90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3050 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0349  hypothetical protein  89.47 
 
 
368 aa  646    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0317  hypothetical protein  89.2 
 
 
368 aa  644    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3050  peptidase S58 DmpA  100 
 
 
363 aa  728    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578156  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3677  peptidase S58 DmpA  54.35 
 
 
350 aa  323  4e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2906  peptidase S58 DmpA  55.66 
 
 
336 aa  314  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0174879 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0168  peptidase S58 DmpA  51.08 
 
 
319 aa  304  2.0000000000000002e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1669  peptidase S58, DmpA  56.99 
 
 
334 aa  302  6.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2605  peptidase S58, DmpA  54.41 
 
 
337 aa  301  8.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.47844 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1675  T4 family peptidase  52.09 
 
 
325 aa  298  1e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135147  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1203  peptidase S58 DmpA  54.1 
 
 
337 aa  298  1e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.794666  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1410  T4 family peptidase  51.1 
 
 
325 aa  296  6e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568813  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0482  peptidase S58 DmpA  50.62 
 
 
316 aa  279  5e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000526803  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3716  peptidase S58 DmpA  52.2 
 
 
329 aa  279  6e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00511947 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1077  peptidase S58 DmpA  45.09 
 
 
328 aa  274  1.0000000000000001e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.234138  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1804  peptidase S58, DmpA  52.84 
 
 
350 aa  271  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.374201 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2943  peptidase S58 DmpA  50.62 
 
 
323 aa  269  5.9999999999999995e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3228  peptidase S58, DmpA  49.36 
 
 
318 aa  265  5.999999999999999e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2797  peptidase S58 DmpA  47.9 
 
 
331 aa  261  2e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3246  peptidase S58, DmpA  47.84 
 
 
322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0087  peptidase S58 DmpA  46.67 
 
 
313 aa  249  8e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1959  peptidase S58, DmpA  47.91 
 
 
306 aa  245  9e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2221  peptidase S58 DmpA  40.95 
 
 
361 aa  240  4e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010872  hitchhiker  4.545e-18 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4294  peptidase S58, DmpA  45.71 
 
 
340 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2351  peptidase S58, DmpA  45.01 
 
 
340 aa  209  6e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260537  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29210  L-aminopeptidase/D-esterase  41.45 
 
 
345 aa  206  7e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2004  peptidase S58 DmpA  41.11 
 
 
334 aa  203  5e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00577301  hitchhiker  0.0000000124631 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3925  peptidase S58, DmpA  42.69 
 
 
340 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3851  peptidase S58, DmpA  42.69 
 
 
340 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3837  peptidase S58, DmpA  42.69 
 
 
340 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.449487  normal  0.0858293 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4768  peptidase S58 DmpA  43.11 
 
 
329 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49009  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2093  peptidase S58 DmpA  41 
 
 
363 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201096  normal  0.024132 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0972  peptidase S58 DmpA  42.22 
 
 
358 aa  196  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.898884  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2945  peptidase S58, DmpA  39.76 
 
 
349 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2683  peptidase S58 DmpA  39.88 
 
 
342 aa  192  7e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1287  peptidase S58, DmpA  46.37 
 
 
335 aa  191  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0721739  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4618  peptidase S58 DmpA  42.3 
 
 
329 aa  191  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4248  peptidase S58 DmpA  41.99 
 
 
329 aa  190  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0836973  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2133  peptidase S58, DmpA  41.16 
 
 
301 aa  187  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.74532  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2660  peptidase S58 DmpA  42.33 
 
 
322 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0198  peptidase S58 DmpA  42.14 
 
 
287 aa  187  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11365  hydrolase  41.16 
 
 
344 aa  186  5e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003196  normal  0.48244 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0772  peptidase S58, DmpA  41.64 
 
 
356 aa  186  6e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.904933  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4338  peptidase S58 DmpA  38.58 
 
