101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0143 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0143  peptidase S58 DmpA  100 
 
 
352 aa  697    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0984939  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3974  peptidase S58 DmpA  89.66 
 
 
351 aa  613  9.999999999999999e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4401  peptidase S58 DmpA  83.57 
 
 
360 aa  570  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4112  peptidase S58 DmpA  84.08 
 
 
358 aa  559  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.971314  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4055  peptidase S58 DmpA  55.33 
 
 
360 aa  324  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1923  aminopeptidase DmpA  54.08 
 
 
346 aa  320  3e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3006  peptidase S58 DmpA  56.83 
 
 
350 aa  316  3e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1322  peptidase S58 DmpA  51.06 
 
 
341 aa  316  5e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0281785  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4222  peptidase S58 DmpA  51.62 
 
 
352 aa  315  9e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4594  peptidase S58, DmpA  54.35 
 
 
354 aa  314  1.9999999999999998e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3106  peptidase S58, DmpA  53.73 
 
 
364 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0136  aminopeptidase DmpA  53.87 
 
 
358 aa  312  3.9999999999999997e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1411  peptidase S58, DmpA  53.92 
 
 
352 aa  312  4.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.704657  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3574  peptidase S58, DmpA  54.73 
 
 
360 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0115434  normal  0.141356 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1864  aminopeptidase DmpA  54.55 
 
 
360 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1256  peptidase S58 DmpA  50.45 
 
 
341 aa  306  3e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3350  peptidase S58 DmpA  54.25 
 
 
360 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.013595  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4200  peptidase S58, DmpA  54.44 
 
 
360 aa  305  6e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381793  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4166  peptidase S58, DmpA  54.44 
 
 
360 aa  305  6e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00735465 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1661  aminopeptidase DmpA  52.68 
 
 
354 aa  301  8.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1383  D-aminopeptidase protein  52.57 
 
 
341 aa  301  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.306178  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0839  aminopeptidase DmpA  51.83 
 
 
364 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0193478  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3561  peptidase S58 DmpA  49.25 
 
 
358 aa  296  4e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.949161  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4423  peptidase S58 DmpA  54.28 
 
 
357 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.405309  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3240  peptidase S58 DmpA  52.6 
 
 
357 aa  294  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0531  D-aminopeptidase, putative  50.6 
 
 
340 aa  291  1e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0461  putative D-aminopeptidase  50.6 
 
 
340 aa  291  1e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.509897  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3127  peptidase S58 DmpA  50.14 
 
 
366 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0051  L-aminopeptidase/D-esterase  40.48 
 
 
369 aa  268  8e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1200  peptidase S58 DmpA  44.82 
 
 
347 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0304  peptidase S58 DmpA  41.72 
 
 
345 aa  249  7e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5170  peptidase S58 DmpA  47.02 
 
 
345 aa  246  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.935854  normal  0.481324 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2891  peptidase S58 DmpA  38.53 
 
 
373 aa  224  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2417  peptidase S58 DmpA  44.14 
 
 
365 aa  219  6e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3571  peptidase S58 DmpA  41.03 
 
 
372 aa  217  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985399  normal  0.76681 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0321  aminopeptidase DmpA  54.37 
 
 
442 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1116  D-aminopeptidase, putative  53.42 
 
 
446 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1764  aminopeptidase DmpA  54.37 
 
 
451 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0398  L-aminopeptidase/D-esterase  54.37 
 
 
448 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.343359  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0242  D-aminopeptidase  54.37 
 
 
448 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.547192  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1849  L-aminopeptidase/D-esterase  54.37 
 
 
442 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1355  aminopeptidase DmpA  54.37 
 
 
448 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.275545  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1419  peptidase S58 DmpA  41.21 
 
 
463 aa  215  7e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1411  peptidase S58 DmpA  41.32 
 
 
489 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1507  peptidase S58 DmpA  41 
 
 
489 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2448  aminopeptidase DmpA  41.32 
 
 
489 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.357188  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2464  aminopeptidase  47.27 
 
 
348 aa  206  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00184488  normal  0.106032 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2046  peptidase S58 DmpA  39.63 
 
