101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3127 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3127  peptidase S58 DmpA  100 
 
 
366 aa  737    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0839  aminopeptidase DmpA  85.21 
 
 
364 aa  599  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0193478  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4222  peptidase S58 DmpA  75.49 
 
 
352 aa  536  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4200  peptidase S58, DmpA  71.39 
 
 
360 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381793  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4166  peptidase S58, DmpA  71.39 
 
 
360 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00735465 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4055  peptidase S58 DmpA  69.43 
 
 
360 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4423  peptidase S58 DmpA  70.45 
 
 
357 aa  461  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.405309  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3350  peptidase S58 DmpA  71.51 
 
 
360 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.013595  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1864  aminopeptidase DmpA  71.23 
 
 
360 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3574  peptidase S58, DmpA  70 
 
 
360 aa  448  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0115434  normal  0.141356 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1116  D-aminopeptidase, putative  58.11 
 
 
446 aa  425  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1923  aminopeptidase DmpA  65.35 
 
 
346 aa  422  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3106  peptidase S58, DmpA  62.86 
 
 
364 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1411  peptidase S58, DmpA  64.9 
 
 
352 aa  417  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.704657  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1256  peptidase S58 DmpA  64.94 
 
 
341 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1322  peptidase S58 DmpA  64.08 
 
 
341 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0281785  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0136  aminopeptidase DmpA  63.25 
 
 
358 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3240  peptidase S58 DmpA  62.91 
 
 
357 aa  395  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1661  aminopeptidase DmpA  62.25 
 
 
354 aa  393  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4594  peptidase S58, DmpA  62.29 
 
 
354 aa  390  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3006  peptidase S58 DmpA  61.99 
 
 
350 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1383  D-aminopeptidase protein  60.4 
 
 
341 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.306178  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0398  L-aminopeptidase/D-esterase  73.24 
 
 
448 aa  319  5e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.343359  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0242  D-aminopeptidase  73.24 
 
 
448 aa  319  5e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.547192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1355  aminopeptidase DmpA  73.24 
 
 
448 aa  319  5e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.275545  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0321  aminopeptidase DmpA  73.24 
 
 
442 aa  318  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1764  aminopeptidase DmpA  73.24 
 
 
451 aa  318  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1849  L-aminopeptidase/D-esterase  73.24 
 
 
442 aa  318  9e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4401  peptidase S58 DmpA  51.59 
 
 
360 aa  308  8e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4112  peptidase S58 DmpA  51.3 
 
 
358 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.971314  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3974  peptidase S58 DmpA  50.58 
 
 
351 aa  302  7.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0051  L-aminopeptidase/D-esterase  46.24 
 
 
369 aa  300  2e-80  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0143  peptidase S58 DmpA  50.14 
 
 
352 aa  298  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0984939  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3561  peptidase S58 DmpA  49.56 
 
 
358 aa  297  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.949161  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0531  D-aminopeptidase, putative  49.56 
 
 
340 aa  292  6e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0461  putative D-aminopeptidase  49.56 
 
 
340 aa  292  6e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.509897  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1200  peptidase S58 DmpA  48.54 
 
 
347 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0304  peptidase S58 DmpA  46.51 
 
 
345 aa  277  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5170  peptidase S58 DmpA  47.89 
 
 
345 aa  267  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.935854  normal  0.481324 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2891  peptidase S58 DmpA  40.87 
 
 
373 aa  249  4e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3571  peptidase S58 DmpA  43.77 
 
 
372 aa  248  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985399  normal  0.76681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5706  peptidase S58 DmpA  44.26 
 
 
375 aa  245  9e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2417  peptidase S58 DmpA  44.7 
 
 
365 aa  229  4e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1419  peptidase S58 DmpA  40.11 
 
 
463 aa  228  9e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1411  peptidase S58 DmpA  41.23 
 
 
489 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1507  peptidase S58 DmpA  41.23 
 
 
489 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2448  aminopeptidase DmpA  41.23 
 
 
489 aa  223  6e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.357188  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3094  peptidase S58 DmpA  40.06 
 
 
352 aa  222  7e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0856606  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0995  aminopeptidase DmpA  43.53 
 
