102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2417 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2417  peptidase S58 DmpA  100 
 
 
365 aa  723    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3571  peptidase S58 DmpA  63.94 
 
 
372 aa  448  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985399  normal  0.76681 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0995  aminopeptidase DmpA  60.66 
 
 
387 aa  432  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5706  peptidase S58 DmpA  61.6 
 
 
375 aa  422  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2046  peptidase S58 DmpA  57.98 
 
 
376 aa  416  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173525  hitchhiker  0.00567247 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17440  L-aminopeptidase DmpA  61.16 
 
 
381 aa  386  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.558769  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5913  aminopeptidase  58.15 
 
 
349 aa  371  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1507  peptidase S58 DmpA  50.95 
 
 
489 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1411  peptidase S58 DmpA  50.95 
 
 
489 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2448  aminopeptidase DmpA  50.96 
 
 
489 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.357188  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1419  peptidase S58 DmpA  50.95 
 
 
463 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2464  aminopeptidase  50.84 
 
 
348 aa  291  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00184488  normal  0.106032 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3656  aminopeptidase DmpA  48.48 
 
 
371 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.950122  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0304  peptidase S58 DmpA  48.19 
 
 
345 aa  278  8e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2891  peptidase S58 DmpA  44.2 
 
 
373 aa  278  1e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1479  peptidase S58 DmpA  48.13 
 
 
318 aa  273  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0136  aminopeptidase DmpA  48.36 
 
 
358 aa  249  7e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2559  peptidase S58 DmpA  49.43 
 
 
367 aa  248  9e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117376 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1200  peptidase S58 DmpA  47.24 
 
 
347 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0051  L-aminopeptidase/D-esterase  40.74 
 
 
369 aa  237  2e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3094  peptidase S58 DmpA  42.06 
 
 
352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0856606  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6011  peptidase S58 DmpA  43.51 
 
 
373 aa  232  9e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1411  peptidase S58, DmpA  45.16 
 
 
352 aa  229  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.704657  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3844  D-aminopeptidase putative  41.58 
 
 
377 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0839  aminopeptidase DmpA  46.72 
 
 
364 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0193478  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4222  peptidase S58 DmpA  43.52 
 
 
352 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3106  peptidase S58, DmpA  47.58 
 
 
364 aa  226  6e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45210  hypothetical protein  44.08 
 
 
366 aa  225  8e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152868  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3561  peptidase S58 DmpA  45.21 
 
 
358 aa  225  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.949161  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1864  aminopeptidase DmpA  45.32 
 
 
360 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3840  hypothetical protein  43.8 
 
 
366 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1661  aminopeptidase DmpA  46.55 
 
 
354 aa  223  4e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4251  aminopeptidase DmpA  42.78 
 
 
372 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3533  peptidase S58, DmpA  42.2 
 
 
372 aa  222  7e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0592  putative D-aminopeptidase  44.32 
 
 
376 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5206  aminopeptidase DmpA  43.41 
 
 
367 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5294  aminopeptidase DmpA  43.41 
 
 
367 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.660356  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0875  putative D-aminopeptidase  44.32 
 
 
376 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5586  aminopeptidase DmpA  43.41 
 
 
367 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.237816 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1842  putative D-aminopeptidase  44.32 
 
 
376 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4055  peptidase S58 DmpA  43.86 
 
 
360 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4200  peptidase S58, DmpA  44.61 
 
 
360 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381793  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4166  peptidase S58, DmpA  44.61 
 
 
360 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00735465 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3240  peptidase S58 DmpA  45.62 
 
 
357 aa  219  5e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3350  peptidase S58 DmpA  44.57 
 
 
360 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.013595  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4401  peptidase S58 DmpA  41.79 
 
 
360 aa  219  5e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1923  aminopeptidase DmpA  44.44 
 
 
346 aa  219  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0143  peptidase S58 DmpA  44.14 
 
 
352 aa  219  6e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0984939  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4112  peptidase S58 DmpA  42.94 
 
 
358 aa  219  6e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.971314  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3384  peptidase S58, DmpA  40 
 
