81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0311 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0311  peptidase S58 DmpA  100 
 
 		 345 aa  681    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2683  peptidase S58 DmpA  52.99 
 
 		 342 aa  313  2.9999999999999996e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1287  peptidase S58, DmpA  55.48 
 
 		 335 aa  298  9e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0721739  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0463  peptidase S58, DmpA  56.31 
 
 		 331 aa  296  4e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1488  peptidase S58 DmpA  52.37 
 
 		 335 aa  291  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0291995 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1091  peptidase S58 DmpA  50.88 
 
 		 328 aa  289  4e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4655  peptidase S58 DmpA  50 
 
 		 347 aa  283  3.0000000000000004e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.505511 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0972  peptidase S58 DmpA  52.07 
 
 		 358 aa  281  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.898884  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4121  peptidase S58 DmpA  52.8 
 
 		 353 aa  279  5e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246913  normal  0.677622 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1616  peptidase S58, DmpA  47.18 
 
 		 332 aa  278  7e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4618  peptidase S58 DmpA  54.67 
 
 		 329 aa  276  3e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2156  peptidase S58 DmpA  55.15 
 
 		 340 aa  275  6e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4338  peptidase S58 DmpA  46.13 
 
 		 334 aa  275  8e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4768  peptidase S58 DmpA  52.94 
 
 		 329 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4248  peptidase S58 DmpA  53.67 
 
 		 329 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2617  peptidase S58, DmpA  49.27 
 
 		 332 aa  272  7e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2667  peptidase S58, DmpA  49.55 
 
 		 340 aa  271  9e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0772  peptidase S58, DmpA  52.34 
 
 		 356 aa  271  1e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.904933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2093  peptidase S58 DmpA  52.21 
 
 		 363 aa  271  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201096  normal  0.024132 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5330  hypothetical protein  48.66 
 
 		 332 aa  271  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12369  normal  0.395647 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2215  peptidase S58, DmpA  47.34 
 
 		 332 aa  269  5.9999999999999995e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3687  peptidase S58, DmpA  45.4 
 
 		 331 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1773  peptidase S58, DmpA  44.81 
 
 		 331 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.800376  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3882  hypothetical protein  50.14 
 
 		 333 aa  258  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.482216  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3189  peptidase S58 DmpA  53.03 
 
 		 339 aa  257  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2889  putative peptidase  50.31 
 
 		 327 aa  250  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00143546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2797  peptidase S58 DmpA  46.02 
 
 		 331 aa  238  8e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0620  peptidase S58, DmpA  49.39 
 
 		 327 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.975766  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4493  peptidase S58 DmpA  46.76 
 
 		 331 aa  235  9e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4203  peptidase S58 DmpA  46.18 
 
 		 331 aa  228  9e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2943  peptidase S58 DmpA  45.73 
 
 		 323 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3716  peptidase S58 DmpA  45.29 
 
 		 329 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00511947 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29210  L-aminopeptidase/D-esterase  46.99 
 
 		 345 aa  203  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3925  peptidase S58, DmpA  45.95 
 
 		 340 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3837  peptidase S58, DmpA  45.95 
 
 		 340 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.449487  normal  0.0858293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3851  peptidase S58, DmpA  45.95 
 
 		 340 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3228  peptidase S58, DmpA  42.55 
 
 		 318 aa  199  5e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0168  peptidase S58 DmpA  38.58 
 
 		 319 aa  190  4e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1410  T4 family peptidase  39.63 
 
 		 325 aa  189  9e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568813  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2351  peptidase S58, DmpA  45.27 
 
 		 340 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1675  T4 family peptidase  39.33 
 
 		 325 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135147  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3050  peptidase S58 DmpA  41.46 
 
 		 363 aa  184  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578156  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2906  peptidase S58 DmpA  44.18 
 
 		 336 aa  183  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174879 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0349  hypothetical protein  42.07 
 
 		 368 aa  183  4.0000000000000006e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1669  peptidase S58, DmpA  44.79 
 
 		 334 aa  183  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0087  peptidase S58 DmpA  38.91 
 
 		 313 aa  182  7e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0317  hypothetical protein  41.77 
 
 		 368 aa  181  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4294  peptidase S58, DmpA  47.64 
 
 		 340 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11365  hydrolase  47.32 
 
 		 344 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003196  normal  0.48244 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3677  peptidase S58 DmpA  41.32 
 
 		 350 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0482  peptidase S58 DmpA  38.15 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000526803  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2945  peptidase S58, DmpA  39.82 
 
 		 349 aa  178  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2605  peptidase S58, DmpA  41.67 
 
 		 337 aa  177  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.47844 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1203  peptidase S58 DmpA  41.07 
 
 		 337 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.794666  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2660  peptidase S58 DmpA  42.64 
 
 		 322 aa  173  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1962  peptidase S58 DmpA  42.25 
 
 		 352 aa  168  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1804  peptidase S58, DmpA  40.95 
 
 		 350 aa  168  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374201 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1959  peptidase S58, DmpA  41.69 
 
 		 306 aa  164  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1077  peptidase S58 DmpA  33.23 
 
 		 328 aa  160  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.234138  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2221  peptidase S58 DmpA  34.83 
 
 		 361 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010872  hitchhiker  4.545e-18 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3246  peptidase S58, DmpA  37.58 
 
 		 322 aa  150  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2004  peptidase S58 DmpA  40.14 
 
 		 334 aa  149  7e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00577301  hitchhiker  0.0000000124631 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2319  peptidase S58 DmpA  39.83 
 
 		 361 aa  142  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212071  decreased coverage  0.00000119169 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04100  L-aminopeptidase/D-esterase  40.8 
 
 		 348 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.037097 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4346  peptidase S58 DmpA  40.37 
 
 		 299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3087  peptidase S58 DmpA  35.81 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.145217 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2133  peptidase S58, DmpA  36.96 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.74532  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0198  peptidase S58 DmpA  36.22 
 
 		 287 aa  112  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2264  peptidase S58 DmpA  39.2 
 
 		 311 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2376  peptidase S58 DmpA  30.31 
 
 		 282 aa  102  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.90605  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1456  peptidase S58 DmpA  34.48 
 
 		 300 aa  96.3  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.749732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6005  peptidase S58, DmpA  30.27 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1007  peptidase S58, DmpA  48.74 
 
 		 204 aa  68.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442944  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1923  aminopeptidase DmpA  26.58 
 
 		 346 aa  50.4  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3006  peptidase S58 DmpA  27.4 
 
 		 350 aa  47  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2891  peptidase S58 DmpA  21.99 
 
 		 373 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3141  peptidase S58, DmpA  28.21 
 
 		 393 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.478527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3384  peptidase S58, DmpA  26.59 
 
 		 394 aa  44.3  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266715 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0304  peptidase S58 DmpA  27.45 
 
 		 345 aa  43.9  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0136  aminopeptidase DmpA  25.14 
 
 		 358 aa  43.9  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3106  peptidase S58, DmpA  25.52 
 
 		 364 aa  43.5  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>