 
387 aa  219  3.9999999999999997e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2046  peptidase S58 DmpA  40.59 
 
 
376 aa  214  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173525  hitchhiker  0.00567247 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5913  aminopeptidase  42.52 
 
 
349 aa  213  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6011  peptidase S58 DmpA  40.94 
 
 
373 aa  202  9e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3141  peptidase S58, DmpA  39.61 
 
 
393 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.478527  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3384  peptidase S58, DmpA  39.29 
 
 
394 aa  200  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.266715 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17440  L-aminopeptidase DmpA  43.3 
 
 
381 aa  200  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.558769  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3656  aminopeptidase DmpA  40.35 
 
 
371 aa  199  7.999999999999999e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.950122  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2559  peptidase S58 DmpA  41.9 
 
 
367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2464  aminopeptidase  42.2 
 
 
348 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00184488  normal  0.106032 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5206  aminopeptidase DmpA  39.4 
 
 
367 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5294  aminopeptidase DmpA  39.4 
 
 
367 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.660356  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5586  aminopeptidase DmpA  39.4 
 
 
367 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.237816 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3844  D-aminopeptidase putative  38.78 
 
 
377 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6180  peptidase S58 DmpA  40.59 
 
 
375 aa  182  7e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3840  hypothetical protein  42.86 
 
 
366 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45210  hypothetical protein  42.55 
 
 
366 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152868  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3533  peptidase S58, DmpA  37.79 
 
 
372 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0592  putative D-aminopeptidase  40.46 
 
 
376 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0875  putative D-aminopeptidase  40.46 
 
 
376 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1842  putative D-aminopeptidase  40.46 
 
 
376 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2806  peptidase S58 DmpA  35.99 
 
 
375 aa  176  7e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1479  peptidase S58 DmpA  39.08 
 
 
318 aa  174  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4251  aminopeptidase DmpA  37.57 
 
 
372 aa  171  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1650  D-aminopeptidase, putative  41.04 
 
 
407 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1108  putative D-aminopeptidase  40.75 
 
 
376 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1022  putative D-aminopeptidase  40.75 
 
 
376 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3199  peptidase S58 DmpA  45.07 
 
 
369 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448482  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2326  peptidase  41.04 
 
 
376 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4044  peptidase S58, DmpA  45.07 
 
 
369 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181806  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3737  peptidase S58, DmpA  41.62 
 
 
369 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0673701  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4322  peptidase S58, DmpA  45.07 
 
 
369 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.810072  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0605  peptidase S58 DmpA  37.9 
 
 
369 aa  167  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4211  peptidase S58 DmpA  41.06 
 
 
369 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.131306 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1684  aminopeptidase DmpA  44.72 
 
 
369 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  0.901493 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4288  peptidase S58 DmpA  41.78 
 
 
369 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.443184 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2592  peptidase S58 DmpA  40.35 
 
 
368 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.119043 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1047  aminopeptidase DmpA  37.35 
 
 
370 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0633499  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0772  peptidase S58, DmpA  32.19 
 
 
356 aa  53.9  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.904933  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1091  peptidase S58 DmpA  32.69 
 
 
328 aa  52.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2943  peptidase S58 DmpA  33.49 
 
 
323 aa  49.7  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4768  peptidase S58 DmpA  39.34 
 
 
329 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49009  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3851  peptidase S58, DmpA  34.53 
 
 
340 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3925  peptidase S58, DmpA  34.53 
 
 
340 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3837  peptidase S58, DmpA  34.53 
 
 
340 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.449487  normal  0.0858293 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4248  peptidase S58 DmpA  35.62 
 
 
329 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0836973  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2093  peptidase S58 DmpA  36.8 
 
 
363 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201096  normal  0.024132 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4618  peptidase S58 DmpA  35.62 
 
 
329 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2667  peptidase S58, DmpA  34.97 
 
 
340 aa  46.2  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1488  peptidase S58 DmpA  29.95 
 
 
335 aa  45.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0291995 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2683  peptidase S58 DmpA  28.07 
 
 
342 aa  44.7  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2351  peptidase S58, DmpA  33.82 
 
 
340 aa  43.5  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260537  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>