90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5706 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5706  peptidase S58 DmpA  100 
 
 
375 aa  756    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3571  peptidase S58 DmpA  72.96 
 
 
372 aa  541  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985399  normal  0.76681 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2046  peptidase S58 DmpA  69.41 
 
 
376 aa  480  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173525  hitchhiker  0.00567247 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2417  peptidase S58 DmpA  61.6 
 
 
365 aa  422  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0995  aminopeptidase DmpA  58.18 
 
 
387 aa  420  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17440  L-aminopeptidase DmpA  56.98 
 
 
381 aa  363  2e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.558769  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5913  aminopeptidase  53.61 
 
 
349 aa  308  9e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0304  peptidase S58 DmpA  49.72 
 
 
345 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3656  aminopeptidase DmpA  47.25 
 
 
371 aa  286  5e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.950122  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1200  peptidase S58 DmpA  49.71 
 
 
347 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1507  peptidase S58 DmpA  44.38 
 
 
489 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1411  peptidase S58 DmpA  44.97 
 
 
489 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2448  aminopeptidase DmpA  44.97 
 
 
489 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.357188  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2464  aminopeptidase  49.14 
 
 
348 aa  275  8e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00184488  normal  0.106032 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1419  peptidase S58 DmpA  43.6 
 
 
463 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2891  peptidase S58 DmpA  43.88 
 
 
373 aa  270  2.9999999999999997e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0136  aminopeptidase DmpA  47.18 
 
 
358 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1479  peptidase S58 DmpA  48.07 
 
 
318 aa  263  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3844  D-aminopeptidase putative  44.51 
 
 
377 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3561  peptidase S58 DmpA  45.92 
 
 
358 aa  256  4e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.949161  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0051  L-aminopeptidase/D-esterase  45.96 
 
 
369 aa  256  4e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3840  hypothetical protein  44.04 
 
 
366 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45210  hypothetical protein  44.04 
 
 
366 aa  246  6e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152868  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3094  peptidase S58 DmpA  41.53 
 
 
352 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0856606  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4055  peptidase S58 DmpA  46.06 
 
 
360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1923  aminopeptidase DmpA  45.95 
 
 
346 aa  242  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3533  peptidase S58, DmpA  43.93 
 
 
372 aa  242  7e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0839  aminopeptidase DmpA  45.51 
 
 
364 aa  242  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0193478  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3106  peptidase S58, DmpA  46.08 
 
 
364 aa  242  9e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0461  putative D-aminopeptidase  45.48 
 
 
340 aa  240  2.9999999999999997e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.509897  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0531  D-aminopeptidase, putative  45.48 
 
 
340 aa  240  2.9999999999999997e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1864  aminopeptidase DmpA  46.63 
 
 
360 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4166  peptidase S58, DmpA  45.43 
 
 
360 aa  238  9e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00735465 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4200  peptidase S58, DmpA  45.43 
 
 
360 aa  238  9e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381793  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2559  peptidase S58 DmpA  44.57 
 
 
367 aa  237  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117376 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5294  aminopeptidase DmpA  40.76 
 
 
367 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.660356  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5206  aminopeptidase DmpA  40.76 
 
 
367 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5586  aminopeptidase DmpA  40.76 
 
 
367 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.237816 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3350  peptidase S58 DmpA  46.31 
 
 
360 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.013595  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3574  peptidase S58, DmpA  45.48 
 
 
360 aa  235  8e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0115434  normal  0.141356 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3240  peptidase S58 DmpA  43.84 
 
 
357 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1411  peptidase S58, DmpA  46.18 
 
 
352 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.704657  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3006  peptidase S58 DmpA  45.43 
 
 
350 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3127  peptidase S58 DmpA  44.97 
 
 
366 aa  232  9e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1661  aminopeptidase DmpA  43.84 
 
 
354 aa  230  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1256  peptidase S58 DmpA  45.07 
 
 
341 aa  229  8e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0592  putative D-aminopeptidase  42.16 
 
 
376 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1842  putative D-aminopeptidase  42.16 
 
 
376 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4222  peptidase S58 DmpA  42.86 
 
 
352 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0875  putative D-aminopeptidase  42.16 
 
 
376 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4251  aminopeptidase DmpA  40.5 
 
 
372 aa  227  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1322  peptidase S58 DmpA  44.18 
 
 
341 aa  226  4e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0281785  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0605  peptidase S58 DmpA  43.13 
 
 
369 aa  226  5.0000000000000005e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5170  peptidase S58 DmpA  40.92 
 
 
345 aa  225  9e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.935854  normal  0.481324 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6011  peptidase S58 DmpA  39.95 
 
 
373 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4423  peptidase S58 DmpA  46.78 
 
 
357 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.405309  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4594  peptidase S58, DmpA  43.52 
 
 
354 aa  220  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6180  peptidase S58 DmpA  42.35 
 
 
375 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2592  peptidase S58 DmpA  43.77 
 
 
368 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.119043 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1108  putative D-aminopeptidase  42.78 
 
 
376 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1022  putative D-aminopeptidase  42.78 
 
 
376 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2326  peptidase  42.43 
 
 
376 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4288  peptidase S58 DmpA  43.29 
 
 
369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.443184 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1650  D-aminopeptidase, putative  42.47 
 
 
407 aa  211  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4211  peptidase S58 DmpA  43.29 
 
 
369 aa  209  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.131306 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1383  D-aminopeptidase protein  43.58 
 
 
341 aa  209  9e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.306178  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1684  aminopeptidase DmpA  43.84 
 
 
369 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  0.901493 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3737  peptidase S58, DmpA  43.29 
 
 
369 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0673701  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3141  peptidase S58, DmpA  39.36 
 
 
393 aa  207  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.478527  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3199  peptidase S58 DmpA  43.17 
 
 
369 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448482  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4044  peptidase S58, DmpA  43.29 
 
 
369 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181806  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4322  peptidase S58, DmpA  43.29 
 
 
369 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.810072  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2806  peptidase S58 DmpA  37.13 
 
 
375 aa  206  7e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0143  peptidase S58 DmpA  41.47 
 
 
352 aa  204  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0984939  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3384  peptidase S58, DmpA  38.68 
 
 
394 aa  203  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.266715 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3974  peptidase S58 DmpA  40.41 
 
 
351 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4401  peptidase S58 DmpA  39.65 
 
 
360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4112  peptidase S58 DmpA  39.35 
 
 
358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.971314  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1047  aminopeptidase DmpA  38.29 
 
 
370 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0633499  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0321  aminopeptidase DmpA  47.6 
 
 
442 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1355  aminopeptidase DmpA  47.6 
 
 
448 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.275545  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1764  aminopeptidase DmpA  47.6 
 
 
451 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0242  D-aminopeptidase  47.6 
 
 
448 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.547192  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0398  L-aminopeptidase/D-esterase  47.6 
 
 
448 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.343359  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1849  L-aminopeptidase/D-esterase  47.6 
 
 
442 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1116  D-aminopeptidase, putative  47.12 
 
 
446 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08608  D-aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03710)  36.36 
 
 
184 aa  77.8  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.344807  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2797  peptidase S58 DmpA  33.17 
 
 
331 aa  56.2  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2156  peptidase S58 DmpA  30.8 
 
 
340 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1488  peptidase S58 DmpA  25.72 
 
 
335 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0291995 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>