136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0620 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0620  peptidase S58, DmpA  100 
 
 		 327 aa  638    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.975766  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2667  peptidase S58, DmpA  65.5 
 
 		 340 aa  400  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2889  putative peptidase  66.46 
 
 		 327 aa  377  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00143546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0772  peptidase S58, DmpA  64.51 
 
 		 356 aa  373  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.904933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1488  peptidase S58 DmpA  59.52 
 
 		 335 aa  331  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0291995 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1287  peptidase S58, DmpA  59.09 
 
 		 335 aa  330  3e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0721739  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0972  peptidase S58 DmpA  58.72 
 
 		 358 aa  300  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.898884  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4768  peptidase S58 DmpA  58.95 
 
 		 329 aa  296  3e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4248  peptidase S58 DmpA  59.88 
 
 		 329 aa  292  6e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4618  peptidase S58 DmpA  60.31 
 
 		 329 aa  291  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2683  peptidase S58 DmpA  54.79 
 
 		 342 aa  283  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3882  hypothetical protein  54.98 
 
 		 333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.482216  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2093  peptidase S58 DmpA  56.27 
 
 		 363 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201096  normal  0.024132 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1091  peptidase S58 DmpA  52.32 
 
 		 328 aa  280  2e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2156  peptidase S58 DmpA  57.01 
 
 		 340 aa  279  6e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4655  peptidase S58 DmpA  52.37 
 
 		 347 aa  278  7e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.505511 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4121  peptidase S58 DmpA  55.32 
 
 		 353 aa  276  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246913  normal  0.677622 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4338  peptidase S58 DmpA  52.11 
 
 		 334 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3687  peptidase S58, DmpA  51.98 
 
 		 331 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1773  peptidase S58, DmpA  51.98 
 
 		 331 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.800376  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3189  peptidase S58 DmpA  55.12 
 
 		 339 aa  265  5.999999999999999e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2617  peptidase S58, DmpA  54.41 
 
 		 332 aa  263  4e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4203  peptidase S58 DmpA  53.82 
 
 		 331 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4493  peptidase S58 DmpA  53.21 
 
 		 331 aa  262  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2215  peptidase S58, DmpA  53.17 
 
 		 332 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1616  peptidase S58, DmpA  51.05 
 
 		 332 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5330  hypothetical protein  51.95 
 
 		 332 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12369  normal  0.395647 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0311  peptidase S58 DmpA  49.39 
 
 		 345 aa  243  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0463  peptidase S58, DmpA  52.6 
 
 		 331 aa  241  1e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2943  peptidase S58 DmpA  48.45 
 
 		 323 aa  215  8e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29210  L-aminopeptidase/D-esterase  47.62 
 
 		 345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2351  peptidase S58, DmpA  50.68 
 
 		 340 aa  193  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2797  peptidase S58 DmpA  42.15 
 
 		 331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3851  peptidase S58, DmpA  47.65 
 
 		 340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3925  peptidase S58, DmpA  47.65 
 
 		 340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3837  peptidase S58, DmpA  47.65 
 
 		 340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.449487  normal  0.0858293 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3716  peptidase S58 DmpA  44.51 
 
 		 329 aa  188  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00511947 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3228  peptidase S58, DmpA  45.05 
 
 		 318 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4294  peptidase S58, DmpA  49.66 
 
 		 340 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0168  peptidase S58 DmpA  39.58 
 
 		 319 aa  179  7e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3050  peptidase S58 DmpA  40.55 
 
 		 363 aa  175  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578156  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1410  T4 family peptidase  36.65 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568813  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0317  hypothetical protein  40.24 
 
 		 368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0087  peptidase S58 DmpA  40.26 
 
 		 313 aa  166  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1675  T4 family peptidase  36.76 
 
 		 325 aa  166  5e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135147  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0349  hypothetical protein  40.24 
 
 		 368 aa  166  5.9999999999999996e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1669  peptidase S58, DmpA  44.17 
 
 		 334 aa  162  6e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11365  hydrolase  45.6 
 
