101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_17440 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_17440  L-aminopeptidase DmpA  100 
 
 
381 aa  751    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.558769  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3571  peptidase S58 DmpA  58.19 
 
 
372 aa  409  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985399  normal  0.76681 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2417  peptidase S58 DmpA  61.16 
 
 
365 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0995  aminopeptidase DmpA  56.59 
 
 
387 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5706  peptidase S58 DmpA  56.98 
 
 
375 aa  382  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2046  peptidase S58 DmpA  54.57 
 
 
376 aa  371  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173525  hitchhiker  0.00567247 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5913  aminopeptidase  52.82 
 
 
349 aa  318  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2464  aminopeptidase  53.43 
 
 
348 aa  303  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00184488  normal  0.106032 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1479  peptidase S58 DmpA  50.3 
 
 
318 aa  289  5.0000000000000004e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1507  peptidase S58 DmpA  46.83 
 
 
489 aa  282  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1411  peptidase S58 DmpA  46.83 
 
 
489 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2448  aminopeptidase DmpA  47.08 
 
 
489 aa  280  4e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.357188  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1419  peptidase S58 DmpA  46.83 
 
 
463 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0304  peptidase S58 DmpA  46.48 
 
 
345 aa  267  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3656  aminopeptidase DmpA  45.71 
 
 
371 aa  265  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.950122  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1200  peptidase S58 DmpA  47.61 
 
 
347 aa  260  3e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2559  peptidase S58 DmpA  48.88 
 
 
367 aa  254  1.0000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117376 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2891  peptidase S58 DmpA  38.5 
 
 
373 aa  248  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5206  aminopeptidase DmpA  44.59 
 
 
367 aa  242  6e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5294  aminopeptidase DmpA  44.59 
 
 
367 aa  242  6e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.660356  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5586  aminopeptidase DmpA  44.59 
 
 
367 aa  242  6e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.237816 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3094  peptidase S58 DmpA  41.11 
 
 
352 aa  239  5e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0856606  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0051  L-aminopeptidase/D-esterase  41.69 
 
 
369 aa  239  5.999999999999999e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0136  aminopeptidase DmpA  45.43 
 
 
358 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4594  peptidase S58, DmpA  46.13 
 
 
354 aa  229  5e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1923  aminopeptidase DmpA  45.09 
 
 
346 aa  229  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1411  peptidase S58, DmpA  47.11 
 
 
352 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.704657  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3106  peptidase S58, DmpA  43.3 
 
 
364 aa  225  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3561  peptidase S58 DmpA  43.62 
 
 
358 aa  223  6e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.949161  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4222  peptidase S58 DmpA  45.53 
 
 
352 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3240  peptidase S58 DmpA  44.18 
 
 
357 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0839  aminopeptidase DmpA  45.56 
 
 
364 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0193478  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4401  peptidase S58 DmpA  41.18 
 
 
360 aa  218  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4055  peptidase S58 DmpA  44.83 
 
 
360 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6011  peptidase S58 DmpA  42.32 
 
 
373 aa  217  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5170  peptidase S58 DmpA  43.37 
 
 
345 aa  216  7e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.935854  normal  0.481324 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3006  peptidase S58 DmpA  44.01 
 
 
350 aa  216  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3844  D-aminopeptidase putative  41.24 
 
 
377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1322  peptidase S58 DmpA  43.62 
 
 
341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0281785  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0592  putative D-aminopeptidase  45.51 
 
 
376 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0875  putative D-aminopeptidase  45.51 
 
 
376 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1842  putative D-aminopeptidase  45.51 
 
 
376 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3350  peptidase S58 DmpA  42.52 
 
 
360 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.013595  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3533  peptidase S58, DmpA  41.69 
 
 
372 aa  212  7e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4200  peptidase S58, DmpA  42.82 
 
 
360 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381793  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4166  peptidase S58, DmpA  42.82 
 
 
360 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00735465 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0143  peptidase S58 DmpA  40.56 
 
 
352 aa  211  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0984939  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3574  peptidase S58, DmpA  43.55 
 
 
360 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0115434  normal  0.141356 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1256  peptidase S58 DmpA  43.03 
 
