127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_29210 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_29210  L-aminopeptidase/D-esterase  100 
 
 		 345 aa  675    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2797  peptidase S58 DmpA  52.92 
 
 		 331 aa  288  7e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3851  peptidase S58, DmpA  56.47 
 
 		 340 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3925  peptidase S58, DmpA  56.47 
 
 		 340 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3837  peptidase S58, DmpA  56.47 
 
 		 340 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.449487  normal  0.0858293 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2351  peptidase S58, DmpA  54.89 
 
 		 340 aa  271  9e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11365  hydrolase  56.61 
 
 		 344 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003196  normal  0.48244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4294  peptidase S58, DmpA  55.87 
 
 		 340 aa  264  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3716  peptidase S58 DmpA  51.35 
 
 		 329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00511947 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2943  peptidase S58 DmpA  52.07 
 
 		 323 aa  243  3e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3677  peptidase S58 DmpA  52.41 
 
 		 350 aa  239  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3228  peptidase S58, DmpA  51.25 
 
 		 318 aa  232  6e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0168  peptidase S58 DmpA  43.11 
 
 		 319 aa  231  2e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1962  peptidase S58 DmpA  49.13 
 
 		 352 aa  223  4e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2945  peptidase S58, DmpA  47.84 
 
 		 349 aa  223  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3050  peptidase S58 DmpA  43.19 
 
 		 363 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578156  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0349  hypothetical protein  43.4 
 
 		 368 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2093  peptidase S58 DmpA  49.85 
 
 		 363 aa  220  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201096  normal  0.024132 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0317  hypothetical protein  43.11 
 
 		 368 aa  219  5e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0972  peptidase S58 DmpA  49.56 
 
 		 358 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.898884  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1669  peptidase S58, DmpA  50.68 
 
 		 334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4768  peptidase S58 DmpA  46.59 
 
 		 329 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2660  peptidase S58 DmpA  48.47 
 
 		 322 aa  212  9e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2156  peptidase S58 DmpA  51.82 
 
 		 340 aa  209  6e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4618  peptidase S58 DmpA  47.16 
 
 		 329 aa  209  7e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2906  peptidase S58 DmpA  50.51 
 
 		 336 aa  206  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174879 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2605  peptidase S58, DmpA  46.11 
 
 		 337 aa  206  6e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.47844 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04100  L-aminopeptidase/D-esterase  50.17 
 
 		 348 aa  204  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.037097 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4248  peptidase S58 DmpA  47.16 
 
 		 329 aa  203  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1203  peptidase S58 DmpA  48.41 
 
 		 337 aa  204  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.794666  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1804  peptidase S58, DmpA  46.05 
 
 		 350 aa  203  5e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374201 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0311  peptidase S58 DmpA  46.99 
 
 		 345 aa  202  5e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0772  peptidase S58, DmpA  44.02 
 
 		 356 aa  202  6e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.904933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1287  peptidase S58, DmpA  47.6 
 
 		 335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0721739  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0087  peptidase S58 DmpA  47.89 
 
 		 313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0620  peptidase S58, DmpA  47.02 
 
 		 327 aa  199  5e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.975766  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2667  peptidase S58, DmpA  42.37 
 
 		 340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1488  peptidase S58 DmpA  46.92 
 
 		 335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0291995 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1616  peptidase S58, DmpA  43.86 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4655  peptidase S58 DmpA  41.91 
 
 		 347 aa  192  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.505511 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2683  peptidase S58 DmpA  41.67 
 
 		 342 aa  187  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4121  peptidase S58 DmpA  44.83 
 
 		 353 aa  186  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246913  normal  0.677622 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4338  peptidase S58 DmpA  42.86 
 
 		 334 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0463  peptidase S58, DmpA  46.36 
 
 		 331 aa  186  7e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1675  T4 family peptidase  36.05 
 
 		 325 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135147  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1959  peptidase S58, DmpA  44.35 
 
 		 306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1410  T4 family peptidase  34.59 
 
 		 325 aa  180  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568813  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1773  peptidase S58, DmpA  42.52 
 
