121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2093 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2093  peptidase S58 DmpA  100 
 
 		 363 aa  679    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201096  normal  0.024132 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0972  peptidase S58 DmpA  86.97 
 
 		 358 aa  531  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.898884  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4768  peptidase S58 DmpA  76 
 
 		 329 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4248  peptidase S58 DmpA  74.15 
 
 		 329 aa  420  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4618  peptidase S58 DmpA  73.54 
 
 		 329 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2156  peptidase S58 DmpA  72.49 
 
 		 340 aa  403  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1616  peptidase S58, DmpA  64.56 
 
 		 332 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2215  peptidase S58, DmpA  64.86 
 
 		 332 aa  368  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1773  peptidase S58, DmpA  61.14 
 
 		 331 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.800376  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2683  peptidase S58 DmpA  60.9 
 
 		 342 aa  357  9.999999999999999e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5330  hypothetical protein  63.77 
 
 		 332 aa  355  5e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12369  normal  0.395647 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3687  peptidase S58, DmpA  60.24 
 
 		 331 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2617  peptidase S58, DmpA  64.86 
 
 		 332 aa  354  1e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4338  peptidase S58 DmpA  58.33 
 
 		 334 aa  347  1e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1091  peptidase S58 DmpA  56.36 
 
 		 328 aa  323  3e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0772  peptidase S58, DmpA  60.12 
 
 		 356 aa  322  9.000000000000001e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.904933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4493  peptidase S58 DmpA  57.58 
 
 		 331 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1488  peptidase S58 DmpA  59.16 
 
 		 335 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0291995 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4121  peptidase S58 DmpA  58.63 
 
 		 353 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246913  normal  0.677622 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4203  peptidase S58 DmpA  59.09 
 
 		 331 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1287  peptidase S58, DmpA  57.45 
 
 		 335 aa  301  9e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0721739  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3882  hypothetical protein  56.13 
 
 		 333 aa  291  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.482216  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2667  peptidase S58, DmpA  54.57 
 
 		 340 aa  289  4e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2889  putative peptidase  59.02 
 
 		 327 aa  288  8e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00143546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0620  peptidase S58, DmpA  55.35 
 
 		 327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.975766  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0463  peptidase S58, DmpA  56.7 
 
 		 331 aa  266  4e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4655  peptidase S58 DmpA  49.29 
 
 		 347 aa  265  7e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.505511 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0311  peptidase S58 DmpA  52.21 
 
 		 345 aa  259  4e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2797  peptidase S58 DmpA  43.92 
 
 		 331 aa  226  3e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3189  peptidase S58 DmpA  53.05 
 
 		 339 aa  225  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2943  peptidase S58 DmpA  48.8 
 
 		 323 aa  219  7e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0317  hypothetical protein  43.45 
 
 		 368 aa  212  9e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29210  L-aminopeptidase/D-esterase  49.85 
 
 		 345 aa  211  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0349  hypothetical protein  42.86 
 
 		 368 aa  211  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0168  peptidase S58 DmpA  39.52 
 
 		 319 aa  209  4e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3228  peptidase S58, DmpA  46.42 
 
 		 318 aa  205  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3716  peptidase S58 DmpA  45.97 
 
 		 329 aa  204  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00511947 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3050  peptidase S58 DmpA  41 
 
 		 363 aa  203  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578156  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0087  peptidase S58 DmpA  42.41 
 
 		 313 aa  199  5e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1675  T4 family peptidase  37.15 
 
 		 325 aa  194  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135147  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3851  peptidase S58, DmpA  49.83 
 
 		 340 aa  192  9e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3925  peptidase S58, DmpA  49.83 
 
 		 340 aa  192  9e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3837  peptidase S58, DmpA  49.83 
 
 		 340 aa  192  9e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.449487  normal  0.0858293 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1410  T4 family peptidase  35.62 
 
 		 325 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568813  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2906  peptidase S58 DmpA  46.74 
 
 		 336 aa  190  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174879 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1669  peptidase S58, DmpA  45.33 
 
 		 334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0482  peptidase S58 DmpA  37.74 
 
 		 316 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000526803  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2351  peptidase S58, DmpA  49.31 
 
 		 340 aa  182  7e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3677  peptidase S58 DmpA  44.89 
 
