74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2906 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2906  peptidase S58 DmpA  100 
 
 		 336 aa  654    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174879 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2605  peptidase S58, DmpA  74.32 
 
 		 337 aa  430  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.47844 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1203  peptidase S58 DmpA  73.41 
 
 		 337 aa  424  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.794666  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3677  peptidase S58 DmpA  71.86 
 
 		 350 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1669  peptidase S58, DmpA  71.12 
 
 		 334 aa  412  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1804  peptidase S58, DmpA  69.77 
 
 		 350 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374201 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3050  peptidase S58 DmpA  55.66 
 
 		 363 aa  337  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578156  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0349  hypothetical protein  55.52 
 
 		 368 aa  332  7.000000000000001e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0317  hypothetical protein  55.21 
 
 		 368 aa  329  3e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2943  peptidase S58 DmpA  57.06 
 
 		 323 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0168  peptidase S58 DmpA  49.68 
 
 		 319 aa  292  5e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3716  peptidase S58 DmpA  57.19 
 
 		 329 aa  291  8e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00511947 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3228  peptidase S58, DmpA  54.55 
 
 		 318 aa  268  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1675  T4 family peptidase  44.52 
 
 		 325 aa  266  4e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135147  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1410  T4 family peptidase  43.87 
 
 		 325 aa  266  4e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568813  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0087  peptidase S58 DmpA  50.65 
 
 		 313 aa  261  1e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1077  peptidase S58 DmpA  41.89 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.234138  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1959  peptidase S58, DmpA  52 
 
 		 306 aa  250  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3246  peptidase S58, DmpA  45.37 
 
 		 322 aa  247  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2797  peptidase S58 DmpA  48.75 
 
 		 331 aa  246  4e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2221  peptidase S58 DmpA  38.26 
 
 		 361 aa  243  3.9999999999999997e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010872  hitchhiker  4.545e-18 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0482  peptidase S58 DmpA  46.91 
 
 		 316 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000526803  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2351  peptidase S58, DmpA  49.34 
 
 		 340 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2004  peptidase S58 DmpA  44.31 
 
 		 334 aa  210  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00577301  hitchhiker  0.0000000124631 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29210  L-aminopeptidase/D-esterase  46.81 
 
 		 345 aa  207  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3837  peptidase S58, DmpA  47.9 
 
 		 340 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.449487  normal  0.0858293 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3925  peptidase S58, DmpA  47.9 
 
 		 340 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3851  peptidase S58, DmpA  47.9 
 
 		 340 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4294  peptidase S58, DmpA  48.68 
 
 		 340 aa  206  5e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0198  peptidase S58 DmpA  44.48 
 
 		 287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11365  hydrolase  47.96 
 
 		 344 aa  194  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003196  normal  0.48244 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1287  peptidase S58, DmpA  42.35 
 
 		 335 aa  193  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0721739  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2133  peptidase S58, DmpA  44.19 
 
 		 301 aa  192  5e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.74532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2945  peptidase S58, DmpA  42.98 
 
 		 349 aa  192  6e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2093  peptidase S58 DmpA  43.73 
 
 		 363 aa  192  9e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201096  normal  0.024132 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4768  peptidase S58 DmpA  44.71 
 
 		 329 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0972  peptidase S58 DmpA  45.48 
 
 		 358 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.898884  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4618  peptidase S58 DmpA  41.79 
 
 		 329 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3087  peptidase S58 DmpA  43.42 
 
 		 291 aa  186  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.145217 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4248  peptidase S58 DmpA  41.79 
 
 		 329 aa  186  6e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1488  peptidase S58 DmpA  45.02 
 
 		 335 aa  183  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0291995 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2667  peptidase S58, DmpA  42.18 
 
 		 340 aa  182  8.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0311  peptidase S58 DmpA  40.6 
 
 		 345 aa  179  7e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2156  peptidase S58 DmpA  46.26 
 
 		 340 aa  178  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1962  peptidase S58 DmpA  43.3 
 
 		 352 aa  177  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1091  peptidase S58 DmpA  39.51 
 
 		 328 aa  175  9e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0772  peptidase S58, DmpA  44.6 
 
 		 356 aa  175  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.904933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4338  peptidase S58 DmpA  39.32 
 
 		 334 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2683  peptidase S58 DmpA  40.06 
 
 		 342 aa  171  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4655  peptidase S58 DmpA  39.69 
 
 		 347 aa  170  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.505511 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1773  peptidase S58, DmpA  40.62 
 
 		 331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.800376  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2215  peptidase S58, DmpA  39.17 
 
 		 332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2660  peptidase S58 DmpA  43.67 
 
 		 322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1616  peptidase S58, DmpA  40.12 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2889  putative peptidase  41.59 
 
 		 327 aa  162  7e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00143546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3882  hypothetical protein  39.57 
 
 		 333 aa  162  9e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.482216  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3687  peptidase S58, DmpA  39.88 
 
 		 331 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2319  peptidase S58 DmpA  42.52 
 
 		 361 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212071  decreased coverage  0.00000119169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1456  peptidase S58 DmpA  40.94 
 
 		 300 aa  160  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.749732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2617  peptidase S58, DmpA  37.99 
 
 		 332 aa  159  7e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4121  peptidase S58 DmpA  42.11 
 
 		 353 aa  158  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246913  normal  0.677622 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5330  hypothetical protein  39.09 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12369  normal  0.395647 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4493  peptidase S58 DmpA  38.2 
 
 		 331 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0620  peptidase S58, DmpA  39.52 
 
 		 327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.975766  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3189  peptidase S58 DmpA  43.43 
 
 		 339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4203  peptidase S58 DmpA  40.12 
 
 		 331 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04100  L-aminopeptidase/D-esterase  41.45 
 
 		 348 aa  143  5e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.037097 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0463  peptidase S58, DmpA  39.88 
 
 		 331 aa  140  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2376  peptidase S58 DmpA  30.22 
 
 		 282 aa  125  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.90605  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6005  peptidase S58, DmpA  34.23 
 
 		 330 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2264  peptidase S58 DmpA  39.45 
 
 		 311 aa  99  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4346  peptidase S58 DmpA  56.78 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1007  peptidase S58, DmpA  51.3 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442944  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0304  peptidase S58 DmpA  27.45 
 
 		 345 aa  47  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>