98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1616 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1616  peptidase S58, DmpA  100 
 
 		 332 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4338  peptidase S58 DmpA  76.67 
 
 		 334 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2215  peptidase S58, DmpA  77.41 
 
 		 332 aa  481  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2617  peptidase S58, DmpA  77.71 
 
 		 332 aa  481  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5330  hypothetical protein  75.15 
 
 		 332 aa  465  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12369  normal  0.395647 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1773  peptidase S58, DmpA  74.4 
 
 		 331 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.800376  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3687  peptidase S58, DmpA  73.49 
 
 		 331 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0972  peptidase S58 DmpA  63.36 
 
 		 358 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.898884  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2093  peptidase S58 DmpA  64.56 
 
 		 363 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201096  normal  0.024132 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2683  peptidase S58 DmpA  56.93 
 
 		 342 aa  363  3e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4768  peptidase S58 DmpA  62.31 
 
 		 329 aa  355  5.999999999999999e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4248  peptidase S58 DmpA  62.31 
 
 		 329 aa  350  2e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4618  peptidase S58 DmpA  62.31 
 
 		 329 aa  350  3e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2156  peptidase S58 DmpA  60.88 
 
 		 340 aa  340  1e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4121  peptidase S58 DmpA  55.95 
 
 		 353 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246913  normal  0.677622 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1091  peptidase S58 DmpA  51.35 
 
 		 328 aa  323  3e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4493  peptidase S58 DmpA  56.19 
 
 		 331 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4203  peptidase S58 DmpA  57.4 
 
 		 331 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1287  peptidase S58, DmpA  54.98 
 
 		 335 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0721739  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3882  hypothetical protein  54.27 
 
 		 333 aa  300  3e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.482216  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1488  peptidase S58 DmpA  53.64 
 
 		 335 aa  297  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0291995 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0772  peptidase S58, DmpA  54.75 
 
 		 356 aa  287  2e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.904933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2667  peptidase S58, DmpA  51.93 
 
 		 340 aa  280  2e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2889  putative peptidase  52.13 
 
 		 327 aa  265  8.999999999999999e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00143546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0311  peptidase S58 DmpA  47.18 
 
 		 345 aa  264  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4655  peptidase S58 DmpA  46.67 
 
 		 347 aa  253  4.0000000000000004e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.505511 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0620  peptidase S58, DmpA  51.05 
 
 		 327 aa  246  4.9999999999999997e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.975766  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0463  peptidase S58, DmpA  48.3 
 
 		 331 aa  228  1e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3189  peptidase S58 DmpA  50.61 
 
 		 339 aa  226  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2797  peptidase S58 DmpA  38.21 
 
 		 331 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3716  peptidase S58 DmpA  43.64 
 
 		 329 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00511947 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3228  peptidase S58, DmpA  42.72 
 
 		 318 aa  193  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3925  peptidase S58, DmpA  44.3 
 
 		 340 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3837  peptidase S58, DmpA  44.3 
 
 		 340 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.449487  normal  0.0858293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3851  peptidase S58, DmpA  44.3 
 
 		 340 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2943  peptidase S58 DmpA  40.72 
 
 		 323 aa  189  8e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2351  peptidase S58, DmpA  44.59 
 
 		 340 aa  186  6e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29210  L-aminopeptidase/D-esterase  43.86 
 
 		 345 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4294  peptidase S58, DmpA  44.44 
 
 		 340 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0317  hypothetical protein  37.76 
 
 		 368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3050  peptidase S58 DmpA  37.61 
 
 		 363 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578156  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0168  peptidase S58 DmpA  36.04 
 
 		 319 aa  173  3.9999999999999995e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0349  hypothetical protein  37.76 
 
 		 368 aa  173  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3677  peptidase S58 DmpA  40.92 
 
 		 350 aa  172  9e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11365  hydrolase  41.67 
 
 		 344 aa  172  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003196  normal  0.48244 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2945  peptidase S58, DmpA  38.3 
 
 		 349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1675  T4 family peptidase  34.88 
 
 		 325 aa  163  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135147  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1410  T4 family peptidase  34.37 
 
 		 325 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568813  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0087  peptidase S58 DmpA  38.05 
 
