108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2667 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2667  peptidase S58, DmpA  100 
 
 		 340 aa  670    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0772  peptidase S58, DmpA  66.17 
 
 		 356 aa  402  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.904933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2889  putative peptidase  67.06 
 
 		 327 aa  392  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00143546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0620  peptidase S58, DmpA  65.5 
 
 		 327 aa  375  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.975766  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1488  peptidase S58 DmpA  57.65 
 
 		 335 aa  329  3e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0291995 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1287  peptidase S58, DmpA  57.18 
 
 		 335 aa  322  5e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0721739  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0972  peptidase S58 DmpA  57.52 
 
 		 358 aa  308  8e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.898884  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2683  peptidase S58 DmpA  54.57 
 
 		 342 aa  298  7e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4768  peptidase S58 DmpA  56.93 
 
 		 329 aa  298  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4618  peptidase S58 DmpA  56.43 
 
 		 329 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4248  peptidase S58 DmpA  55.72 
 
 		 329 aa  289  6e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3882  hypothetical protein  54.93 
 
 		 333 aa  284  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.482216  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2093  peptidase S58 DmpA  53.98 
 
 		 363 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201096  normal  0.024132 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1091  peptidase S58 DmpA  52.29 
 
 		 328 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1616  peptidase S58, DmpA  51.93 
 
 		 332 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4655  peptidase S58 DmpA  51.44 
 
 		 347 aa  276  4e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.505511 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2156  peptidase S58 DmpA  52.69 
 
 		 340 aa  275  6e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4338  peptidase S58 DmpA  50.74 
 
 		 334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4493  peptidase S58 DmpA  52.63 
 
 		 331 aa  272  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4203  peptidase S58 DmpA  50.44 
 
 		 331 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4121  peptidase S58 DmpA  53.25 
 
 		 353 aa  264  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246913  normal  0.677622 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5330  hypothetical protein  50.89 
 
 		 332 aa  263  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12369  normal  0.395647 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2215  peptidase S58, DmpA  50.6 
 
 		 332 aa  261  1e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2617  peptidase S58, DmpA  51.04 
 
 		 332 aa  258  9e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3189  peptidase S58 DmpA  52.41 
 
 		 339 aa  258  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1773  peptidase S58, DmpA  49.11 
 
 		 331 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.800376  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0311  peptidase S58 DmpA  49.55 
 
 		 345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3687  peptidase S58, DmpA  48.52 
 
 		 331 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0463  peptidase S58, DmpA  50.74 
 
 		 331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2797  peptidase S58 DmpA  41.9 
 
 		 331 aa  200  3e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2351  peptidase S58, DmpA  48.5 
 
 		 340 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2943  peptidase S58 DmpA  44.91 
 
 		 323 aa  197  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3851  peptidase S58, DmpA  47.47 
 
 		 340 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3925  peptidase S58, DmpA  47.47 
 
 		 340 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3837  peptidase S58, DmpA  47.47 
 
 		 340 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.449487  normal  0.0858293 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3716  peptidase S58 DmpA  44.41 
 
 		 329 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00511947 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0482  peptidase S58 DmpA  38.15 
 
 		 316 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000526803  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4294  peptidase S58, DmpA  46.84 
 
 		 340 aa  183  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3228  peptidase S58, DmpA  43.69 
 
 		 318 aa  182  6e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0168  peptidase S58 DmpA  38.02 
 
 		 319 aa  181  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0087  peptidase S58 DmpA  39.88 
 
 		 313 aa  179  8e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3050  peptidase S58 DmpA  39.12 
 
 		 363 aa  178  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578156  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29210  L-aminopeptidase/D-esterase  42.37 
 
 		 345 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0317  hypothetical protein  39.31 
 
 		 368 aa  172  5.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0349  hypothetical protein  39.31 
 
 		 368 aa  172  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1669  peptidase S58, DmpA  42.7 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2906  peptidase S58 DmpA  42.18 
 
 		 336 aa  170  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174879 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1410  T4 family peptidase  35.63 
 
 		 325 aa  170  4e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568813  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3677  peptidase S58 DmpA  40.57 
 
