109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11365 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11365  hydrolase  100 
 
 
344 aa  664    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003196  normal  0.48244 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3851  peptidase S58, DmpA  74.19 
 
 
340 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3925  peptidase S58, DmpA  74.19 
 
 
340 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3837  peptidase S58, DmpA  74.19 
 
 
340 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.449487  normal  0.0858293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4294  peptidase S58, DmpA  72.35 
 
 
340 aa  426  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2351  peptidase S58, DmpA  70.59 
 
 
340 aa  425  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260537  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29210  L-aminopeptidase/D-esterase  56.61 
 
 
345 aa  290  3e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1962  peptidase S58 DmpA  52.1 
 
 
352 aa  272  5.000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2797  peptidase S58 DmpA  49.14 
 
 
331 aa  268  1e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2943  peptidase S58 DmpA  49.71 
 
 
323 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2945  peptidase S58, DmpA  47.95 
 
 
349 aa  237  3e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2660  peptidase S58 DmpA  50.59 
 
 
322 aa  229  6e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3716  peptidase S58 DmpA  47.84 
 
 
329 aa  224  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00511947 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0168  peptidase S58 DmpA  41.91 
 
 
319 aa  222  6e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3050  peptidase S58 DmpA  42.27 
 
 
363 aa  216  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578156  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3677  peptidase S58 DmpA  48.2 
 
 
350 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3228  peptidase S58, DmpA  47.62 
 
 
318 aa  212  7.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0349  hypothetical protein  41.71 
 
 
368 aa  211  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0317  hypothetical protein  41.44 
 
 
368 aa  208  9e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0311  peptidase S58 DmpA  45.06 
 
 
345 aa  207  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0972  peptidase S58 DmpA  46.8 
 
 
358 aa  206  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.898884  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2156  peptidase S58 DmpA  50 
 
 
340 aa  206  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2906  peptidase S58 DmpA  50.68 
 
 
336 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0174879 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5330  hypothetical protein  43.43 
 
 
332 aa  202  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12369  normal  0.395647 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4768  peptidase S58 DmpA  47.71 
 
 
329 aa  202  8e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49009  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0772  peptidase S58, DmpA  44.22 
 
 
356 aa  202  9e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.904933  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4338  peptidase S58 DmpA  42.07 
 
 
334 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1287  peptidase S58, DmpA  47.22 
 
 
335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0721739  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1488  peptidase S58 DmpA  46.31 
 
 
335 aa  199  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0291995 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2667  peptidase S58, DmpA  42.98 
 
 
340 aa  199  7.999999999999999e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1616  peptidase S58, DmpA  42.24 
 
 
332 aa  198  9e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108778  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1091  peptidase S58 DmpA  41.36 
 
 
328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4248  peptidase S58 DmpA  50.67 
 
 
329 aa  196  6e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0836973  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1203  peptidase S58 DmpA  45.14 
 
 
337 aa  196  6e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.794666  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1675  T4 family peptidase  37.46 
 
 
325 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135147  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1410  T4 family peptidase  36.42 
 
 
325 aa  193  4e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568813  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2605  peptidase S58, DmpA  44 
 
 
337 aa  193  4e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.47844 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2617  peptidase S58, DmpA  43.8 
 
 
332 aa  192  5e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4618  peptidase S58 DmpA  49.5 
 
 
329 aa  192  5e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1773  peptidase S58, DmpA  41.33 
 
 
331 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.800376  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2093  peptidase S58 DmpA  45.45 
 
 
363 aa  192  7e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201096  normal  0.024132 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2683  peptidase S58 DmpA  41.03 
 
 
342 aa  192  7e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1669  peptidase S58, DmpA  45.25 
 
 
334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2215  peptidase S58, DmpA  42.12 
 
 
332 aa  189  4e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4655  peptidase S58 DmpA  41.23 
 
 
347 aa  185  9e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.505511 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2221  peptidase S58 DmpA  35.71 
 
 
361 aa  184  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010872  hitchhiker  4.545e-18 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3687  peptidase S58, DmpA  40.46 
 
 
331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2889  putative peptidase  44.61 
 
 
327 aa  183  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00143546  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1804  peptidase S58, DmpA  43.35 
 
