107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2605 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2605  peptidase S58, DmpA  100 
 
 
337 aa  653    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.47844 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1203  peptidase S58 DmpA  98.52 
 
 
337 aa  642    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.794666  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3677  peptidase S58 DmpA  75.3 
 
 
350 aa  459  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1669  peptidase S58, DmpA  73.19 
 
 
334 aa  443  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2906  peptidase S58 DmpA  74.32 
 
 
336 aa  437  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0174879 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1804  peptidase S58, DmpA  74.7 
 
 
350 aa  427  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.374201 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3050  peptidase S58 DmpA  54.41 
 
 
363 aa  335  5e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578156  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0349  hypothetical protein  55.49 
 
 
368 aa  335  7e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0317  hypothetical protein  55.18 
 
 
368 aa  333  2e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3716  peptidase S58 DmpA  57.83 
 
 
329 aa  296  4e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00511947 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2943  peptidase S58 DmpA  58.01 
 
 
323 aa  289  4e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0168  peptidase S58 DmpA  48.38 
 
 
319 aa  285  5.999999999999999e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3228  peptidase S58, DmpA  54.55 
 
 
318 aa  274  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0087  peptidase S58 DmpA  49.84 
 
 
313 aa  260  2e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1410  T4 family peptidase  41.98 
 
 
325 aa  258  8e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568813  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3246  peptidase S58, DmpA  47.37 
 
 
322 aa  258  8e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1675  T4 family peptidase  42.28 
 
 
325 aa  258  1e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135147  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1077  peptidase S58 DmpA  41.16 
 
 
328 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.234138  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2221  peptidase S58 DmpA  38.89 
 
 
361 aa  251  1e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010872  hitchhiker  4.545e-18 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1959  peptidase S58, DmpA  53.36 
 
 
306 aa  246  4e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0482  peptidase S58 DmpA  43.42 
 
 
316 aa  243  3e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000526803  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2797  peptidase S58 DmpA  47.87 
 
 
331 aa  243  3.9999999999999997e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2351  peptidase S58, DmpA  50.65 
 
 
340 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260537  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29210  L-aminopeptidase/D-esterase  47.11 
 
 
345 aa  222  6e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4294  peptidase S58, DmpA  49.17 
 
 
340 aa  208  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3851  peptidase S58, DmpA  45.37 
 
 
340 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3925  peptidase S58, DmpA  45.37 
 
 
340 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3837  peptidase S58, DmpA  45.37 
 
 
340 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.449487  normal  0.0858293 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2004  peptidase S58 DmpA  43.49 
 
 
334 aa  200  3e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00577301  hitchhiker  0.0000000124631 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11365  hydrolase  47.88 
 
 
344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003196  normal  0.48244 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3087  peptidase S58 DmpA  45.03 
 
 
291 aa  193  4e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.145217 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0972  peptidase S58 DmpA  46.5 
 
 
358 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.898884  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2945  peptidase S58, DmpA  43.06 
 
 
349 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1962  peptidase S58 DmpA  46.04 
 
 
352 aa  187  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0198  peptidase S58 DmpA  45.29 
 
 
287 aa  186  4e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1287  peptidase S58, DmpA  44.87 
 
 
335 aa  186  5e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0721739  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2133  peptidase S58, DmpA  43.18 
 
 
301 aa  185  9e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.74532  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4768  peptidase S58 DmpA  44.64 
 
 
329 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49009  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2093  peptidase S58 DmpA  43.94 
 
 
363 aa  180  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201096  normal  0.024132 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0311  peptidase S58 DmpA  40.43 
 
 
345 aa  180  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4618  peptidase S58 DmpA  46.02 
 
 
329 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0772  peptidase S58, DmpA  40.82 
 
 
356 aa  179  8e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.904933  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4248  peptidase S58 DmpA  46.02 
 
 
329 aa  177  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0836973  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2156  peptidase S58 DmpA  46.74 
 
 
340 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1488  peptidase S58 DmpA  43.39 
 
 
335 aa  177  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0291995 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2667  peptidase S58, DmpA  40.94 
 
 
340 aa  175  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2660  peptidase S58 DmpA  43.58 
 