 		 350 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1959  peptidase S58, DmpA  45.54 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4294  peptidase S58, DmpA  51.2 
 
 		 340 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1077  peptidase S58 DmpA  34.47 
 
 		 328 aa  176  5e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.234138  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2221  peptidase S58 DmpA  35.42 
 
 		 361 aa  175  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010872  hitchhiker  4.545e-18 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1804  peptidase S58, DmpA  46.79 
 
 		 350 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374201 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2605  peptidase S58, DmpA  43.81 
 
 		 337 aa  168  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.47844 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1203  peptidase S58 DmpA  43.47 
 
 		 337 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.794666  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2004  peptidase S58 DmpA  44.52 
 
 		 334 aa  166  5.9999999999999996e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00577301  hitchhiker  0.0000000124631 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2945  peptidase S58, DmpA  41.76 
 
 		 349 aa  163  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11365  hydrolase  47.78 
 
 		 344 aa  159  8e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003196  normal  0.48244 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2133  peptidase S58, DmpA  42.94 
 
 		 301 aa  158  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.74532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3246  peptidase S58, DmpA  39.66 
 
 		 322 aa  159  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04100  L-aminopeptidase/D-esterase  44 
 
 		 348 aa  154  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.037097 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2660  peptidase S58 DmpA  42.72 
 
 		 322 aa  150  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1962  peptidase S58 DmpA  42.48 
 
 		 352 aa  147  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3087  peptidase S58 DmpA  41.9 
 
 		 291 aa  145  7.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.145217 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0198  peptidase S58 DmpA  40.82 
 
 		 287 aa  142  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2319  peptidase S58 DmpA  40.34 
 
 		 361 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212071  decreased coverage  0.00000119169 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4346  peptidase S58 DmpA  41.34 
 
 		 299 aa  120  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1456  peptidase S58 DmpA  39.36 
 
 		 300 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.749732  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2376  peptidase S58 DmpA  31.56 
 
 		 282 aa  113  6e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.90605  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2264  peptidase S58 DmpA  38.81 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6005  peptidase S58, DmpA  32.35 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4594  peptidase S58, DmpA  31.79 
 
 		 354 aa  67  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3106  peptidase S58, DmpA  30.07 
 
 		 364 aa  60.5  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3006  peptidase S58 DmpA  31.31 
 
 		 350 aa  59.3  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45210  hypothetical protein  34.39 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3840  hypothetical protein  34.39 
 
 		 366 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3094  peptidase S58 DmpA  28.84 
 
 		 352 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0856606  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2326  peptidase  32.8 
 
 		 376 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0136  aminopeptidase DmpA  31.1 
 
 		 358 aa  55.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1108  putative D-aminopeptidase  32.5 
 
 		 376 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1022  putative D-aminopeptidase  32.5 
 
 		 376 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4222  peptidase S58 DmpA  36.57 
 
 		 352 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0531  D-aminopeptidase, putative  28.78 
 
 		 340 aa  54.3  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1007  peptidase S58, DmpA  50 
 
 		 204 aa  53.9  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442944  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0461  putative D-aminopeptidase  28.78 
 
 		 340 aa  53.9  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.509897  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3384  peptidase S58, DmpA  37.93 
 
 		 394 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266715 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0592  putative D-aminopeptidase  32.48 
 
 		 376 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0875  putative D-aminopeptidase  32.48 
 
 		 376 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1842  putative D-aminopeptidase  32.48 
 
 		 376 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1923  aminopeptidase DmpA  29.94 
 
 		 346 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0839  aminopeptidase DmpA  40.46 
 
 		 364 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0193478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5206  aminopeptidase DmpA  28.62 
 
 		 367 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5294  aminopeptidase DmpA  28.62 
 
 		 367 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.660356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5586  aminopeptidase DmpA  28.62 
 
 		 367 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.237816 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3141  peptidase S58, DmpA  36.88 
 
 		 393 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.478527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2891  peptidase S58 DmpA  23.33 
 
 		 373 aa  50.8  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3656  aminopeptidase DmpA  28.96 
 
 		 371 aa  50.1  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.950122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1419  peptidase S58 DmpA  26.23 
 
 		 463 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6180  peptidase S58 DmpA  28.68 
 
 		 375 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>