68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3297 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_3297  oligogalacturonide lyase  100 
 
 		 391 aa  821    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.367487  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1682  oligogalacturonide lyase  70.05 
 
 		 388 aa  582  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1792  oligogalacturonide lyase  70.05 
 
 		 388 aa  582  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.512963  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2654  oligogalacturonate lyase  69.79 
 
 		 388 aa  579  1e-164  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.619254  normal  0.0112854 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1948  Oligogalacturonide lyase  68.49 
 
 		 388 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000264473  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2056  Oligogalacturonide lyase  68.23 
 
 		 388 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00529554  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2176  Oligogalacturonide lyase  67.45 
 
 		 388 aa  565  1e-160  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00249856  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1884  Oligogalacturonide lyase  67.45 
 
 		 388 aa  566  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00177498  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000912  oligogalacturonate lyase  64.32 
 
 		 385 aa  547  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3293  oligogalacturonide lyase  59.47 
 
 		 375 aa  486  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.489852 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0773  oligogalacturonide lyase  53.4 
 
 		 382 aa  449  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2370  oligogalacturonide lyase  27.53 
 
 		 383 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.612375 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0273  hypothetical protein  26.12 
 
 		 378 aa  99.8  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.738007 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3901  hypothetical protein  25.51 
 
 		 394 aa  98.6  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0134044  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2448  hypothetical protein  23.35 
 
 		 391 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.373683  normal  0.317121 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  26.37 
 
 		 444 aa  56.2  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  27.72 
 
 		 442 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.63 
 
 		 442 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  26.37 
 
 		 449 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  25.82 
 
 		 449 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  29.66 
 
 		 442 aa  53.1  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  27.17 
 
 		 461 aa  53.1  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  24.18 
 
 		 443 aa  52.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  20.26 
 
 		 428 aa  51.6  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  23.11 
 
 		 439 aa  51.6  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  24.18 
 
 		 443 aa  51.6  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  24.18 
 
 		 443 aa  51.2  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1731  translocation protein TolB  28.97 
 
 		 449 aa  50.4  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.693647  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  25.27 
 
 		 450 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  25.27 
 
 		 450 aa  50.4  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  24.18 
 
 		 436 aa  50.4  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1094  translocation protein TolB  24.86 
 
 		 443 aa  50.4  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  28.37 
 
 		 442 aa  48.5  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  24.18 
 
 		 462 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2416  TolB domain-containing protein  25.6 
 
 		 453 aa  48.1  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  21.37 
 
 		 439 aa  48.1  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  27.66 
 
 		 442 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  25.3 
 
 		 425 aa  48.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  27.66 
 
 		 442 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  24.73 
 
 		 450 aa  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  27.66 
 
 		 442 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003913  TolB protein precursor  23.89 
 
 		 442 aa  47.8  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26371  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  26.55 
 
 		 451 aa  46.6  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  28.37 
 
 		 442 aa  46.6  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  26.76 
 
 		 442 aa  46.6  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  23.08 
 
 		 446 aa  46.6  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  24.29 
 
 		 442 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  22.22 
 
 		 443 aa  46.2  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  24.6 
 
 		 446 aa  45.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  23.63 
 
 		 450 aa  46.2  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1068  translocation protein TolB  22.13 
 
 		 439 aa  46.2  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.360403  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  24.29 
 
 		 442 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  24.29 
 
 		 442 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2529  translocation protein TolB  23.03 
 
 		 445 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000320948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  24.29 
 
 		 442 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  24.6 
 
 		 446 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_002978  WD0038  translocation protein TolB  23.35 
 
 		 420 aa  45.1  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0823662  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2564  translocation protein TolB  24.86 
 
 		 440 aa  45.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000866572  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01610  translocation protein TolB  23.89 
 
 		 442 aa  45.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  25.54 
 
 		 435 aa  44.3  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1429  translocation protein TolB  24.44 
 
 		 450 aa  44.3  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000134537  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  25.7 
 
 		 451 aa  44.3  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0262  translocation protein TolB  40.32 
 
 		 434 aa  43.9  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000248265  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3949  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.61 
 
 		 716 aa  43.9  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782575  normal  0.167111 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  24.06 
 
 		 446 aa  43.9  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  24.86 
 
 		 445 aa  43.5  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  24.5 
 
 		 439 aa  43.5  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  24.32 
 
 		 461 aa  43.1  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>