 
334 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1488  peptidase S58 DmpA  44.61 
 
 
335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0291995 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4655  peptidase S58 DmpA  38.39 
 
 
347 aa  179  7e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.505511 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2667  peptidase S58, DmpA  39.12 
 
 
340 aa  178  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3687  peptidase S58, DmpA  40.53 
 
 
331 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1962  peptidase S58 DmpA  38.83 
 
 
352 aa  176  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2156  peptidase S58 DmpA  42.05 
 
 
340 aa  177  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1456  peptidase S58 DmpA  44.26 
 
 
300 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.749732  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1773  peptidase S58, DmpA  39.58 
 
 
331 aa  173  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.800376  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4121  peptidase S58 DmpA  38.82 
 
 
353 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246913  normal  0.677622 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2617  peptidase S58, DmpA  36.87 
 
 
332 aa  171  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3087  peptidase S58 DmpA  41.22 
 
 
291 aa  170  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.145217 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0311  peptidase S58 DmpA  39.81 
 
 
345 aa  169  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2889  putative peptidase  41.27 
 
 
327 aa  169  8e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00143546  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1616  peptidase S58, DmpA  37.61 
 
 
332 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108778  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0620  peptidase S58, DmpA  40.24 
 
 
327 aa  165  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.975766  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2215  peptidase S58, DmpA  38.35 
 
 
332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5330  hypothetical protein  37.06 
 
 
332 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12369  normal  0.395647 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3882  hypothetical protein  38.74 
 
 
333 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.482216  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1091  peptidase S58 DmpA  38.01 
 
 
328 aa  157  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4493  peptidase S58 DmpA  39.62 
 
 
331 aa  156  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3189  peptidase S58 DmpA  40.06 
 
 
339 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2319  peptidase S58 DmpA  37.28 
 
 
361 aa  150  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212071  decreased coverage  0.00000119169 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4203  peptidase S58 DmpA  39.09 
 
 
331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04100  L-aminopeptidase/D-esterase  40.07 
 
 
348 aa  145  9e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.037097 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0463  peptidase S58, DmpA  39.63 
 
 
331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2376  peptidase S58 DmpA  32.44 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.90605  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6005  peptidase S58, DmpA  33.02 
 
 
330 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2264  peptidase S58 DmpA  35.99 
 
 
311 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1007  peptidase S58, DmpA  44.92 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442944  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4346  peptidase S58 DmpA  38 
 
 
299 aa  67  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4594  peptidase S58, DmpA  26.69 
 
 
354 aa  58.9  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2021  hypothetical protein  42.62 
 
 
62 aa  58.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0304  peptidase S58 DmpA  29.01 
 
 
345 aa  53.5  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4112  peptidase S58 DmpA  26.51 
 
 
358 aa  51.2  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.971314  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0531  D-aminopeptidase, putative  25.34 
 
 
340 aa  50.1  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0461  putative D-aminopeptidase  25.34 
 
 
340 aa  50.1  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.509897  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4401  peptidase S58 DmpA  28.18 
 
 
360 aa  50.1  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3561  peptidase S58 DmpA  25 
 
 
358 aa  49.3  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.949161  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3106  peptidase S58, DmpA  27.52 
 
 
364 aa  49.3  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2046  peptidase S58 DmpA  25.47 
 
 
376 aa  48.5  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173525  hitchhiker  0.00567247 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1661  aminopeptidase DmpA  32.47 
 
 
354 aa  47.8  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3006  peptidase S58 DmpA  25.17 
 
 
350 aa  47.4  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0136  aminopeptidase DmpA  30.18 
 
 
358 aa  46.6  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1923  aminopeptidase DmpA  27.78 
 
 
346 aa  46.6  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3840  hypothetical protein  25.88 
 
 
366 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45210  hypothetical protein  25.88 
 
 
366 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152868  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3974  peptidase S58 DmpA  25.08 
 
 
351 aa  44.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>