105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3240 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3240  peptidase S58 DmpA  100 
 
 
357 aa  706    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3106  peptidase S58, DmpA  70.93 
 
 
364 aa  478  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0136  aminopeptidase DmpA  71.51 
 
 
358 aa  467  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3006  peptidase S58 DmpA  69.62 
 
 
350 aa  447  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4594  peptidase S58, DmpA  68.24 
 
 
354 aa  443  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1322  peptidase S58 DmpA  68.33 
 
 
341 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0281785  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1923  aminopeptidase DmpA  67.65 
 
 
346 aa  435  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1411  peptidase S58, DmpA  68.8 
 
 
352 aa  432  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.704657  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1256  peptidase S58 DmpA  67.74 
 
 
341 aa  433  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1661  aminopeptidase DmpA  66.47 
 
 
354 aa  418  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1383  D-aminopeptidase protein  66.57 
 
 
341 aa  412  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.306178  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0839  aminopeptidase DmpA  64.64 
 
 
364 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0193478  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4222  peptidase S58 DmpA  61.71 
 
 
352 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3127  peptidase S58 DmpA  62.36 
 
 
366 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4055  peptidase S58 DmpA  63.58 
 
 
360 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4200  peptidase S58, DmpA  63.95 
 
 
360 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381793  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4166  peptidase S58, DmpA  63.95 
 
 
360 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00735465 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4423  peptidase S58 DmpA  63.64 
 
 
357 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.405309  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3350  peptidase S58 DmpA  63.32 
 
 
360 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.013595  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1864  aminopeptidase DmpA  64.18 
 
 
360 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3574  peptidase S58, DmpA  63.58 
 
 
360 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0115434  normal  0.141356 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3974  peptidase S58 DmpA  53.53 
 
 
351 aa  314  9.999999999999999e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4112  peptidase S58 DmpA  53.78 
 
 
358 aa  312  6.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.971314  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4401  peptidase S58 DmpA  52.33 
 
 
360 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0143  peptidase S58 DmpA  52.6 
 
 
352 aa  308  8e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0984939  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3561  peptidase S58 DmpA  50.3 
 
 
358 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.949161  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0531  D-aminopeptidase, putative  51.48 
 
 
340 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0461  putative D-aminopeptidase  51.48 
 
 
340 aa  304  2.0000000000000002e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.509897  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0051  L-aminopeptidase/D-esterase  43.64 
 
 
369 aa  284  2.0000000000000002e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1200  peptidase S58 DmpA  47.58 
 
 
347 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2891  peptidase S58 DmpA  41.27 
 
 
373 aa  271  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0304  peptidase S58 DmpA  45.61 
 
 
345 aa  269  5e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5170  peptidase S58 DmpA  50.59 
 
 
345 aa  266  4e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.935854  normal  0.481324 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3571  peptidase S58 DmpA  42.78 
 
 
372 aa  265  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985399  normal  0.76681 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0321  aminopeptidase DmpA  63.77 
 
 
442 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0398  L-aminopeptidase/D-esterase  63.77 
 
 
448 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.343359  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0242  D-aminopeptidase  63.77 
 
 
448 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.547192  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1849  L-aminopeptidase/D-esterase  63.77 
 
 
442 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1764  aminopeptidase DmpA  63.77 
 
 
451 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1355  aminopeptidase DmpA  63.77 
 
 
448 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.275545  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1116  D-aminopeptidase, putative  63.77 
 
 
446 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5706  peptidase S58 DmpA  43.58 
 
 
375 aa  251  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0995  aminopeptidase DmpA  45.38 
 
 
387 aa  238  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1419  peptidase S58 DmpA  42.3 
 
 
463 aa  235  7e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1507  peptidase S58 DmpA  42.5 
 
 
489 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2448  aminopeptidase DmpA  43.44 
 
 
489 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.357188  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1411  peptidase S58 DmpA  42.22 
 
 
489 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2417  peptidase S58 DmpA  45.62 
 
 
365 aa  231  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5913  aminopeptidase  45.59 
 
 
349 aa  230  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2046  peptidase S58 DmpA  42.12 
 