 		 350 aa  169  7e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11365  hydrolase  44.88 
 
 		 344 aa  167  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003196  normal  0.48244 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1675  T4 family peptidase  35.33 
 
 		 325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135147  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1962  peptidase S58 DmpA  41.16 
 
 		 352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2605  peptidase S58, DmpA  39.77 
 
 		 337 aa  156  6e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.47844 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1203  peptidase S58 DmpA  39.3 
 
 		 337 aa  156  6e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.794666  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1804  peptidase S58, DmpA  40.57 
 
 		 350 aa  155  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374201 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1959  peptidase S58, DmpA  38.67 
 
 		 306 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2945  peptidase S58, DmpA  37.54 
 
 		 349 aa  152  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3246  peptidase S58, DmpA  34.97 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2004  peptidase S58 DmpA  38.33 
 
 		 334 aa  142  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00577301  hitchhiker  0.0000000124631 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2221  peptidase S58 DmpA  34.25 
 
 		 361 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010872  hitchhiker  4.545e-18 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1077  peptidase S58 DmpA  30.88 
 
 		 328 aa  139  6e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.234138  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3087  peptidase S58 DmpA  36.45 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.145217 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2319  peptidase S58 DmpA  41.92 
 
 		 361 aa  138  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212071  decreased coverage  0.00000119169 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2660  peptidase S58 DmpA  40.97 
 
 		 322 aa  137  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2133  peptidase S58, DmpA  39.47 
 
 		 301 aa  133  6e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.74532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04100  L-aminopeptidase/D-esterase  41.42 
 
 		 348 aa  132  6.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.037097 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0198  peptidase S58 DmpA  36.95 
 
 		 287 aa  129  7.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2376  peptidase S58 DmpA  28.98 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.90605  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1456  peptidase S58 DmpA  32.32 
 
 		 300 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.749732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6005  peptidase S58, DmpA  31.61 
 
 		 330 aa  90.9  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2264  peptidase S58 DmpA  35.98 
 
 		 311 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4346  peptidase S58 DmpA  48.28 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3844  D-aminopeptidase putative  27.3 
 
 		 377 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3974  peptidase S58 DmpA  28.25 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3533  peptidase S58, DmpA  27.53 
 
 		 372 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0143  peptidase S58 DmpA  28.9 
 
 		 352 aa  55.5  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0984939  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0592  putative D-aminopeptidase  32.09 
 
 		 376 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2326  peptidase  32.09 
 
 		 376 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0875  putative D-aminopeptidase  32.09 
 
 		 376 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1108  putative D-aminopeptidase  32.09 
 
 		 376 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1022  putative D-aminopeptidase  32.09 
 
 		 376 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1842  putative D-aminopeptidase  32.09 
 
 		 376 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3840  hypothetical protein  30.79 
 
 		 366 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45210  hypothetical protein  30.79 
 
 		 366 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1650  D-aminopeptidase, putative  29.84 
 
 		 407 aa  52.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1411  peptidase S58, DmpA  30.75 
 
 		 352 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.704657  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4594  peptidase S58, DmpA  29.81 
 
 		 354 aa  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4222  peptidase S58 DmpA  32.13 
 
 		 352 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4112  peptidase S58 DmpA  26.71 
 
 		 358 aa  50.1  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.971314  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6180  peptidase S58 DmpA  32.32 
 
 		 375 aa  49.7  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3199  peptidase S58 DmpA  31.83 
 
 		 369 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4401  peptidase S58 DmpA  26.56 
 
 		 360 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1661  aminopeptidase DmpA  27.25 
 
 		 354 aa  46.6  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2891  peptidase S58 DmpA  26.05 
 
 		 373 aa  46.6  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4044  peptidase S58, DmpA  31.68 
 
 		 369 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181806  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4322  peptidase S58, DmpA  31.68 
 
 		 369 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.810072  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0839  aminopeptidase DmpA  26.98 
 
 		 364 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0193478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5206  aminopeptidase DmpA  27.1 
 
 		 367 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5294  aminopeptidase DmpA  27.1 
 
 		 367 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.660356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5586  aminopeptidase DmpA  27.1 
 
 		 367 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.237816 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>