 
341 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4112  peptidase S58 DmpA  41.07 
 
 
358 aa  211  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.971314  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1864  aminopeptidase DmpA  43.03 
 
 
360 aa  208  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0531  D-aminopeptidase, putative  43.82 
 
 
340 aa  206  5e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0461  putative D-aminopeptidase  43.82 
 
 
340 aa  206  7e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.509897  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2326  peptidase  45.8 
 
 
376 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3384  peptidase S58, DmpA  39.89 
 
 
394 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.266715 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1108  putative D-aminopeptidase  45.8 
 
 
376 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1022  putative D-aminopeptidase  45.8 
 
 
376 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3974  peptidase S58 DmpA  40.86 
 
 
351 aa  204  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3127  peptidase S58 DmpA  42.74 
 
 
366 aa  203  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4251  aminopeptidase DmpA  41.05 
 
 
372 aa  201  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2806  peptidase S58 DmpA  38.07 
 
 
375 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6180  peptidase S58 DmpA  43.66 
 
 
375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45210  hypothetical protein  41.05 
 
 
366 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152868  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3840  hypothetical protein  41.32 
 
 
366 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4423  peptidase S58 DmpA  43.6 
 
 
357 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.405309  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1661  aminopeptidase DmpA  42.82 
 
 
354 aa  196  6e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1650  D-aminopeptidase, putative  44.54 
 
 
407 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1383  D-aminopeptidase protein  43.41 
 
 
341 aa  193  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.306178  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3141  peptidase S58, DmpA  37.5 
 
 
393 aa  190  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.478527  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0605  peptidase S58 DmpA  41.81 
 
 
369 aa  186  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2592  peptidase S58 DmpA  41.46 
 
 
368 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.119043 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3737  peptidase S58, DmpA  43.24 
 
 
369 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0673701  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4288  peptidase S58 DmpA  42.23 
 
 
369 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.443184 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4211  peptidase S58 DmpA  43.24 
 
 
369 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.131306 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1684  aminopeptidase DmpA  43.09 
 
 
369 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  0.901493 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1047  aminopeptidase DmpA  39.67 
 
 
370 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0633499  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4044  peptidase S58, DmpA  42.78 
 
 
369 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181806  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4322  peptidase S58, DmpA  42.78 
 
 
369 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.810072  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3199  peptidase S58 DmpA  42.78 
 
 
369 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448482  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1116  D-aminopeptidase, putative  36.16 
 
 
446 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0321  aminopeptidase DmpA  43.66 
 
 
442 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0398  L-aminopeptidase/D-esterase  43.66 
 
 
448 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.343359  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0242  D-aminopeptidase  43.66 
 
 
448 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.547192  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1764  aminopeptidase DmpA  43.66 
 
 
451 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1355  aminopeptidase DmpA  43.66 
 
 
448 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.275545  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1849  L-aminopeptidase/D-esterase  43.66 
 
 
442 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08608  D-aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03710)  32.96 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.344807  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29210  L-aminopeptidase/D-esterase  31.51 
 
 
345 aa  55.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0620  peptidase S58, DmpA  33.94 
 
 
327 aa  49.7  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.975766  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1669  peptidase S58, DmpA  33.12 
 
 
334 aa  49.7  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0087  peptidase S58 DmpA  31.75 
 
 
313 aa  47.8  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3851  peptidase S58, DmpA  38.24 
 
 
340 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3925  peptidase S58, DmpA  38.24 
 
 
340 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3837  peptidase S58, DmpA  38.24 
 
 
340 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.449487  normal  0.0858293 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3677  peptidase S58 DmpA  33.54 
 
 
350 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0772  peptidase S58, DmpA  27.85 
 
 
356 aa  43.9  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.904933  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2351  peptidase S58, DmpA  38.06 
 
 
340 aa  43.5  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260537  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1091  peptidase S58 DmpA  28.09 
 
 
328 aa  43.9  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2093  peptidase S58 DmpA  34.48 
 
 
363 aa  43.5  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201096  normal  0.024132 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1287  peptidase S58, DmpA  29 
 
 
335 aa  43.5  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0721739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>