110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1411 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1411  peptidase S58, DmpA  100 
 
 		 352 aa  707    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.704657  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1923  aminopeptidase DmpA  74.55 
 
 		 346 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1256  peptidase S58 DmpA  72.86 
 
 		 341 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1322  peptidase S58 DmpA  72.57 
 
 		 341 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0281785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0136  aminopeptidase DmpA  68.22 
 
 		 358 aa  451  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1383  D-aminopeptidase protein  70.66 
 
 		 341 aa  444  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.306178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4594  peptidase S58, DmpA  68.31 
 
 		 354 aa  440  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3106  peptidase S58, DmpA  66.47 
 
 		 364 aa  435  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1661  aminopeptidase DmpA  70.09 
 
 		 354 aa  436  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4222  peptidase S58 DmpA  65.69 
 
 		 352 aa  431  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3240  peptidase S58 DmpA  68.8 
 
 		 357 aa  426  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3006  peptidase S58 DmpA  68.07 
 
 		 350 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0839  aminopeptidase DmpA  66.39 
 
 		 364 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0193478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3127  peptidase S58 DmpA  64.9 
 
 		 366 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4055  peptidase S58 DmpA  65.98 
 
 		 360 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4423  peptidase S58 DmpA  68.34 
 
 		 357 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.405309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4200  peptidase S58, DmpA  65.88 
 
 		 360 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381793  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4166  peptidase S58, DmpA  65.88 
 
 		 360 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735465 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3350  peptidase S58 DmpA  66.57 
 
 		 360 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.013595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1864  aminopeptidase DmpA  66.27 
 
 		 360 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3574  peptidase S58, DmpA  64.79 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0115434  normal  0.141356 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0143  peptidase S58 DmpA  53.92 
 
 		 352 aa  322  6e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0984939  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4112  peptidase S58 DmpA  53.17 
 
 		 358 aa  317  2e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.971314  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3561  peptidase S58 DmpA  52.4 
 
 		 358 aa  317  3e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.949161  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3974  peptidase S58 DmpA  53.01 
 
 		 351 aa  316  4e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4401  peptidase S58 DmpA  52.87 
 
 		 360 aa  315  6e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0531  D-aminopeptidase, putative  53.13 
 
 		 340 aa  314  9.999999999999999e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0461  putative D-aminopeptidase  53.13 
 
 		 340 aa  314  9.999999999999999e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.509897  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1200  peptidase S58 DmpA  53.45 
 
 		 347 aa  308  9e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0051  L-aminopeptidase/D-esterase  47.6 
 
 		 369 aa  306  3e-82  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0304  peptidase S58 DmpA  48.82 
 
 		 345 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0398  L-aminopeptidase/D-esterase  68.72 
 
 		 448 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.343359  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0242  D-aminopeptidase  68.72 
 
 		 448 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.547192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1355  aminopeptidase DmpA  68.72 
 
 		 448 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.275545  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0321  aminopeptidase DmpA  72.68 
 
 		 442 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1849  L-aminopeptidase/D-esterase  68.72 
 
 		 442 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1764  aminopeptidase DmpA  72.68 
 
 		 451 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1116  D-aminopeptidase, putative  66.82 
 
 		 446 aa  273  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5170  peptidase S58 DmpA  48.66 
 
 		 345 aa  270  4e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.935854  normal  0.481324 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2891  peptidase S58 DmpA  42 
 
 		 373 aa  256  5e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3571  peptidase S58 DmpA  46.33 
 
 		 372 aa  251  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985399  normal  0.76681 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1419  peptidase S58 DmpA  42.66 
 
 		 463 aa  246  6e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5706  peptidase S58 DmpA  46.46 
 
 		 375 aa  243  3.9999999999999997e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1411  peptidase S58 DmpA  43.24 
 
 		 489 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1507  peptidase S58 DmpA  42.94 
 
 		 489 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2448  aminopeptidase DmpA  42.94 
 
 		 489 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.357188  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2417  peptidase S58 DmpA  45.45 
 
 		 365 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0995  aminopeptidase DmpA  47.23 
 
 		 387 aa  231  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2559  peptidase S58 DmpA  47.15 
 
 		 367 aa  230  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117376 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3094  peptidase S58 DmpA  41.28 
 
