123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1773 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1773  peptidase S58, DmpA  100 
 
 		 331 aa  650    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.800376  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3687  peptidase S58, DmpA  93.05 
 
 		 331 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4338  peptidase S58 DmpA  86.97 
 
 		 334 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2215  peptidase S58, DmpA  75.9 
 
 		 332 aa  488  1e-137  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1616  peptidase S58, DmpA  75 
 
 		 332 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2617  peptidase S58, DmpA  74.4 
 
 		 332 aa  475  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5330  hypothetical protein  71.82 
 
 		 332 aa  456  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12369  normal  0.395647 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2683  peptidase S58 DmpA  58.73 
 
 		 342 aa  378  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0972  peptidase S58 DmpA  61.75 
 
 		 358 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.898884  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2093  peptidase S58 DmpA  61.14 
 
 		 363 aa  365  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201096  normal  0.024132 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4768  peptidase S58 DmpA  61.03 
 
 		 329 aa  351  1e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2156  peptidase S58 DmpA  61.36 
 
 		 340 aa  345  4e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1091  peptidase S58 DmpA  56.16 
 
 		 328 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4618  peptidase S58 DmpA  60.98 
 
 		 329 aa  339  5e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4248  peptidase S58 DmpA  60.67 
 
 		 329 aa  338  9e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4121  peptidase S58 DmpA  55.39 
 
 		 353 aa  328  8e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246913  normal  0.677622 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4493  peptidase S58 DmpA  57.27 
 
 		 331 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3882  hypothetical protein  55.96 
 
 		 333 aa  315  8e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.482216  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4203  peptidase S58 DmpA  58.48 
 
 		 331 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1287  peptidase S58, DmpA  54.27 
 
 		 335 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0721739  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0772  peptidase S58, DmpA  52.38 
 
 		 356 aa  295  6e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.904933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1488  peptidase S58 DmpA  52.42 
 
 		 335 aa  295  9e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0291995 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2889  putative peptidase  51.68 
 
 		 327 aa  280  3e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00143546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2667  peptidase S58, DmpA  48.81 
 
 		 340 aa  268  1e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4655  peptidase S58 DmpA  47.9 
 
 		 347 aa  261  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.505511 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0620  peptidase S58, DmpA  51.68 
 
 		 327 aa  258  9e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.975766  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0311  peptidase S58 DmpA  44.81 
 
 		 345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0463  peptidase S58, DmpA  47.37 
 
 		 331 aa  239  4e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3189  peptidase S58 DmpA  50.76 
 
 		 339 aa  233  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2797  peptidase S58 DmpA  40 
 
 		 331 aa  208  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3716  peptidase S58 DmpA  42.9 
 
 		 329 aa  202  9e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00511947 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2943  peptidase S58 DmpA  42.17 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3851  peptidase S58, DmpA  42.57 
 
 		 340 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3925  peptidase S58, DmpA  42.57 
 
 		 340 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3837  peptidase S58, DmpA  42.57 
 
 		 340 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.449487  normal  0.0858293 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3228  peptidase S58, DmpA  41.18 
 
 		 318 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2351  peptidase S58, DmpA  42.71 
 
 		 340 aa  189  8e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0317  hypothetical protein  40.23 
 
 		 368 aa  188  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0349  hypothetical protein  40.23 
 
 		 368 aa  186  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3050  peptidase S58 DmpA  40.12 
 
 		 363 aa  186  7e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578156  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4294  peptidase S58, DmpA  43.39 
 
 		 340 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29210  L-aminopeptidase/D-esterase  41.86 
 
 		 345 aa  179  5.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0168  peptidase S58 DmpA  37.31 
 
 		 319 aa  179  8e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2945  peptidase S58, DmpA  38.24 
 
 		 349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3677  peptidase S58 DmpA  42.77 
 
 		 350 aa  172  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11365  hydrolase  41.21 
 
 		 344 aa  169  7e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003196  normal  0.48244 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0087  peptidase S58 DmpA  36.59 
 
 		 313 aa  169  9e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1675  T4 family peptidase  35.38 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135147  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1077  peptidase S58 DmpA  35.45 
 
