114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3687 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3687  peptidase S58, DmpA  100 
 
 		 331 aa  655    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1773  peptidase S58, DmpA  93.05 
 
 		 331 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.800376  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4338  peptidase S58 DmpA  86.06 
 
 		 334 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1616  peptidase S58, DmpA  74.1 
 
 		 332 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2215  peptidase S58, DmpA  74.7 
 
 		 332 aa  483  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2617  peptidase S58, DmpA  72.59 
 
 		 332 aa  464  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5330  hypothetical protein  70.91 
 
 		 332 aa  449  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12369  normal  0.395647 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2683  peptidase S58 DmpA  58.13 
 
 		 342 aa  375  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0972  peptidase S58 DmpA  61.14 
 
 		 358 aa  374  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.898884  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2093  peptidase S58 DmpA  60.24 
 
 		 363 aa  364  1e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201096  normal  0.024132 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4768  peptidase S58 DmpA  61.59 
 
 		 329 aa  361  8e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4618  peptidase S58 DmpA  61.89 
 
 		 329 aa  349  3e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4248  peptidase S58 DmpA  61.59 
 
 		 329 aa  348  6e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2156  peptidase S58 DmpA  61.36 
 
 		 340 aa  348  6e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1091  peptidase S58 DmpA  56.5 
 
 		 328 aa  344  1e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4121  peptidase S58 DmpA  55.39 
 
 		 353 aa  334  1e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246913  normal  0.677622 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4493  peptidase S58 DmpA  57.88 
 
 		 331 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4203  peptidase S58 DmpA  58.48 
 
 		 331 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3882  hypothetical protein  55.66 
 
 		 333 aa  315  9.999999999999999e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.482216  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1287  peptidase S58, DmpA  52.74 
 
 		 335 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0721739  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1488  peptidase S58 DmpA  51.82 
 
 		 335 aa  297  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0291995 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0772  peptidase S58, DmpA  51.43 
 
 		 356 aa  284  2.0000000000000002e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.904933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2889  putative peptidase  51.84 
 
 		 327 aa  281  9e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00143546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2667  peptidase S58, DmpA  48.82 
 
 		 340 aa  267  1e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0620  peptidase S58, DmpA  51.98 
 
 		 327 aa  265  8e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.975766  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0311  peptidase S58 DmpA  45.4 
 
 		 345 aa  260  3e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4655  peptidase S58 DmpA  48.04 
 
 		 347 aa  257  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.505511 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0463  peptidase S58, DmpA  48.3 
 
 		 331 aa  238  1e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3189  peptidase S58 DmpA  49.85 
 
 		 339 aa  233  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2797  peptidase S58 DmpA  40.12 
 
 		 331 aa  205  9e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2943  peptidase S58 DmpA  42.56 
 
 		 323 aa  203  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3716  peptidase S58 DmpA  42.25 
 
 		 329 aa  199  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00511947 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0317  hypothetical protein  40.77 
 
 		 368 aa  195  8.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0349  hypothetical protein  40.59 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3228  peptidase S58, DmpA  42.06 
 
 		 318 aa  193  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3050  peptidase S58 DmpA  40.64 
 
 		 363 aa  193  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578156  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2351  peptidase S58, DmpA  43.73 
 
 		 340 aa  189  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0168  peptidase S58 DmpA  38.81 
 
 		 319 aa  189  5e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3851  peptidase S58, DmpA  42.42 
 
 		 340 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3925  peptidase S58, DmpA  42.42 
 
 		 340 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3837  peptidase S58, DmpA  42.42 
 
 		 340 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.449487  normal  0.0858293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4294  peptidase S58, DmpA  43.43 
 
 		 340 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3677  peptidase S58 DmpA  41.23 
 
 		 350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29210  L-aminopeptidase/D-esterase  41.86 
 
 		 345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0087  peptidase S58 DmpA  38.41 
 
 		 313 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0482  peptidase S58 DmpA  34.91 
 
 		 316 aa  171  2e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000526803  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1675  T4 family peptidase  34.82 
 
 		 325 aa  170  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135147  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1410  T4 family peptidase  34.82 
 
