peptidase S58 DmpA  41.62 
 
 		 351 aa  189  4e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4401  peptidase S58 DmpA  41.5 
 
 		 360 aa  188  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4423  peptidase S58 DmpA  42.25 
 
 		 357 aa  185  9e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.405309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6011  peptidase S58 DmpA  40.11 
 
 		 373 aa  184  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3844  D-aminopeptidase putative  38.4 
 
 		 377 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2806  peptidase S58 DmpA  36.39 
 
 		 375 aa  182  7e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3141  peptidase S58, DmpA  38.57 
 
 		 393 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.478527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3094  peptidase S58 DmpA  38.32 
 
 		 352 aa  176  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0856606  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3384  peptidase S58, DmpA  38.48 
 
 		 394 aa  176  7e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266715 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0875  putative D-aminopeptidase  39.88 
 
 		 376 aa  176  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1842  putative D-aminopeptidase  39.88 
 
 		 376 aa  176  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0592  putative D-aminopeptidase  39.88 
 
 		 376 aa  176  8e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45210  hypothetical protein  39.76 
 
 		 366 aa  175  9e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3533  peptidase S58, DmpA  37.97 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3840  hypothetical protein  39.35 
 
 		 366 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0605  peptidase S58 DmpA  38.78 
 
 		 369 aa  173  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6180  peptidase S58 DmpA  39.23 
 
 		 375 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1650  D-aminopeptidase, putative  40.69 
 
 		 407 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1047  aminopeptidase DmpA  40.12 
 
 		 370 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0633499  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4288  peptidase S58 DmpA  41.37 
 
 		 369 aa  165  9e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.443184 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1022  putative D-aminopeptidase  40.17 
 
 		 376 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1108  putative D-aminopeptidase  40.17 
 
 		 376 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2326  peptidase  39.88 
 
 		 376 aa  162  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3737  peptidase S58, DmpA  40.84 
 
 		 369 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0673701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4211  peptidase S58 DmpA  40.54 
 
 		 369 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.131306 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1684  aminopeptidase DmpA  40.54 
 
 		 369 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  0.901493 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3199  peptidase S58 DmpA  40.54 
 
 		 369 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4322  peptidase S58, DmpA  40.54 
 
 		 369 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.810072  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4044  peptidase S58, DmpA  40.54 
 
 		 369 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181806  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2592  peptidase S58 DmpA  39.71 
 
 		 368 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119043 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1116  D-aminopeptidase, putative  43.9 
 
 		 446 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0242  D-aminopeptidase  43.48 
 
 		 448 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.547192  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0321  aminopeptidase DmpA  43.48 
 
 		 442 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0398  L-aminopeptidase/D-esterase  43.48 
 
 		 448 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.343359  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1764  aminopeptidase DmpA  43.48 
 
 		 451 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1355  aminopeptidase DmpA  43.48 
 
 		 448 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.275545  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1849  L-aminopeptidase/D-esterase  43.48 
 
 		 442 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08608  D-aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03710)  32.12 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.344807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2797  peptidase S58 DmpA  28.26 
 
 		 331 aa  49.3  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2945  peptidase S58, DmpA  28.97 
 
 		 349 aa  44.7  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>