 		 331 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.800376  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1077  peptidase S58 DmpA  33.33 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.234138  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2221  peptidase S58 DmpA  34.28 
 
 		 361 aa  178  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010872  hitchhiker  4.545e-18 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3882  hypothetical protein  42.39 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.482216  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0482  peptidase S58 DmpA  38.28 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000526803  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2889  putative peptidase  44.19 
 
 		 327 aa  176  6e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00143546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2617  peptidase S58, DmpA  43.68 
 
 		 332 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3189  peptidase S58 DmpA  46.38 
 
 		 339 aa  174  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1091  peptidase S58 DmpA  41.57 
 
 		 328 aa  172  5e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2215  peptidase S58, DmpA  42.73 
 
 		 332 aa  172  5.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2319  peptidase S58 DmpA  39.94 
 
 		 361 aa  171  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212071  decreased coverage  0.00000119169 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5330  hypothetical protein  42.69 
 
 		 332 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12369  normal  0.395647 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4493  peptidase S58 DmpA  40.29 
 
 		 331 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3687  peptidase S58, DmpA  41.64 
 
 		 331 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3246  peptidase S58, DmpA  42.71 
 
 		 322 aa  171  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0198  peptidase S58 DmpA  42.4 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4203  peptidase S58 DmpA  40.86 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2133  peptidase S58, DmpA  43.06 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.74532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2264  peptidase S58 DmpA  43.8 
 
 		 311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3087  peptidase S58 DmpA  43.51 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.145217 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4346  peptidase S58 DmpA  51.94 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2004  peptidase S58 DmpA  38.64 
 
 		 334 aa  144  3e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00577301  hitchhiker  0.0000000124631 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1456  peptidase S58 DmpA  39.93 
 
 		 300 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.749732  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2376  peptidase S58 DmpA  31.31 
 
 		 282 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.90605  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6005  peptidase S58, DmpA  33.22 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1007  peptidase S58, DmpA  50.89 
 
 		 204 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442944  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3840  hypothetical protein  29 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45210  hypothetical protein  29.07 
 
 		 366 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1411  peptidase S58 DmpA  28.3 
 
 		 489 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1507  peptidase S58 DmpA  28.3 
 
 		 489 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2559  peptidase S58 DmpA  29.43 
 
 		 367 aa  59.3  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117376 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2326  peptidase  30.72 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1108  putative D-aminopeptidase  30.72 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1022  putative D-aminopeptidase  30.72 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2448  aminopeptidase DmpA  28.3 
 
 		 489 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.357188  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0995  aminopeptidase DmpA  31.52 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0592  putative D-aminopeptidase  30.39 
 
 		 376 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17440  L-aminopeptidase DmpA  31.51 
 
 		 381 aa  55.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.558769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0875  putative D-aminopeptidase  30.39 
 
 		 376 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1842  putative D-aminopeptidase  30.39 
 
 		 376 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2891  peptidase S58 DmpA  25.09 
 
 		 373 aa  55.8  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3384  peptidase S58, DmpA  28.53 
 
 		 394 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5206  aminopeptidase DmpA  28.25 
 
 		 367 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5294  aminopeptidase DmpA  28.25 
 
 		 367 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.660356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4594  peptidase S58, DmpA  33.01 
 
 		 354 aa  53.9  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5586  aminopeptidase DmpA  28.25 
 
 		 367 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.237816 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1650  D-aminopeptidase, putative  29.08 
 
 		 407 aa  53.5  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3141  peptidase S58, DmpA  31.13 
 
 		 393 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.478527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1419  peptidase S58 DmpA  27.71 
 
 		 463 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3571  peptidase S58 DmpA  27.39 
 
 		 372 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985399  normal  0.76681 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3737  peptidase S58, DmpA  30.94 
 
 		 369 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0673701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3561  peptidase S58 DmpA  30.95 
 
 		 358 aa  51.6  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.949161  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3533  peptidase S58, DmpA  27.71 
 
 		 372 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300582 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>