130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2797 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2797  peptidase S58 DmpA  100 
 
 
331 aa  663    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0168  peptidase S58 DmpA  49.24 
 
 
319 aa  298  7e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29210  L-aminopeptidase/D-esterase  52.92 
 
 
345 aa  270  4e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3050  peptidase S58 DmpA  47.9 
 
 
363 aa  261  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578156  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0349  hypothetical protein  47.31 
 
 
368 aa  261  2e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0317  hypothetical protein  47.01 
 
 
368 aa  259  6e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2943  peptidase S58 DmpA  50.9 
 
 
323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3677  peptidase S58 DmpA  49.07 
 
 
350 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3716  peptidase S58 DmpA  47.24 
 
 
329 aa  244  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00511947 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1675  T4 family peptidase  43.33 
 
 
325 aa  240  2e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135147  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1410  T4 family peptidase  43.03 
 
 
325 aa  241  2e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568813  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3228  peptidase S58, DmpA  46.79 
 
 
318 aa  238  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2221  peptidase S58 DmpA  40.22 
 
 
361 aa  238  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010872  hitchhiker  4.545e-18 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3851  peptidase S58, DmpA  49.42 
 
 
340 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3925  peptidase S58, DmpA  49.42 
 
 
340 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3837  peptidase S58, DmpA  49.42 
 
 
340 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.449487  normal  0.0858293 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2906  peptidase S58 DmpA  49.83 
 
 
336 aa  235  8e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0174879 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1669  peptidase S58, DmpA  47.32 
 
 
334 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11365  hydrolase  49.14 
 
 
344 aa  228  1e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003196  normal  0.48244 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0482  peptidase S58 DmpA  41.9 
 
 
316 aa  226  4e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000526803  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0311  peptidase S58 DmpA  46.02 
 
 
345 aa  225  7e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2093  peptidase S58 DmpA  43.92 
 
 
363 aa  223  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201096  normal  0.024132 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2605  peptidase S58, DmpA  47.56 
 
 
337 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.47844 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1203  peptidase S58 DmpA  47.09 
 
 
337 aa  222  8e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.794666  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1959  peptidase S58, DmpA  46.3 
 
 
306 aa  221  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2351  peptidase S58, DmpA  47.95 
 
 
340 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260537  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1804  peptidase S58, DmpA  46.25 
 
 
350 aa  219  7e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.374201 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4768  peptidase S58 DmpA  45.65 
 
 
329 aa  218  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49009  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4294  peptidase S58, DmpA  47.83 
 
 
340 aa  217  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2156  peptidase S58 DmpA  46.95 
 
 
340 aa  216  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0972  peptidase S58 DmpA  44.28 
 
 
358 aa  216  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.898884  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2683  peptidase S58 DmpA  43.32 
 
 
342 aa  215  8e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4338  peptidase S58 DmpA  41.62 
 
 
334 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1077  peptidase S58 DmpA  37.99 
 
 
328 aa  210  3e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.234138  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1287  peptidase S58, DmpA  46.55 
 
 
335 aa  210  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0721739  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4248  peptidase S58 DmpA  45 
 
 
329 aa  207  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0836973  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4618  peptidase S58 DmpA  45.67 
 
 
329 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5330  hypothetical protein  41.12 
 
 
332 aa  203  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12369  normal  0.395647 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1488  peptidase S58 DmpA  46.42 
 
 
335 aa  203  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0291995 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3246  peptidase S58, DmpA  40.61 
 
 
322 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2215  peptidase S58, DmpA  39.88 
 
 
332 aa  200  3e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3882  hypothetical protein  43.15 
 
 
333 aa  200  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.482216  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2667  peptidase S58, DmpA  41.9 
 
 
340 aa  200  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2617  peptidase S58, DmpA  40.77 
 
 
332 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1616  peptidase S58, DmpA  38.21 
 
 
332 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108778  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0772  peptidase S58, DmpA  41.85 
 
 
356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.904933  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2945  peptidase S58, DmpA  41.52 
 
 
349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1773  peptidase S58, DmpA  40 
 
 
331 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.800376  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3687  peptidase S58, DmpA  39.64 
 