 
394 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.266715 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3141  peptidase S58, DmpA  40.67 
 
 
393 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.478527  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3006  peptidase S58 DmpA  45.51 
 
 
350 aa  217  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2806  peptidase S58 DmpA  39.57 
 
 
375 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3574  peptidase S58, DmpA  43.86 
 
 
360 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0115434  normal  0.141356 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5170  peptidase S58 DmpA  42.33 
 
 
345 aa  215  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.935854  normal  0.481324 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3127  peptidase S58 DmpA  43.27 
 
 
366 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4594  peptidase S58, DmpA  45.05 
 
 
354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0605  peptidase S58 DmpA  42.86 
 
 
369 aa  213  4.9999999999999996e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1650  D-aminopeptidase, putative  43.23 
 
 
407 aa  212  7e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4288  peptidase S58 DmpA  43.01 
 
 
369 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.443184 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3974  peptidase S58 DmpA  42.68 
 
 
351 aa  211  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2326  peptidase  44.32 
 
 
376 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1108  putative D-aminopeptidase  43.82 
 
 
376 aa  209  8e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1022  putative D-aminopeptidase  43.82 
 
 
376 aa  209  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4211  peptidase S58 DmpA  43.29 
 
 
369 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.131306 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3737  peptidase S58, DmpA  43.01 
 
 
369 aa  206  7e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0673701  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0531  D-aminopeptidase, putative  42.81 
 
 
340 aa  205  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1684  aminopeptidase DmpA  43.29 
 
 
369 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  0.901493 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0461  putative D-aminopeptidase  42.81 
 
 
340 aa  205  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.509897  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1322  peptidase S58 DmpA  44.18 
 
 
341 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0281785  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4044  peptidase S58, DmpA  43.44 
 
 
369 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181806  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4322  peptidase S58, DmpA  43.44 
 
 
369 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.810072  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1256  peptidase S58 DmpA  44.01 
 
 
341 aa  202  5e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3199  peptidase S58 DmpA  43.01 
 
 
369 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448482  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1383  D-aminopeptidase protein  44.91 
 
 
341 aa  199  7e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.306178  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4423  peptidase S58 DmpA  44.44 
 
 
357 aa  196  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.405309  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6180  peptidase S58 DmpA  41.71 
 
 
375 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2592  peptidase S58 DmpA  44.22 
 
 
368 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.119043 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1047  aminopeptidase DmpA  42.01 
 
 
370 aa  188  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0633499  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1116  D-aminopeptidase, putative  47.14 
 
 
446 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0321  aminopeptidase DmpA  46.67 
 
 
442 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1764  aminopeptidase DmpA  46.67 
 
 
451 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0398  L-aminopeptidase/D-esterase  46.67 
 
 
448 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.343359  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0242  D-aminopeptidase  46.67 
 
 
448 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.547192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1355  aminopeptidase DmpA  46.67 
 
 
448 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.275545  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1849  L-aminopeptidase/D-esterase  46.67 
 
 
442 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08608  D-aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03710)  38.86 
 
 
184 aa  91.7  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.344807  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2797  peptidase S58 DmpA  32.09 
 
 
331 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0087  peptidase S58 DmpA  30.24 
 
 
313 aa  52.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2943  peptidase S58 DmpA  28.98 
 
 
323 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3677  peptidase S58 DmpA  29.64 
 
 
350 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0620  peptidase S58, DmpA  33.97 
 
 
327 aa  46.2  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.975766  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1488  peptidase S58 DmpA  33.1 
 
 
335 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0291995 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1669  peptidase S58, DmpA  27.1 
 
 
334 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2889  putative peptidase  29.41 
 
 
327 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00143546  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2660  peptidase S58 DmpA  26.75 
 
 
322 aa  44.3  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4768  peptidase S58 DmpA  33.79 
 
 
329 aa  43.5  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49009  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2264  peptidase S58 DmpA  35.5 
 
 
311 aa  43.5  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2351  peptidase S58, DmpA  35.57 
 
 
340 aa  43.1  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260537  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2667  peptidase S58, DmpA  31.13 
 
 
340 aa  43.1  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>