73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2133 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2133  peptidase S58, DmpA  100 
 
 
301 aa  582  1.0000000000000001e-165  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.74532  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3087  peptidase S58 DmpA  66.21 
 
 
291 aa  310  2.9999999999999997e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.145217 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0168  peptidase S58 DmpA  44.52 
 
 
319 aa  229  5e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0087  peptidase S58 DmpA  45.37 
 
 
313 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3716  peptidase S58 DmpA  45.19 
 
 
329 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00511947 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1410  T4 family peptidase  36.42 
 
 
325 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568813  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1675  T4 family peptidase  36.74 
 
 
325 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135147  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3228  peptidase S58, DmpA  45.95 
 
 
318 aa  189  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0317  hypothetical protein  41.48 
 
 
368 aa  189  4e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0349  hypothetical protein  41.48 
 
 
368 aa  188  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2943  peptidase S58 DmpA  44.37 
 
 
323 aa  188  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3050  peptidase S58 DmpA  41.16 
 
 
363 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578156  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0482  peptidase S58 DmpA  37.29 
 
 
316 aa  185  9e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000526803  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1669  peptidase S58, DmpA  45.09 
 
 
334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1959  peptidase S58, DmpA  48.65 
 
 
306 aa  182  8.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3677  peptidase S58 DmpA  41.77 
 
 
350 aa  182  9.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2906  peptidase S58 DmpA  45.09 
 
 
336 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0174879 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0198  peptidase S58 DmpA  45.42 
 
 
287 aa  180  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1804  peptidase S58, DmpA  44.34 
 
 
350 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.374201 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1203  peptidase S58 DmpA  43.51 
 
 
337 aa  166  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.794666  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2605  peptidase S58, DmpA  43.18 
 
 
337 aa  165  8e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.47844 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3246  peptidase S58, DmpA  39.49 
 
 
322 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2797  peptidase S58 DmpA  38.36 
 
 
331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1077  peptidase S58 DmpA  36.14 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.234138  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2945  peptidase S58, DmpA  41.12 
 
 
349 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2093  peptidase S58 DmpA  42.94 
 
 
363 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201096  normal  0.024132 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2156  peptidase S58 DmpA  43.92 
 
 
340 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2221  peptidase S58 DmpA  41.29 
 
 
361 aa  149  6e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010872  hitchhiker  4.545e-18 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0972  peptidase S58 DmpA  43.92 
 
 
358 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.898884  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1287  peptidase S58, DmpA  41.78 
 
 
335 aa  142  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0721739  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2351  peptidase S58, DmpA  43.71 
 
 
340 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260537  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2004  peptidase S58 DmpA  36.65 
 
 
334 aa  139  7.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00577301  hitchhiker  0.0000000124631 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4338  peptidase S58 DmpA  38.79 
 
 
334 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1488  peptidase S58 DmpA  40.48 
 
 
335 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0291995 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1773  peptidase S58, DmpA  40.12 
 
 
331 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.800376  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4294  peptidase S58, DmpA  44.6 
 
 
340 aa  136  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1456  peptidase S58 DmpA  39.86 
 
 
300 aa  135  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.749732  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0772  peptidase S58, DmpA  39.73 
 
 
356 aa  135  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.904933  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29210  L-aminopeptidase/D-esterase  40.93 
 
 
345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2667  peptidase S58, DmpA  39.47 
 
 
340 aa  133  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2617  peptidase S58, DmpA  40.24 
 
 
332 aa  132  7.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0620  peptidase S58, DmpA  39.5 
 
 
327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.975766  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3925  peptidase S58, DmpA  42.86 
 
 
340 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1616  peptidase S58, DmpA  39.26 
 
 
332 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108778  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3851  peptidase S58, DmpA  42.86 
 
 
340 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3837  peptidase S58, DmpA  42.86 
 
 
340 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.449487  normal  0.0858293 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3687  peptidase S58, DmpA  39.33 
 
 
331 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5330  hypothetical protein  40.8 
 
 
332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12369  normal  0.395647 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2660  peptidase S58 DmpA  37.06 
 
 
322 aa  126  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2889  putative peptidase  39.8 
 
 
327 aa  125  8.000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00143546  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4248  peptidase S58 DmpA  41.18 
 
 
329 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0836973  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4121  peptidase S58 DmpA  37.28 
 
 
353 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246913  normal  0.677622 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4768  peptidase S58 DmpA  40.44 
 
 
329 aa  123  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49009  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4618  peptidase S58 DmpA  41.18 
 
 
329 aa  123  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1091  peptidase S58 DmpA  35.51 
 
 
328 aa  122  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3189  peptidase S58 DmpA  41.22 
 
 
339 aa  122  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2215  peptidase S58, DmpA  38.91 
 
 
332 aa  122  6e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0463  peptidase S58, DmpA  41.5 
 
 
331 aa  122  7e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2376  peptidase S58 DmpA  34.52 
 
 
282 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.90605  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2683  peptidase S58 DmpA  34.14 
 
 
342 aa  119  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04100  L-aminopeptidase/D-esterase  40.07 
 
 
348 aa  119  6e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.037097 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4655  peptidase S58 DmpA  35.31 
 
 
347 aa  112  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.505511 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11365  hydrolase  38.1 
 
 
344 aa  106  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003196  normal  0.48244 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4493  peptidase S58 DmpA  34.31 
 
 
331 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1962  peptidase S58 DmpA  34.25 
 
 
352 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4203  peptidase S58 DmpA  36.2 
 
 
331 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0311  peptidase S58 DmpA  37.88 
 
 
345 aa  96.7  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3882  hypothetical protein  34.95 
 
 
333 aa  94.7  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.482216  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6005  peptidase S58, DmpA  30.65 
 
 
330 aa  89  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2319  peptidase S58 DmpA  47.41 
 
 
361 aa  84.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212071  decreased coverage  0.00000119169 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4346  peptidase S58 DmpA  42.24 
 
 
299 aa  61.2  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2264  peptidase S58 DmpA  37.45 
 
 
311 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1007  peptidase S58, DmpA  44.79 
 
 
204 aa  49.7  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>