74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1675 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1410  T4 family peptidase  97.23 
 
 		 325 aa  640    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568813  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1675  T4 family peptidase  100 
 
 		 325 aa  655    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135147  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1077  peptidase S58 DmpA  52.91 
 
 		 328 aa  329  4e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.234138  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0349  hypothetical protein  50.93 
 
 		 368 aa  302  6.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0317  hypothetical protein  50.62 
 
 		 368 aa  300  3e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3050  peptidase S58 DmpA  52.09 
 
 		 363 aa  298  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578156  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2221  peptidase S58 DmpA  43.54 
 
 		 361 aa  291  1e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010872  hitchhiker  4.545e-18 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0168  peptidase S58 DmpA  48.45 
 
 		 319 aa  287  2e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0482  peptidase S58 DmpA  47.12 
 
 		 316 aa  269  5e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000526803  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3677  peptidase S58 DmpA  44.3 
 
 		 350 aa  265  7e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2943  peptidase S58 DmpA  44.55 
 
 		 323 aa  263  3e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1959  peptidase S58, DmpA  46.93 
 
 		 306 aa  257  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1669  peptidase S58, DmpA  44.93 
 
 		 334 aa  255  8e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0087  peptidase S58 DmpA  45.95 
 
 		 313 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3716  peptidase S58 DmpA  43.95 
 
 		 329 aa  251  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00511947 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2906  peptidase S58 DmpA  44.98 
 
 		 336 aa  251  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174879 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3228  peptidase S58, DmpA  44.01 
 
 		 318 aa  243  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2797  peptidase S58 DmpA  43.33 
 
 		 331 aa  240  2e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2605  peptidase S58, DmpA  42.72 
 
 		 337 aa  232  8.000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.47844 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1203  peptidase S58 DmpA  42.72 
 
 		 337 aa  231  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.794666  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2004  peptidase S58 DmpA  40.24 
 
 		 334 aa  229  5e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00577301  hitchhiker  0.0000000124631 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1804  peptidase S58, DmpA  42.27 
 
 		 350 aa  229  5e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374201 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3246  peptidase S58, DmpA  43.75 
 
 		 322 aa  227  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2133  peptidase S58, DmpA  36.74 
 
 		 301 aa  191  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.74532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2093  peptidase S58 DmpA  36.84 
 
 		 363 aa  188  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201096  normal  0.024132 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1287  peptidase S58, DmpA  39.87 
 
 		 335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0721739  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2156  peptidase S58 DmpA  37.66 
 
 		 340 aa  183  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4768  peptidase S58 DmpA  37.73 
 
 		 329 aa  182  6e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1488  peptidase S58 DmpA  39.37 
 
 		 335 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0291995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0972  peptidase S58 DmpA  37.07 
 
 		 358 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.898884  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4248  peptidase S58 DmpA  39.18 
 
 		 329 aa  179  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4294  peptidase S58, DmpA  37.43 
 
 		 340 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2351  peptidase S58, DmpA  36.34 
 
 		 340 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4618  peptidase S58 DmpA  38.85 
 
 		 329 aa  176  6e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0772  peptidase S58, DmpA  38.17 
 
 		 356 aa  176  6e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.904933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4121  peptidase S58 DmpA  36.68 
 
 		 353 aa  176  7e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246913  normal  0.677622 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1091  peptidase S58 DmpA  36.56 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3837  peptidase S58, DmpA  35.55 
 
 		 340 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.449487  normal  0.0858293 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3925  peptidase S58, DmpA  35.55 
 
 		 340 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3851  peptidase S58, DmpA  35.55 
 
 		 340 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0198  peptidase S58 DmpA  36.75 
 
 		 287 aa  172  5e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29210  L-aminopeptidase/D-esterase  35.47 
 
 		 345 aa  172  9e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3087  peptidase S58 DmpA  35.64 
 
 		 291 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.145217 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0311  peptidase S58 DmpA  36.89 
 
 		 345 aa  170  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2683  peptidase S58 DmpA  35.26 
 
 		 342 aa  169  8e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11365  hydrolase  37.85 
 
 		 344 aa  166  5e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003196  normal  0.48244 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2667  peptidase S58, DmpA  35.33 
 
 		 340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2889  putative peptidase  37.77 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00143546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4338  peptidase S58 DmpA  34.52 
 
 		 334 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1616  peptidase S58, DmpA  34.88 
 
 		 332 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3687  peptidase S58, DmpA  34.82 
 
 		 331 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0620  peptidase S58, DmpA  36.68 
 
 		 327 aa  159  7e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.975766  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1456  peptidase S58 DmpA  35.83 
 
 		 300 aa  159  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.749732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4655  peptidase S58 DmpA  34.43 
 
 		 347 aa  158  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.505511 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1773  peptidase S58, DmpA  35.38 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.800376  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1962  peptidase S58 DmpA  35.91 
 
 		 352 aa  158  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2945  peptidase S58, DmpA  34.53 
 
 		 349 aa  155  8e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2617  peptidase S58, DmpA  34.48 
 
 		 332 aa  151  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5330  hypothetical protein  33.23 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12369  normal  0.395647 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2215  peptidase S58, DmpA  32.44 
 
 		 332 aa  149  9e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4493  peptidase S58 DmpA  35.58 
 
 		 331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3882  hypothetical protein  35.49 
 
 		 333 aa  146  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.482216  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4203  peptidase S58 DmpA  35.24 
 
 		 331 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2660  peptidase S58 DmpA  34.98 
 
 		 322 aa  144  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2376  peptidase S58 DmpA  32.45 
 
 		 282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.90605  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0463  peptidase S58, DmpA  34.33 
 
 		 331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3189  peptidase S58 DmpA  37.91 
 
 		 339 aa  136  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2319  peptidase S58 DmpA  31.47 
 
 		 361 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212071  decreased coverage  0.00000119169 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04100  L-aminopeptidase/D-esterase  34.45 
 
 		 348 aa  129  8.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.037097 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6005  peptidase S58, DmpA  29.71 
 
 		 330 aa  106  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2021  hypothetical protein  59.68 
 
 		 62 aa  92.8  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2264  peptidase S58 DmpA  31.79 
 
 		 311 aa  90.5  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4346  peptidase S58 DmpA  47.83 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1007  peptidase S58, DmpA  48.19 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>