 
331 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0087  peptidase S58 DmpA  42.81 
 
 
313 aa  194  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1091  peptidase S58 DmpA  41.36 
 
 
328 aa  194  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0463  peptidase S58, DmpA  43.44 
 
 
331 aa  194  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2660  peptidase S58 DmpA  44.98 
 
 
322 aa  193  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4655  peptidase S58 DmpA  42.77 
 
 
347 aa  193  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.505511 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4121  peptidase S58 DmpA  42.17 
 
 
353 aa  192  7e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246913  normal  0.677622 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2889  putative peptidase  43.24 
 
 
327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00143546  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1962  peptidase S58 DmpA  44.61 
 
 
352 aa  187  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0198  peptidase S58 DmpA  42.41 
 
 
287 aa  184  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0620  peptidase S58, DmpA  41.28 
 
 
327 aa  182  7e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.975766  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2319  peptidase S58 DmpA  45.48 
 
 
361 aa  180  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212071  decreased coverage  0.00000119169 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3189  peptidase S58 DmpA  44.51 
 
 
339 aa  180  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4493  peptidase S58 DmpA  40.59 
 
 
331 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2004  peptidase S58 DmpA  39.35 
 
 
334 aa  173  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00577301  hitchhiker  0.0000000124631 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4203  peptidase S58 DmpA  40.29 
 
 
331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2133  peptidase S58, DmpA  38.36 
 
 
301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.74532  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1456  peptidase S58 DmpA  41.02 
 
 
300 aa  164  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.749732  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04100  L-aminopeptidase/D-esterase  42.66 
 
 
348 aa  158  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.037097 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3087  peptidase S58 DmpA  40.35 
 
 
291 aa  157  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.145217 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2264  peptidase S58 DmpA  40.72 
 
 
311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2376  peptidase S58 DmpA  33.57 
 
 
282 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.90605  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4346  peptidase S58 DmpA  59.29 
 
 
299 aa  90.1  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2417  peptidase S58 DmpA  32.09 
 
 
365 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6005  peptidase S58, DmpA  29.83 
 
 
330 aa  82  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1007  peptidase S58, DmpA  56.32 
 
 
204 aa  77.8  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442944  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3844  D-aminopeptidase putative  28.7 
 
 
377 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3533  peptidase S58, DmpA  31.52 
 
 
372 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3840  hypothetical protein  32.59 
 
 
366 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45210  hypothetical protein  32.18 
 
 
366 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152868  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2326  peptidase  30.96 
 
 
376 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1108  putative D-aminopeptidase  30.96 
 
 
376 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1022  putative D-aminopeptidase  30.96 
 
 
376 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1650  D-aminopeptidase, putative  31.27 
 
 
407 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0605  peptidase S58 DmpA  32.57 
 
 
369 aa  69.7  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0592  putative D-aminopeptidase  30.75 
 
 
376 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3384  peptidase S58, DmpA  29.9 
 
 
394 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.266715 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0875  putative D-aminopeptidase  30.75 
 
 
376 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1842  putative D-aminopeptidase  30.75 
 
 
376 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1684  aminopeptidase DmpA  34.09 
 
 
369 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  0.901493 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6180  peptidase S58 DmpA  28.29 
 
 
375 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2891  peptidase S58 DmpA  24.45 
 
 
373 aa  62.4  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3141  peptidase S58, DmpA  29.35 
 
 
393 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.478527  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0136  aminopeptidase DmpA  32 
 
 
358 aa  60.5  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4044  peptidase S58, DmpA  32.47 
 
 
369 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181806  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4322  peptidase S58, DmpA  32.47 
 
 
369 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.810072  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3199  peptidase S58 DmpA  32.47 
 
 
369 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448482  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0304  peptidase S58 DmpA  26.26 
 
 
345 aa  59.3  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1411  peptidase S58 DmpA  27.72 
 
 
489 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1507  peptidase S58 DmpA  27.72 
 
 
489 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3737  peptidase S58, DmpA  33.12 
 
 
369 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0673701  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2592  peptidase S58 DmpA  31.13 
 
 
368 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.119043 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>