113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0136 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0136  aminopeptidase DmpA  100 
 
 
358 aa  712    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3106  peptidase S58, DmpA  83.24 
 
 
364 aa  580  1e-164  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3006  peptidase S58 DmpA  77.08 
 
 
350 aa  500  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4594  peptidase S58, DmpA  75.8 
 
 
354 aa  492  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1322  peptidase S58 DmpA  69.5 
 
 
341 aa  455  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0281785  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1256  peptidase S58 DmpA  69.79 
 
 
341 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1661  aminopeptidase DmpA  71.18 
 
 
354 aa  448  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3240  peptidase S58 DmpA  71.51 
 
 
357 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1923  aminopeptidase DmpA  68.79 
 
 
346 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1411  peptidase S58, DmpA  68.22 
 
 
352 aa  434  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.704657  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1383  D-aminopeptidase protein  67.54 
 
 
341 aa  432  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.306178  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0839  aminopeptidase DmpA  66.48 
 
 
364 aa  408  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0193478  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4222  peptidase S58 DmpA  62.97 
 
 
352 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4055  peptidase S58 DmpA  65.19 
 
 
360 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3127  peptidase S58 DmpA  62.71 
 
 
366 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4200  peptidase S58, DmpA  64.52 
 
 
360 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381793  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4166  peptidase S58, DmpA  64.52 
 
 
360 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00735465 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3350  peptidase S58 DmpA  64.9 
 
 
360 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.013595  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1864  aminopeptidase DmpA  64.9 
 
 
360 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3574  peptidase S58, DmpA  63.61 
 
 
360 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0115434  normal  0.141356 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4423  peptidase S58 DmpA  63.64 
 
 
357 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.405309  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4112  peptidase S58 DmpA  54.09 
 
 
358 aa  322  5e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.971314  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4401  peptidase S58 DmpA  55.19 
 
 
360 aa  322  8e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3561  peptidase S58 DmpA  52.52 
 
 
358 aa  321  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.949161  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0143  peptidase S58 DmpA  53.87 
 
 
352 aa  312  3.9999999999999997e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0984939  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0531  D-aminopeptidase, putative  51.93 
 
 
340 aa  309  5e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0461  putative D-aminopeptidase  51.93 
 
 
340 aa  309  5e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.509897  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3974  peptidase S58 DmpA  53.27 
 
 
351 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0051  L-aminopeptidase/D-esterase  45.88 
 
 
369 aa  305  6e-82  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1200  peptidase S58 DmpA  49.57 
 
 
347 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0304  peptidase S58 DmpA  47.56 
 
 
345 aa  295  8e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5170  peptidase S58 DmpA  49.85 
 
 
345 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.935854  normal  0.481324 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0321  aminopeptidase DmpA  65.89 
 
 
442 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1764  aminopeptidase DmpA  65.89 
 
 
451 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0398  L-aminopeptidase/D-esterase  65.89 
 
 
448 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.343359  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0242  D-aminopeptidase  65.89 
 
 
448 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.547192  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1849  L-aminopeptidase/D-esterase  65.89 
 
 
442 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1355  aminopeptidase DmpA  65.89 
 
 
448 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.275545  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3571  peptidase S58 DmpA  46.8 
 
 
372 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985399  normal  0.76681 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1116  D-aminopeptidase, putative  65.44 
 
 
446 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5706  peptidase S58 DmpA  47.18 
 
 
375 aa  264  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2891  peptidase S58 DmpA  40.06 
 
 
373 aa  264  2e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1507  peptidase S58 DmpA  44 
 
 
489 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2448  aminopeptidase DmpA  44 
 
 
489 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.357188  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1411  peptidase S58 DmpA  43.71 
 
 
489 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1419  peptidase S58 DmpA  43.02 
 
 
463 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2417  peptidase S58 DmpA  48.36 
 
 
365 aa  249  7e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0995  aminopeptidase DmpA  46.53 
 
 
387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5913  aminopeptidase  45.72 
 
 
349 aa  242  7e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2046  peptidase S58 DmpA  43.53 
 