 
376 aa  227  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173525  hitchhiker  0.00567247 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3094  peptidase S58 DmpA  40.52 
 
 
352 aa  220  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0856606  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17440  L-aminopeptidase DmpA  44.18 
 
 
381 aa  211  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.558769  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3656  aminopeptidase DmpA  43.77 
 
 
371 aa  209  6e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.950122  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2559  peptidase S58 DmpA  42.43 
 
 
367 aa  209  7e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2464  aminopeptidase  45.07 
 
 
348 aa  199  9e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00184488  normal  0.106032 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3844  D-aminopeptidase putative  41.35 
 
 
377 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3533  peptidase S58, DmpA  40.64 
 
 
372 aa  190  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0592  putative D-aminopeptidase  43.68 
 
 
376 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5206  aminopeptidase DmpA  41.79 
 
 
367 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5294  aminopeptidase DmpA  41.79 
 
 
367 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.660356  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0875  putative D-aminopeptidase  43.68 
 
 
376 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5586  aminopeptidase DmpA  41.79 
 
 
367 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.237816 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1842  putative D-aminopeptidase  43.68 
 
 
376 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6011  peptidase S58 DmpA  40.88 
 
 
373 aa  187  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1479  peptidase S58 DmpA  40.84 
 
 
318 aa  186  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3141  peptidase S58, DmpA  38.8 
 
 
393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.478527  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2806  peptidase S58 DmpA  38.67 
 
 
375 aa  182  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45210  hypothetical protein  43.7 
 
 
366 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152868  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0605  peptidase S58 DmpA  42 
 
 
369 aa  180  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3384  peptidase S58, DmpA  38.61 
 
 
394 aa  179  8e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.266715 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3840  hypothetical protein  43.4 
 
 
366 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6180  peptidase S58 DmpA  42.57 
 
 
375 aa  179  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1108  putative D-aminopeptidase  43.97 
 
 
376 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1022  putative D-aminopeptidase  43.97 
 
 
376 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2326  peptidase  43.97 
 
 
376 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4251  aminopeptidase DmpA  40 
 
 
372 aa  173  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3737  peptidase S58, DmpA  42.54 
 
 
369 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0673701  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4211  peptidase S58 DmpA  42.54 
 
 
369 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.131306 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1650  D-aminopeptidase, putative  43.3 
 
 
407 aa  166  8e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4044  peptidase S58, DmpA  42.54 
 
 
369 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181806  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4322  peptidase S58, DmpA  42.54 
 
 
369 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.810072  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3199  peptidase S58 DmpA  42.54 
 
 
369 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448482  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1684  aminopeptidase DmpA  45.58 
 
 
369 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  0.901493 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4288  peptidase S58 DmpA  42.42 
 
 
369 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.443184 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2592  peptidase S58 DmpA  43.15 
 
 
368 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.119043 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1047  aminopeptidase DmpA  39.81 
 
 
370 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0633499  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08608  D-aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03710)  34.36 
 
 
184 aa  60.5  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.344807  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2093  peptidase S58 DmpA  30.7 
 
 
363 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201096  normal  0.024132 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2797  peptidase S58 DmpA  27.93 
 
 
331 aa  55.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2156  peptidase S58 DmpA  32.5 
 
 
340 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2683  peptidase S58 DmpA  28.05 
 
 
342 aa  48.9  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3851  peptidase S58, DmpA  35.67 
 
 
340 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3925  peptidase S58, DmpA  35.67 
 
 
340 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3837  peptidase S58, DmpA  35.67 
 
 
340 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.449487  normal  0.0858293 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0772  peptidase S58, DmpA  30.8 
 
 
356 aa  47.8  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.904933  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0972  peptidase S58 DmpA  29.35 
 
 
358 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.898884  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2945  peptidase S58, DmpA  29.57 
 
 
349 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1091  peptidase S58 DmpA  28.85 
 
 
328 aa  45.8  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3228  peptidase S58, DmpA  30.32 
 
 
318 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4121  peptidase S58 DmpA  29.45 
 
 
353 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246913  normal  0.677622 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>