 		 313 aa  162  9e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1959  peptidase S58, DmpA  42.99 
 
 		 306 aa  162  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0482  peptidase S58 DmpA  35.08 
 
 		 316 aa  161  2e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000526803  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1077  peptidase S58 DmpA  34.69 
 
 		 328 aa  160  4e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.234138  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1669  peptidase S58, DmpA  40.07 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2906  peptidase S58 DmpA  41.26 
 
 		 336 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174879 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2221  peptidase S58 DmpA  35.89 
 
 		 361 aa  156  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010872  hitchhiker  4.545e-18 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3246  peptidase S58, DmpA  37.35 
 
 		 322 aa  152  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2605  peptidase S58, DmpA  40.42 
 
 		 337 aa  152  8e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.47844 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1962  peptidase S58 DmpA  40.65 
 
 		 352 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1203  peptidase S58 DmpA  37.18 
 
 		 337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.794666  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04100  L-aminopeptidase/D-esterase  42.52 
 
 		 348 aa  144  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.037097 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1804  peptidase S58, DmpA  40 
 
 		 350 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374201 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2660  peptidase S58 DmpA  40.87 
 
 		 322 aa  143  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2133  peptidase S58, DmpA  39.26 
 
 		 301 aa  135  7.000000000000001e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.74532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2004  peptidase S58 DmpA  35.01 
 
 		 334 aa  133  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00577301  hitchhiker  0.0000000124631 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2319  peptidase S58 DmpA  40.62 
 
 		 361 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212071  decreased coverage  0.00000119169 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3087  peptidase S58 DmpA  37.41 
 
 		 291 aa  123  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.145217 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0198  peptidase S58 DmpA  37.67 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2264  peptidase S58 DmpA  37.09 
 
 		 311 aa  96.3  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2376  peptidase S58 DmpA  29.53 
 
 		 282 aa  92.8  7e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.90605  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1456  peptidase S58 DmpA  32.66 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.749732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6005  peptidase S58, DmpA  31.8 
 
 		 330 aa  88.2  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4346  peptidase S58 DmpA  50 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3006  peptidase S58 DmpA  28.78 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3840  hypothetical protein  30.32 
 
 		 366 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45210  hypothetical protein  30.03 
 
 		 366 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4594  peptidase S58, DmpA  30.14 
 
 		 354 aa  53.9  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1923  aminopeptidase DmpA  28.61 
 
 		 346 aa  53.1  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0304  peptidase S58 DmpA  26.89 
 
 		 345 aa  53.1  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1842  putative D-aminopeptidase  30.79 
 
 		 376 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0592  putative D-aminopeptidase  30.79 
 
 		 376 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0875  putative D-aminopeptidase  30.79 
 
 		 376 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2046  peptidase S58 DmpA  27.07 
 
 		 376 aa  49.7  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173525  hitchhiker  0.00567247 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1108  putative D-aminopeptidase  30.48 
 
 		 376 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1022  putative D-aminopeptidase  30.48 
 
 		 376 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0051  L-aminopeptidase/D-esterase  27.7 
 
 		 369 aa  48.5  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2326  peptidase  30.48 
 
 		 376 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1419  peptidase S58 DmpA  27.59 
 
 		 463 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1411  peptidase S58 DmpA  26.67 
 
 		 489 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1507  peptidase S58 DmpA  26.67 
 
 		 489 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1007  peptidase S58, DmpA  44.44 
 
 		 204 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442944  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2448  aminopeptidase DmpA  27.68 
 
 		 489 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.357188  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1650  D-aminopeptidase, putative  30.19 
 
 		 407 aa  46.6  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1661  aminopeptidase DmpA  26.04 
 
 		 354 aa  46.2  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4112  peptidase S58 DmpA  27.14 
 
 		 358 aa  44.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.971314  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0995  aminopeptidase DmpA  27.64 
 
 		 387 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4222  peptidase S58 DmpA  30.15 
 
 		 352 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0136  aminopeptidase DmpA  29.29 
 
 		 358 aa  43.1  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4401  peptidase S58 DmpA  27.71 
 
 		 360 aa  43.1  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>