111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4121 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4121  peptidase S58 DmpA  100 
 
 
353 aa  688    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246913  normal  0.677622 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4338  peptidase S58 DmpA  55.52 
 
 
334 aa  345  5e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5330  hypothetical protein  58.21 
 
 
332 aa  345  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12369  normal  0.395647 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3687  peptidase S58, DmpA  55.09 
 
 
331 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1616  peptidase S58, DmpA  55.95 
 
 
332 aa  339  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108778  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0972  peptidase S58 DmpA  60.6 
 
 
358 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.898884  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1773  peptidase S58, DmpA  55.39 
 
 
331 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.800376  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2617  peptidase S58, DmpA  57.44 
 
 
332 aa  335  7e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4768  peptidase S58 DmpA  60.61 
 
 
329 aa  329  4e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49009  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2215  peptidase S58, DmpA  54.46 
 
 
332 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2683  peptidase S58 DmpA  55.69 
 
 
342 aa  325  5e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2093  peptidase S58 DmpA  58.63 
 
 
363 aa  324  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201096  normal  0.024132 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1091  peptidase S58 DmpA  53.75 
 
 
328 aa  323  2e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4618  peptidase S58 DmpA  60.84 
 
 
329 aa  323  4e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4248  peptidase S58 DmpA  60.54 
 
 
329 aa  318  7e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0836973  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0772  peptidase S58, DmpA  57.61 
 
 
356 aa  313  3.9999999999999997e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.904933  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4493  peptidase S58 DmpA  55.59 
 
 
331 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2156  peptidase S58 DmpA  61.25 
 
 
340 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1287  peptidase S58, DmpA  54.95 
 
 
335 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0721739  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4203  peptidase S58 DmpA  57.1 
 
 
331 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1488  peptidase S58 DmpA  61.27 
 
 
335 aa  302  5.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0291995 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3882  hypothetical protein  55.26 
 
 
333 aa  292  5e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.482216  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2889  putative peptidase  56.96 
 
 
327 aa  290  2e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00143546  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2667  peptidase S58, DmpA  53.25 
 
 
340 aa  281  2e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0311  peptidase S58 DmpA  52.8 
 
 
345 aa  274  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4655  peptidase S58 DmpA  51.58 
 
 
347 aa  272  7e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.505511 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0620  peptidase S58, DmpA  55.32 
 
 
327 aa  271  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.975766  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0463  peptidase S58, DmpA  54.15 
 
 
331 aa  251  2e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3189  peptidase S58 DmpA  52.6 
 
 
339 aa  231  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2943  peptidase S58 DmpA  48.49 
 
 
323 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2797  peptidase S58 DmpA  44.75 
 
 
331 aa  208  9e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3851  peptidase S58, DmpA  48.48 
 
 
340 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3925  peptidase S58, DmpA  48.48 
 
 
340 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3837  peptidase S58, DmpA  48.48 
 
 
340 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.449487  normal  0.0858293 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3228  peptidase S58, DmpA  43.29 
 
 
318 aa  192  8e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1675  T4 family peptidase  38.44 
 
 
325 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135147  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29210  L-aminopeptidase/D-esterase  45.11 
 
 
345 aa  191  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3050  peptidase S58 DmpA  41.18 
 
 
363 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578156  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3716  peptidase S58 DmpA  43.73 
 
 
329 aa  190  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00511947 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1410  T4 family peptidase  37.62 
 
 
325 aa  189  5e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568813  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2351  peptidase S58, DmpA  46.41 
 
 
340 aa  185  9e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260537  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0317  hypothetical protein  41.33 
 
 
368 aa  182  6e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0349  hypothetical protein  41.33 
 
 
368 aa  182  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4294  peptidase S58, DmpA  48.61 
 
 
340 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0168  peptidase S58 DmpA  39.01 
 
 
319 aa  180  4e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1669  peptidase S58, DmpA  44.85 
 
 
334 aa  179  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0087  peptidase S58 DmpA  41.72 
 
 
313 aa  178  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0482  peptidase S58 DmpA  38.39 
 
 
316 aa  177  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000526803  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3677  peptidase S58 DmpA  42.11 
 
 
350 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1203  peptidase S58 DmpA  41.69 
 