 
376 aa  238  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173525  hitchhiker  0.00567247 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17440  L-aminopeptidase DmpA  45.43 
 
 
381 aa  220  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.558769  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3656  aminopeptidase DmpA  45.1 
 
 
371 aa  219  7e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.950122  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2559  peptidase S58 DmpA  43.98 
 
 
367 aa  213  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117376 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3094  peptidase S58 DmpA  39.71 
 
 
352 aa  207  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0856606  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5206  aminopeptidase DmpA  42.05 
 
 
367 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5294  aminopeptidase DmpA  42.05 
 
 
367 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.660356  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5586  aminopeptidase DmpA  42.05 
 
 
367 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.237816 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3844  D-aminopeptidase putative  41.5 
 
 
377 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6011  peptidase S58 DmpA  41.35 
 
 
373 aa  193  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45210  hypothetical protein  42.86 
 
 
366 aa  192  9e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152868  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3840  hypothetical protein  42.86 
 
 
366 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0605  peptidase S58 DmpA  40.75 
 
 
369 aa  189  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3533  peptidase S58, DmpA  40.52 
 
 
372 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4251  aminopeptidase DmpA  40.25 
 
 
372 aa  188  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6180  peptidase S58 DmpA  42.65 
 
 
375 aa  186  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0592  putative D-aminopeptidase  44.06 
 
 
376 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0875  putative D-aminopeptidase  44.06 
 
 
376 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1842  putative D-aminopeptidase  44.06 
 
 
376 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1479  peptidase S58 DmpA  41.21 
 
 
318 aa  183  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3141  peptidase S58, DmpA  38.35 
 
 
393 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.478527  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2806  peptidase S58 DmpA  37.76 
 
 
375 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2464  aminopeptidase  41.96 
 
 
348 aa  176  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00184488  normal  0.106032 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1108  putative D-aminopeptidase  44.06 
 
 
376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1022  putative D-aminopeptidase  44.06 
 
 
376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2326  peptidase  44.06 
 
 
376 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3384  peptidase S58, DmpA  37.12 
 
 
394 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.266715 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1650  D-aminopeptidase, putative  44.38 
 
 
407 aa  170  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3737  peptidase S58, DmpA  44.22 
 
 
369 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0673701  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4211  peptidase S58 DmpA  44.22 
 
 
369 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.131306 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2592  peptidase S58 DmpA  44.01 
 
 
368 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.119043 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4288  peptidase S58 DmpA  44.06 
 
 
369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.443184 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1684  aminopeptidase DmpA  43.68 
 
 
369 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  0.901493 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4044  peptidase S58, DmpA  43.97 
 
 
369 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181806  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4322  peptidase S58, DmpA  43.97 
 
 
369 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.810072  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1047  aminopeptidase DmpA  39.82 
 
 
370 aa  160  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0633499  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3199  peptidase S58 DmpA  43.68 
 
 
369 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448482  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08608  D-aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03710)  34.97 
 
 
184 aa  61.2  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.344807  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2797  peptidase S58 DmpA  32 
 
 
331 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2093  peptidase S58 DmpA  31.1 
 
 
363 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201096  normal  0.024132 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2156  peptidase S58 DmpA  30.51 
 
 
340 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1091  peptidase S58 DmpA  32.05 
 
 
328 aa  50.8  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2215  peptidase S58, DmpA  28.37 
 
 
332 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3851  peptidase S58, DmpA  35.77 
 
 
340 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3925  peptidase S58, DmpA  35.77 
 
 
340 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3837  peptidase S58, DmpA  35.77 
 
 
340 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.449487  normal  0.0858293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0972  peptidase S58 DmpA  29.93 
 
 
358 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.898884  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1773  peptidase S58, DmpA  28.93 
 
 
331 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.800376  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4121  peptidase S58 DmpA  31.48 
 
 
353 aa  47.4  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246913  normal  0.677622 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4618  peptidase S58 DmpA  39.67 
 
 
329 aa  47  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0772  peptidase S58, DmpA  30.94 
 
 
356 aa  46.6  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.904933  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>