109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2319 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2319  peptidase S58 DmpA  100 
 
 		 361 aa  687    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212071  decreased coverage  0.00000119169 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2797  peptidase S58 DmpA  45.61 
 
 		 331 aa  223  6e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2945  peptidase S58, DmpA  43.73 
 
 		 349 aa  204  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2351  peptidase S58, DmpA  48.14 
 
 		 340 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3677  peptidase S58 DmpA  45.13 
 
 		 350 aa  189  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29210  L-aminopeptidase/D-esterase  42.54 
 
 		 345 aa  188  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3716  peptidase S58 DmpA  43.11 
 
 		 329 aa  187  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00511947 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2943  peptidase S58 DmpA  44.15 
 
 		 323 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2667  peptidase S58, DmpA  41.92 
 
 		 340 aa  182  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3050  peptidase S58 DmpA  39.09 
 
 		 363 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578156  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2906  peptidase S58 DmpA  45.11 
 
 		 336 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174879 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4618  peptidase S58 DmpA  45.18 
 
 		 329 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4121  peptidase S58 DmpA  45.69 
 
 		 353 aa  179  4.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246913  normal  0.677622 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4768  peptidase S58 DmpA  42.54 
 
 		 329 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4294  peptidase S58, DmpA  43.28 
 
 		 340 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3228  peptidase S58, DmpA  42.73 
 
 		 318 aa  179  8e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3851  peptidase S58, DmpA  43.21 
 
 		 340 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3925  peptidase S58, DmpA  43.21 
 
 		 340 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3837  peptidase S58, DmpA  43.21 
 
 		 340 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.449487  normal  0.0858293 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4248  peptidase S58 DmpA  44.85 
 
 		 329 aa  179  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2156  peptidase S58 DmpA  48.21 
 
 		 340 aa  178  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0772  peptidase S58, DmpA  42.61 
 
 		 356 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.904933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0317  hypothetical protein  40.35 
 
 		 368 aa  177  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0972  peptidase S58 DmpA  43.66 
 
 		 358 aa  176  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.898884  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0349  hypothetical protein  40.35 
 
 		 368 aa  176  8e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2660  peptidase S58 DmpA  41.08 
 
 		 322 aa  172  5.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2605  peptidase S58, DmpA  45.4 
 
 		 337 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.47844 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0168  peptidase S58 DmpA  37.32 
 
 		 319 aa  170  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4338  peptidase S58 DmpA  38.97 
 
 		 334 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1203  peptidase S58 DmpA  44.85 
 
 		 337 aa  170  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.794666  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2889  putative peptidase  43.01 
 
 		 327 aa  168  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00143546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1959  peptidase S58, DmpA  43.79 
 
 		 306 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1616  peptidase S58, DmpA  42.05 
 
 		 332 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1804  peptidase S58, DmpA  42.86 
 
 		 350 aa  165  9e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374201 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1669  peptidase S58, DmpA  43.77 
 
 		 334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11365  hydrolase  42.58 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003196  normal  0.48244 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2093  peptidase S58 DmpA  41.9 
 
 		 363 aa  164  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201096  normal  0.024132 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1077  peptidase S58 DmpA  34.08 
 
 		 328 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.234138  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1287  peptidase S58, DmpA  41.9 
 
 		 335 aa  162  6e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0721739  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0087  peptidase S58 DmpA  39.07 
 
 		 313 aa  162  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1675  T4 family peptidase  34.62 
 
 		 325 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135147  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0620  peptidase S58, DmpA  42.49 
 
 		 327 aa  161  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.975766  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5330  hypothetical protein  41.36 
 
 		 332 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12369  normal  0.395647 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4655  peptidase S58 DmpA  40.88 
 
 		 347 aa  161  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.505511 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2683  peptidase S58 DmpA  39.11 
 
 		 342 aa  161  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1773  peptidase S58, DmpA  39.32 
 
 		 331 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.800376  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0311  peptidase S58 DmpA  38.7 
 
 		 345 aa  160  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04100  L-aminopeptidase/D-esterase  46.98 
 
 		 348 aa  160  3e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.037097 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3687  peptidase S58, DmpA  39.77 
 