 
337 aa  171  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.794666  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1077  peptidase S58 DmpA  35.13 
 
 
328 aa  169  5e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.234138  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2605  peptidase S58, DmpA  41.46 
 
 
337 aa  169  7e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.47844 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2906  peptidase S58 DmpA  43.45 
 
 
336 aa  165  9e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0174879 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11365  hydrolase  47.44 
 
 
344 aa  164  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003196  normal  0.48244 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2945  peptidase S58, DmpA  42.76 
 
 
349 aa  161  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1959  peptidase S58, DmpA  43.34 
 
 
306 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1804  peptidase S58, DmpA  42.86 
 
 
350 aa  159  6e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.374201 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04100  L-aminopeptidase/D-esterase  44.48 
 
 
348 aa  157  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.037097 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2319  peptidase S58 DmpA  45.37 
 
 
361 aa  157  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212071  decreased coverage  0.00000119169 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1962  peptidase S58 DmpA  40.76 
 
 
352 aa  149  8e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2660  peptidase S58 DmpA  42.25 
 
 
322 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2221  peptidase S58 DmpA  34.09 
 
 
361 aa  140  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010872  hitchhiker  4.545e-18 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2004  peptidase S58 DmpA  38.55 
 
 
334 aa  137  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00577301  hitchhiker  0.0000000124631 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2133  peptidase S58, DmpA  39.63 
 
 
301 aa  135  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.74532  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3246  peptidase S58, DmpA  36.12 
 
 
322 aa  134  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0198  peptidase S58 DmpA  36.71 
 
 
287 aa  122  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2264  peptidase S58 DmpA  39.64 
 
 
311 aa  119  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3087  peptidase S58 DmpA  38.78 
 
 
291 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.145217 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2376  peptidase S58 DmpA  29.51 
 
 
282 aa  97.1  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.90605  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6005  peptidase S58, DmpA  32.99 
 
 
330 aa  89  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1456  peptidase S58 DmpA  50.5 
 
 
300 aa  85.9  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.749732  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4346  peptidase S58 DmpA  56.52 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3006  peptidase S58 DmpA  33.22 
 
 
350 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4594  peptidase S58, DmpA  33.22 
 
 
354 aa  61.2  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1200  peptidase S58 DmpA  30.85 
 
 
347 aa  60.8  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0304  peptidase S58 DmpA  28.62 
 
 
345 aa  59.7  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1923  aminopeptidase DmpA  31.41 
 
 
346 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0136  aminopeptidase DmpA  31.8 
 
 
358 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1007  peptidase S58, DmpA  55.56 
 
 
204 aa  57  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442944  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1411  peptidase S58, DmpA  32.7 
 
 
352 aa  56.2  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.704657  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1256  peptidase S58 DmpA  31.19 
 
 
341 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3840  hypothetical protein  28.3 
 
 
366 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4222  peptidase S58 DmpA  29.9 
 
 
352 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1322  peptidase S58 DmpA  31.76 
 
 
341 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0281785  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3106  peptidase S58, DmpA  31.35 
 
 
364 aa  50.4  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3656  aminopeptidase DmpA  33.12 
 
 
371 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.950122  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5206  aminopeptidase DmpA  29.19 
 
 
367 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5294  aminopeptidase DmpA  29.19 
 
 
367 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.660356  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5586  aminopeptidase DmpA  29.19 
 
 
367 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.237816 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0839  aminopeptidase DmpA  33.76 
 
 
364 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0193478  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45210  hypothetical protein  27.97 
 
 
366 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152868  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3974  peptidase S58 DmpA  29.97 
 
 
351 aa  48.1  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0531  D-aminopeptidase, putative  30 
 
 
340 aa  47.4  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0461  putative D-aminopeptidase  30 
 
 
340 aa  47.4  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.509897  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4055  peptidase S58 DmpA  29 
 
 
360 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3240  peptidase S58 DmpA  34.18 
 
 
357 aa  45.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4112  peptidase S58 DmpA  30.9 
 
 
358 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.971314  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0592  putative D-aminopeptidase  31.06 
 
 
376 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1864  aminopeptidase DmpA  29.25 
 
 
360 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1842  putative D-aminopeptidase  31.06 
 
 
376 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>