 
322 aa  172  5.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2889  putative peptidase  44.18 
 
 
327 aa  170  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00143546  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4338  peptidase S58 DmpA  40.25 
 
 
334 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1091  peptidase S58 DmpA  39.56 
 
 
328 aa  168  9e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2215  peptidase S58, DmpA  39.77 
 
 
332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4121  peptidase S58 DmpA  43.34 
 
 
353 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246913  normal  0.677622 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2617  peptidase S58, DmpA  40.94 
 
 
332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2683  peptidase S58 DmpA  38.79 
 
 
342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1616  peptidase S58, DmpA  40.64 
 
 
332 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108778  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1773  peptidase S58, DmpA  40.65 
 
 
331 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.800376  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3687  peptidase S58, DmpA  40.12 
 
 
331 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5330  hypothetical protein  39.18 
 
 
332 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12369  normal  0.395647 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2319  peptidase S58 DmpA  43.54 
 
 
361 aa  160  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212071  decreased coverage  0.00000119169 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4655  peptidase S58 DmpA  38.39 
 
 
347 aa  158  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.505511 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1456  peptidase S58 DmpA  43.9 
 
 
300 aa  155  9e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.749732  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0620  peptidase S58, DmpA  40.25 
 
 
327 aa  150  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.975766  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3882  hypothetical protein  38.58 
 
 
333 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.482216  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4493  peptidase S58 DmpA  38.94 
 
 
331 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0463  peptidase S58, DmpA  40.41 
 
 
331 aa  144  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4203  peptidase S58 DmpA  38.77 
 
 
331 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04100  L-aminopeptidase/D-esterase  41.69 
 
 
348 aa  136  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.037097 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3189  peptidase S58 DmpA  43.43 
 
 
339 aa  132  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.746127 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2376  peptidase S58 DmpA  30.47 
 
 
282 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.90605  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6005  peptidase S58, DmpA  33.12 
 
 
330 aa  104  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2264  peptidase S58 DmpA  38.65 
 
 
311 aa  102  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1007  peptidase S58, DmpA  50.43 
 
 
204 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442944  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4346  peptidase S58 DmpA  43.96 
 
 
299 aa  66.6  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0592  putative D-aminopeptidase  31.64 
 
 
376 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0875  putative D-aminopeptidase  31.64 
 
 
376 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1842  putative D-aminopeptidase  31.64 
 
 
376 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1108  putative D-aminopeptidase  32.67 
 
 
376 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1022  putative D-aminopeptidase  32.67 
 
 
376 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2326  peptidase  32.67 
 
 
376 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1923  aminopeptidase DmpA  31.03 
 
 
346 aa  53.9  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3533  peptidase S58, DmpA  29.39 
 
 
372 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1650  D-aminopeptidase, putative  32.45 
 
 
407 aa  50.4  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3844  D-aminopeptidase putative  31.6 
 
 
377 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3656  aminopeptidase DmpA  26.26 
 
 
371 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.950122  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3840  hypothetical protein  30.25 
 
 
366 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1411  peptidase S58, DmpA  31.28 
 
 
352 aa  47  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.704657  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2559  peptidase S58 DmpA  29.59 
 
 
367 aa  47  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117376 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45210  hypothetical protein  29.94 
 
 
366 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152868  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0605  peptidase S58 DmpA  29.81 
 
 
369 aa  45.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3199  peptidase S58 DmpA  33.11 
 
 
369 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448482  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5913  aminopeptidase  28.86 
 
 
349 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2448  aminopeptidase DmpA  29.49 
 
 
489 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.357188  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4044  peptidase S58, DmpA  33.11 
 
 
369 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181806  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4322  peptidase S58, DmpA  33.11 
 
 
369 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.810072  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4211  peptidase S58 DmpA  33.55 
 
 
369 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.131306 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6180  peptidase S58 DmpA  27.76 
 
 
375 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1411  peptidase S58 DmpA  29.58 
 
 
489 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1507  peptidase S58 DmpA  29.58 
 
 
489 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3737  peptidase S58, DmpA  33.22 
 
 
369 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0673701  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5206  aminopeptidase DmpA  30.28 
 
 
367 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>