 		 325 aa  169  6e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568813  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1077  peptidase S58 DmpA  36.36 
 
 		 328 aa  169  6e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.234138  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1959  peptidase S58, DmpA  41.21 
 
 		 306 aa  169  9e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11365  hydrolase  40.46 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003196  normal  0.48244 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2945  peptidase S58, DmpA  37.65 
 
 		 349 aa  162  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2906  peptidase S58 DmpA  40.56 
 
 		 336 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174879 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2605  peptidase S58, DmpA  36.56 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.47844 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1203  peptidase S58 DmpA  35.94 
 
 		 337 aa  156  6e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.794666  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1804  peptidase S58, DmpA  38.07 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374201 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1669  peptidase S58, DmpA  38.16 
 
 		 334 aa  154  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2221  peptidase S58 DmpA  33.42 
 
 		 361 aa  151  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010872  hitchhiker  4.545e-18 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3246  peptidase S58, DmpA  36.98 
 
 		 322 aa  149  7e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2660  peptidase S58 DmpA  38.89 
 
 		 322 aa  149  7e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2133  peptidase S58, DmpA  40.43 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.74532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04100  L-aminopeptidase/D-esterase  39.8 
 
 		 348 aa  142  7e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.037097 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1962  peptidase S58 DmpA  38.1 
 
 		 352 aa  139  4.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2004  peptidase S58 DmpA  34.71 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00577301  hitchhiker  0.0000000124631 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2319  peptidase S58 DmpA  39.77 
 
 		 361 aa  132  7.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212071  decreased coverage  0.00000119169 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3087  peptidase S58 DmpA  38.85 
 
 		 291 aa  130  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.145217 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0198  peptidase S58 DmpA  37.18 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1456  peptidase S58 DmpA  34.59 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.749732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2264  peptidase S58 DmpA  35.61 
 
 		 311 aa  97.1  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2376  peptidase S58 DmpA  31.65 
 
 		 282 aa  94  4e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.90605  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6005  peptidase S58, DmpA  31.49 
 
 		 330 aa  92.4  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4346  peptidase S58 DmpA  32.49 
 
 		 299 aa  75.9  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4594  peptidase S58, DmpA  28.86 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45210  hypothetical protein  28.9 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3840  hypothetical protein  28.34 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0592  putative D-aminopeptidase  31.92 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0875  putative D-aminopeptidase  31.92 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1842  putative D-aminopeptidase  31.92 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3006  peptidase S58 DmpA  26.63 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2448  aminopeptidase DmpA  28.89 
 
 		 489 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.357188  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1411  peptidase S58 DmpA  28.25 
 
 		 489 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1507  peptidase S58 DmpA  28.25 
 
 		 489 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1108  putative D-aminopeptidase  31.6 
 
 		 376 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1022  putative D-aminopeptidase  31.6 
 
 		 376 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2326  peptidase  31.6 
 
 		 376 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4401  peptidase S58 DmpA  27.71 
 
 		 360 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0304  peptidase S58 DmpA  28.52 
 
 		 345 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6180  peptidase S58 DmpA  28.38 
 
 		 375 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4112  peptidase S58 DmpA  28.01 
 
 		 358 aa  54.3  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.971314  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1650  D-aminopeptidase, putative  30.94 
 
 		 407 aa  53.1  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1419  peptidase S58 DmpA  26.98 
 
 		 463 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4222  peptidase S58 DmpA  27.99 
 
 		 352 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4211  peptidase S58 DmpA  30.54 
 
 		 369 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.131306 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3106  peptidase S58, DmpA  27.47 
 
 		 364 aa  50.1  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0995  aminopeptidase DmpA  35.2 
 
 		 387 aa  49.7  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1684  aminopeptidase DmpA  30.2 
 
 		 369 aa  49.7  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  0.901493 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4044  peptidase S58, DmpA  30.2 
 
 		 369 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181806  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4322  peptidase S58, DmpA  30.2 
 
 		 369 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.810072  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3199  peptidase S58 DmpA  30.2 
 
 		 369 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1923  aminopeptidase DmpA  27.71 
 
 		 346 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>