 		 352 aa  224  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0856606  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2046  peptidase S58 DmpA  43.12 
 
 		 376 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173525  hitchhiker  0.00567247 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5913  aminopeptidase  44.24 
 
 		 349 aa  220  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17440  L-aminopeptidase DmpA  46.81 
 
 		 381 aa  216  5e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.558769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3656  aminopeptidase DmpA  42.12 
 
 		 371 aa  200  3.9999999999999996e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.950122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1479  peptidase S58 DmpA  42.59 
 
 		 318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5206  aminopeptidase DmpA  41.31 
 
 		 367 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5294  aminopeptidase DmpA  41.31 
 
 		 367 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.660356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5586  aminopeptidase DmpA  41.31 
 
 		 367 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.237816 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3844  D-aminopeptidase putative  41.59 
 
 		 377 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0592  putative D-aminopeptidase  43.45 
 
 		 376 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0875  putative D-aminopeptidase  43.45 
 
 		 376 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1842  putative D-aminopeptidase  43.45 
 
 		 376 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3840  hypothetical protein  43.92 
 
 		 366 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2464  aminopeptidase  43.2 
 
 		 348 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00184488  normal  0.106032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3384  peptidase S58, DmpA  39.61 
 
 		 394 aa  185  8e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266715 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3533  peptidase S58, DmpA  40.44 
 
 		 372 aa  184  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45210  hypothetical protein  43.62 
 
 		 366 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6011  peptidase S58 DmpA  40.41 
 
 		 373 aa  183  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3141  peptidase S58, DmpA  38.86 
 
 		 393 aa  182  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.478527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6180  peptidase S58 DmpA  42.94 
 
 		 375 aa  180  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0605  peptidase S58 DmpA  42.73 
 
 		 369 aa  179  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4211  peptidase S58 DmpA  44.79 
 
 		 369 aa  179  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.131306 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3737  peptidase S58, DmpA  44.51 
 
 		 369 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0673701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2806  peptidase S58 DmpA  38.53 
 
 		 375 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1108  putative D-aminopeptidase  44.05 
 
 		 376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1022  putative D-aminopeptidase  44.05 
 
 		 376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1650  D-aminopeptidase, putative  43.92 
 
 		 407 aa  173  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2326  peptidase  43.75 
 
 		 376 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1684  aminopeptidase DmpA  44.71 
 
 		 369 aa  172  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  0.901493 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4044  peptidase S58, DmpA  44.71 
 
 		 369 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181806  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4322  peptidase S58, DmpA  44.71 
 
 		 369 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.810072  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3199  peptidase S58 DmpA  44.71 
 
 		 369 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2592  peptidase S58 DmpA  44.55 
 
 		 368 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119043 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4251  aminopeptidase DmpA  40 
 
 		 372 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4288  peptidase S58 DmpA  42.9 
 
 		 369 aa  166  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.443184 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1047  aminopeptidase DmpA  38.86 
 
 		 370 aa  151  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0633499  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2943  peptidase S58 DmpA  33.05 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.141829 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08608  D-aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03710)  33.99 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.344807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3851  peptidase S58, DmpA  42.64 
 
 		 340 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3925  peptidase S58, DmpA  42.64 
 
 		 340 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3837  peptidase S58, DmpA  42.64 
 
 		 340 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.449487  normal  0.0858293 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2797  peptidase S58 DmpA  28.93 
 
 		 331 aa  52.4  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4121  peptidase S58 DmpA  31.15 
 
 		 353 aa  51.6  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246913  normal  0.677622 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2667  peptidase S58, DmpA  30.75 
 
 		 340 aa  51.2  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1488  peptidase S58 DmpA  29.03 
 
 		 335 aa  50.4  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0291995 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1669  peptidase S58, DmpA  34.9 
 
 		 334 aa  48.1  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1287  peptidase S58, DmpA  28 
 
 		 335 aa  47.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0721739  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0772  peptidase S58, DmpA  29.74 
 
 		 356 aa  47.4  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.904933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3677  peptidase S58 DmpA  37.14 
 
 		 350 aa  46.6  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2945  peptidase S58, DmpA  27.94 
 
 		 349 aa  46.6  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>