 		 328 aa  166  4e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.234138  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1410  T4 family peptidase  34.77 
 
 		 325 aa  166  5e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568813  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1959  peptidase S58, DmpA  40.89 
 
 		 306 aa  163  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0482  peptidase S58 DmpA  33.96 
 
 		 316 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000526803  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2906  peptidase S58 DmpA  40.62 
 
 		 336 aa  162  9e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174879 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2605  peptidase S58, DmpA  40.77 
 
 		 337 aa  153  5e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.47844 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1962  peptidase S58 DmpA  38.69 
 
 		 352 aa  151  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1804  peptidase S58, DmpA  38.64 
 
 		 350 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374201 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1669  peptidase S58, DmpA  38.49 
 
 		 334 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1203  peptidase S58 DmpA  40.06 
 
 		 337 aa  151  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.794666  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2133  peptidase S58, DmpA  40.12 
 
 		 301 aa  150  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.74532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2221  peptidase S58 DmpA  34.25 
 
 		 361 aa  150  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010872  hitchhiker  4.545e-18 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2660  peptidase S58 DmpA  39.51 
 
 		 322 aa  150  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3246  peptidase S58, DmpA  36.8 
 
 		 322 aa  150  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04100  L-aminopeptidase/D-esterase  40.86 
 
 		 348 aa  149  6e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.037097 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2319  peptidase S58 DmpA  39.11 
 
 		 361 aa  136  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212071  decreased coverage  0.00000119169 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3087  peptidase S58 DmpA  37.84 
 
 		 291 aa  132  6e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.145217 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2004  peptidase S58 DmpA  33.63 
 
 		 334 aa  131  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00577301  hitchhiker  0.0000000124631 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0198  peptidase S58 DmpA  37.98 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1456  peptidase S58 DmpA  36.52 
 
 		 300 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.749732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2264  peptidase S58 DmpA  36.9 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2376  peptidase S58 DmpA  30.98 
 
 		 282 aa  94  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.90605  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6005  peptidase S58, DmpA  30.74 
 
 		 330 aa  88.2  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4346  peptidase S58 DmpA  34.07 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3006  peptidase S58 DmpA  27.25 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4594  peptidase S58, DmpA  30.69 
 
 		 354 aa  64.7  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0592  putative D-aminopeptidase  30.39 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0875  putative D-aminopeptidase  30.39 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1842  putative D-aminopeptidase  30.39 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45210  hypothetical protein  32.26 
 
 		 366 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2326  peptidase  30.5 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3106  peptidase S58, DmpA  27.54 
 
 		 364 aa  58.9  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1108  putative D-aminopeptidase  30.39 
 
 		 376 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1022  putative D-aminopeptidase  30.39 
 
 		 376 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3840  hypothetical protein  32.26 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1923  aminopeptidase DmpA  28.36 
 
 		 346 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0136  aminopeptidase DmpA  29.58 
 
 		 358 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1650  D-aminopeptidase, putative  30.39 
 
 		 407 aa  55.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4401  peptidase S58 DmpA  28.01 
 
 		 360 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4222  peptidase S58 DmpA  27.4 
 
 		 352 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6180  peptidase S58 DmpA  28.87 
 
 		 375 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4112  peptidase S58 DmpA  28.01 
 
 		 358 aa  53.5  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.971314  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0304  peptidase S58 DmpA  27.95 
 
 		 345 aa  53.1  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4211  peptidase S58 DmpA  31.41 
 
 		 369 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.131306 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1684  aminopeptidase DmpA  30.98 
 
 		 369 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  0.901493 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2448  aminopeptidase DmpA  27.74 
 
 		 489 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.357188  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0995  aminopeptidase DmpA  34.4 
 
 		 387 aa  50.8  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1411  peptidase S58 DmpA  27.4 
 
 		 489 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1507  peptidase S58 DmpA  27.4 
 
 		 489 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4044  peptidase S58, DmpA  30.98 
 
 		 369 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181806  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4322  peptidase S58, DmpA  30.98 
 
 		 369 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.810072  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3199  peptidase S58 DmpA  30.98 
 
 		 369 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448482  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>