 
376 aa  204  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173525  hitchhiker  0.00567247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5706  peptidase S58 DmpA  41.47 
 
 
375 aa  204  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5913  aminopeptidase  43.62 
 
 
349 aa  204  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3656  aminopeptidase DmpA  41.16 
 
 
371 aa  202  7e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.950122  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0995  aminopeptidase DmpA  40.06 
 
 
387 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17440  L-aminopeptidase DmpA  40.56 
 
 
381 aa  195  8.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.558769  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1479  peptidase S58 DmpA  41.01 
 
 
318 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3094  peptidase S58 DmpA  37.96 
 
 
352 aa  186  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0856606  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2559  peptidase S58 DmpA  42.76 
 
 
367 aa  179  9e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117376 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6011  peptidase S58 DmpA  38.97 
 
 
373 aa  178  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3141  peptidase S58, DmpA  38.81 
 
 
393 aa  177  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.478527  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3384  peptidase S58, DmpA  38.83 
 
 
394 aa  176  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.266715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5206  aminopeptidase DmpA  38.68 
 
 
367 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5294  aminopeptidase DmpA  38.68 
 
 
367 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.660356  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5586  aminopeptidase DmpA  38.68 
 
 
367 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.237816 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3844  D-aminopeptidase putative  38.6 
 
 
377 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4251  aminopeptidase DmpA  41.32 
 
 
372 aa  171  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3533  peptidase S58, DmpA  38.3 
 
 
372 aa  170  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6180  peptidase S58 DmpA  40.22 
 
 
375 aa  167  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0592  putative D-aminopeptidase  39.08 
 
 
376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0875  putative D-aminopeptidase  39.08 
 
 
376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1842  putative D-aminopeptidase  39.08 
 
 
376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3840  hypothetical protein  42.42 
 
 
366 aa  162  7e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45210  hypothetical protein  42.66 
 
 
366 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152868  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0605  peptidase S58 DmpA  37.71 
 
 
369 aa  158  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2806  peptidase S58 DmpA  35.98 
 
 
375 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2326  peptidase  41.28 
 
 
376 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1108  putative D-aminopeptidase  41.28 
 
 
376 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1022  putative D-aminopeptidase  41.28 
 
 
376 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1650  D-aminopeptidase, putative  40.49 
 
 
407 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1684  aminopeptidase DmpA  41.84 
 
 
369 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  0.901493 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4044  peptidase S58, DmpA  41.75 
 
 
369 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181806  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4322  peptidase S58, DmpA  41.75 
 
 
369 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.810072  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4211  peptidase S58 DmpA  41.49 
 
 
369 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.131306 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3737  peptidase S58, DmpA  41.84 
 
 
369 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0673701  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4288  peptidase S58 DmpA  43.21 
 
 
369 aa  143  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.443184 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3199  peptidase S58 DmpA  41.75 
 
 
369 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448482  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1047  aminopeptidase DmpA  39.12 
 
 
370 aa  139  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0633499  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2592  peptidase S58 DmpA  40.57 
 
 
368 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.119043 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4768  peptidase S58 DmpA  30.94 
 
 
329 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49009  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4248  peptidase S58 DmpA  30.92 
 
 
329 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0836973  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4618  peptidase S58 DmpA  31.58 
 
 
329 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2667  peptidase S58, DmpA  28.9 
 
 
340 aa  55.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0772  peptidase S58, DmpA  27.69 
 
 
356 aa  52  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.904933  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2889  putative peptidase  27.06 
 
 
327 aa  50.8  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00143546  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1287  peptidase S58, DmpA  30.29 
 
 
335 aa  48.9  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0721739  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08608  D-aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03710)  34.67 
 
 
184 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.344807  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0620  peptidase S58, DmpA  31.79 
 
 
327 aa  47.8  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.975766  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0349  hypothetical protein  25.38 
 
 
368 aa  45.4  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0317  hypothetical protein  25.38 
 
 
368 aa  45.8  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4338  peptidase S58 DmpA  28.32 
 
 
334 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2156  peptidase S58 DmpA  30.11 
 
 
340 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2683  peptidase S58 DmpA  26.22 
 
 
342 aa  45.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.283416 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>