 		 331 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0482  peptidase S58 DmpA  36.01 
 
 		 316 aa  159  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000526803  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1410  T4 family peptidase  34.12 
 
 		 325 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568813  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1488  peptidase S58 DmpA  42.37 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0291995 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1962  peptidase S58 DmpA  37.88 
 
 		 352 aa  156  7e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2215  peptidase S58, DmpA  40.5 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2221  peptidase S58 DmpA  35.15 
 
 		 361 aa  155  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010872  hitchhiker  4.545e-18 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1091  peptidase S58 DmpA  40.29 
 
 		 328 aa  155  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3882  hypothetical protein  37.75 
 
 		 333 aa  152  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.482216  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0463  peptidase S58, DmpA  41.62 
 
 		 331 aa  152  8e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2617  peptidase S58, DmpA  40.73 
 
 		 332 aa  150  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2264  peptidase S58 DmpA  41.38 
 
 		 311 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2004  peptidase S58 DmpA  40.25 
 
 		 334 aa  142  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00577301  hitchhiker  0.0000000124631 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3246  peptidase S58, DmpA  37.34 
 
 		 322 aa  139  7e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3189  peptidase S58 DmpA  43.86 
 
 		 339 aa  139  8.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2133  peptidase S58, DmpA  37.17 
 
 		 301 aa  132  6e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.74532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4203  peptidase S58 DmpA  36.83 
 
 		 331 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4493  peptidase S58 DmpA  33.99 
 
 		 331 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0198  peptidase S58 DmpA  38.61 
 
 		 287 aa  119  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3087  peptidase S58 DmpA  36.77 
 
 		 291 aa  113  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.145217 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2376  peptidase S58 DmpA  29.13 
 
 		 282 aa  95.5  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.90605  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1456  peptidase S58 DmpA  35.14 
 
 		 300 aa  95.5  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.749732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6005  peptidase S58, DmpA  32.81 
 
 		 330 aa  72.4  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4346  peptidase S58 DmpA  47.52 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2417  peptidase S58 DmpA  30.17 
 
 		 365 aa  64.3  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0592  putative D-aminopeptidase  32.02 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0875  putative D-aminopeptidase  32.02 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1842  putative D-aminopeptidase  32.02 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2326  peptidase  32.33 
 
 		 376 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1108  putative D-aminopeptidase  32.33 
 
 		 376 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1022  putative D-aminopeptidase  32.33 
 
 		 376 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1007  peptidase S58, DmpA  52.38 
 
 		 204 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442944  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3533  peptidase S58, DmpA  30.65 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3656  aminopeptidase DmpA  28.11 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.950122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1650  D-aminopeptidase, putative  31 
 
 		 407 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3840  hypothetical protein  30.93 
 
 		 366 aa  57  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3844  D-aminopeptidase putative  28.88 
 
 		 377 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45210  hypothetical protein  30.93 
 
 		 366 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0605  peptidase S58 DmpA  30.84 
 
 		 369 aa  53.1  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6180  peptidase S58 DmpA  29.57 
 
 		 375 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0136  aminopeptidase DmpA  30.42 
 
 		 358 aa  52  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0995  aminopeptidase DmpA  31.54 
 
 		 387 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2464  aminopeptidase  30.37 
 
 		 348 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00184488  normal  0.106032 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3106  peptidase S58, DmpA  28.97 
 
 		 364 aa  47.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3384  peptidase S58, DmpA  29.94 
 
 		 394 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266715 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5706  peptidase S58 DmpA  26.79 
 
 		 375 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0304  peptidase S58 DmpA  28.96 
 
 		 345 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4288  peptidase S58 DmpA  30.12 
 
 		 369 aa  47.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.443184 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2046  peptidase S58 DmpA  27.14 
 
 		 376 aa  47.4  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173525  hitchhiker  0.00567247 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1411  peptidase S58, DmpA  31.25 
 
 		 352 aa  46.6  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.704657  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2448  aminopeptidase DmpA  25.94 
 
 		 489 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.357188  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4222  peptidase S58 DmpA  32 
 
 		 352 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>