 		 344 aa  161  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003196  normal  0.48244 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3677  peptidase S58 DmpA  42.55 
 
 		 350 aa  156  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0482  peptidase S58 DmpA  34.74 
 
 		 316 aa  155  9e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000526803  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2945  peptidase S58, DmpA  38.67 
 
 		 349 aa  152  8e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1962  peptidase S58 DmpA  41.84 
 
 		 352 aa  151  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2660  peptidase S58 DmpA  42.37 
 
 		 322 aa  152  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1959  peptidase S58, DmpA  39.88 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04100  L-aminopeptidase/D-esterase  44.63 
 
 		 348 aa  149  9e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.037097 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1804  peptidase S58, DmpA  39.34 
 
 		 350 aa  147  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374201 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1203  peptidase S58 DmpA  38.98 
 
 		 337 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.794666  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2605  peptidase S58, DmpA  38.99 
 
 		 337 aa  145  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.47844 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3246  peptidase S58, DmpA  38.73 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2906  peptidase S58 DmpA  40.96 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174879 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2133  peptidase S58, DmpA  40.44 
 
 		 301 aa  143  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.74532  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1077  peptidase S58 DmpA  32.12 
 
 		 328 aa  142  8e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.234138  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0198  peptidase S58 DmpA  41.2 
 
 		 287 aa  138  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3087  peptidase S58 DmpA  38.71 
 
 		 291 aa  134  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.145217 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2004  peptidase S58 DmpA  40.21 
 
 		 334 aa  133  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00577301  hitchhiker  0.0000000124631 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2319  peptidase S58 DmpA  42.77 
 
 		 361 aa  133  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212071  decreased coverage  0.00000119169 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2221  peptidase S58 DmpA  32 
 
 		 361 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010872  hitchhiker  4.545e-18 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1456  peptidase S58 DmpA  39.08 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.749732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4346  peptidase S58 DmpA  40.28 
 
 		 299 aa  114  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2376  peptidase S58 DmpA  29.58 
 
 		 282 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.90605  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2264  peptidase S58 DmpA  39.25 
 
 		 311 aa  99.4  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6005  peptidase S58, DmpA  34.19 
 
 		 330 aa  95.9  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3974  peptidase S58 DmpA  32.12 
 
 		 351 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3840  hypothetical protein  29.65 
 
 		 366 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45210  hypothetical protein  29.65 
 
 		 366 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0304  peptidase S58 DmpA  27.87 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0143  peptidase S58 DmpA  31.79 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0984939  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4594  peptidase S58, DmpA  42.07 
 
 		 354 aa  62.4  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1200  peptidase S58 DmpA  30.27 
 
 		 347 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1923  aminopeptidase DmpA  31.87 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2559  peptidase S58 DmpA  31.23 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117376 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4112  peptidase S58 DmpA  30.59 
 
 		 358 aa  59.3  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.971314  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0592  putative D-aminopeptidase  29.84 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1411  peptidase S58, DmpA  31 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.704657  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0875  putative D-aminopeptidase  29.84 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1842  putative D-aminopeptidase  29.84 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2417  peptidase S58 DmpA  30.41 
 
 		 365 aa  57.8  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0605  peptidase S58 DmpA  28 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6180  peptidase S58 DmpA  29.03 
 
 		 375 aa  57  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5206  aminopeptidase DmpA  28.96 
 
 		 367 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5294  aminopeptidase DmpA  28.96 
 
 		 367 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.660356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5586  aminopeptidase DmpA  28.96 
 
 		 367 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.237816 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2326  peptidase  29.51 
 
 		 376 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0136  aminopeptidase DmpA  31.37 
 
 		 358 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4044  peptidase S58, DmpA  32.37 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181806  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4322  peptidase S58, DmpA  32.37 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.810072  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1108  putative D-aminopeptidase  29.32 
 
 		 376 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1022  putative D-aminopeptidase  29.32 
 
 		 376 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2592  peptidase S58 DmpA  29.39 
 
 		 368 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119043 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4222  peptidase S58 DmpA  30.32 
 
 		 352 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>