 
350 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.374201 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4121  peptidase S58 DmpA  44.61 
 
 
353 aa  179  8e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246913  normal  0.677622 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1959  peptidase S58, DmpA  44.03 
 
 
306 aa  178  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0463  peptidase S58, DmpA  44.87 
 
 
331 aa  178  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0620  peptidase S58, DmpA  44.13 
 
 
327 aa  178  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.975766  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0482  peptidase S58 DmpA  37.15 
 
 
316 aa  178  1e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000526803  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04100  L-aminopeptidase/D-esterase  48.17 
 
 
348 aa  177  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.037097 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1077  peptidase S58 DmpA  33.71 
 
 
328 aa  176  5e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.234138  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3246  peptidase S58, DmpA  39.83 
 
 
322 aa  172  6.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0087  peptidase S58 DmpA  41.52 
 
 
313 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3189  peptidase S58 DmpA  45.24 
 
 
339 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0198  peptidase S58 DmpA  44.17 
 
 
287 aa  168  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4493  peptidase S58 DmpA  39.72 
 
 
331 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3882  hypothetical protein  40.52 
 
 
333 aa  152  8e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.482216  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2319  peptidase S58 DmpA  42.66 
 
 
361 aa  151  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212071  decreased coverage  0.00000119169 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4203  peptidase S58 DmpA  39.83 
 
 
331 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2264  peptidase S58 DmpA  41.45 
 
 
311 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3087  peptidase S58 DmpA  40.14 
 
 
291 aa  139  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.145217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1456  peptidase S58 DmpA  38.36 
 
 
300 aa  133  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.749732  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2133  peptidase S58, DmpA  40.82 
 
 
301 aa  132  6.999999999999999e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.74532  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2004  peptidase S58 DmpA  37.35 
 
 
334 aa  126  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00577301  hitchhiker  0.0000000124631 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2376  peptidase S58 DmpA  32.99 
 
 
282 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.90605  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4346  peptidase S58 DmpA  56.59 
 
 
299 aa  90.1  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6005  peptidase S58, DmpA  34.08 
 
 
330 aa  79.3  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3533  peptidase S58, DmpA  28.01 
 
 
372 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1923  aminopeptidase DmpA  33.5 
 
 
346 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45210  hypothetical protein  30.72 
 
 
366 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152868  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6180  peptidase S58 DmpA  30.23 
 
 
375 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3840  hypothetical protein  30.72 
 
 
366 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0605  peptidase S58 DmpA  27.24 
 
 
369 aa  53.5  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4594  peptidase S58, DmpA  33.49 
 
 
354 aa  53.5  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0304  peptidase S58 DmpA  23.51 
 
 
345 aa  52.8  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1007  peptidase S58, DmpA  42.34 
 
 
204 aa  52.8  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442944  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3106  peptidase S58, DmpA  31.43 
 
 
364 aa  52  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2559  peptidase S58 DmpA  29.87 
 
 
367 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117376 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3656  aminopeptidase DmpA  27.64 
 
 
371 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.950122  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0136  aminopeptidase DmpA  30.84 
 
 
358 aa  50.8  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3844  D-aminopeptidase putative  26.01 
 
 
377 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1661  aminopeptidase DmpA  31.36 
 
 
354 aa  48.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3094  peptidase S58 DmpA  31.22 
 
 
352 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0856606  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0839  aminopeptidase DmpA  37.14 
 
 
364 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0193478  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1411  peptidase S58, DmpA  33.99 
 
 
352 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.704657  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3240  peptidase S58 DmpA  31.08 
 
 
357 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0592  putative D-aminopeptidase  30.57 
 
 
376 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0875  putative D-aminopeptidase  30.57 
 
 
376 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1842  putative D-aminopeptidase  30.57 
 
 
376 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3006  peptidase S58 DmpA  32.06 
 
 
350 aa  47  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5206  aminopeptidase DmpA  29.58 
 
 
367 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5294  aminopeptidase DmpA  29.58 
 
 
367 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.660356  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5586  aminopeptidase DmpA  29.58 
 
 
367 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.237816 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1411  peptidase S58 DmpA  27.87 
 
 
489 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1507  peptidase S58 DmpA  27.87 
 
 
489 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>