27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000912 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000912  oligogalacturonate lyase  100 
 
 		 385 aa  807    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2056  Oligogalacturonide lyase  69.09 
 
 		 388 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00529554  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1682  oligogalacturonide lyase  68.31 
 
 		 388 aa  579  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1792  oligogalacturonide lyase  68.31 
 
 		 388 aa  579  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.512963  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2654  oligogalacturonate lyase  68.05 
 
 		 388 aa  576  1.0000000000000001e-163  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.619254  normal  0.0112854 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1948  Oligogalacturonide lyase  67.79 
 
 		 388 aa  571  1.0000000000000001e-162  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000264473  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2176  Oligogalacturonide lyase  67.79 
 
 		 388 aa  570  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00249856  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1884  Oligogalacturonide lyase  67.53 
 
 		 388 aa  567  1e-161  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00177498  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3297  oligogalacturonide lyase  64.32 
 
 		 391 aa  547  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.367487  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3293  oligogalacturonide lyase  60.26 
 
 		 375 aa  508  1e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.489852 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0773  oligogalacturonide lyase  53.68 
 
 		 382 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2370  oligogalacturonide lyase  27.89 
 
 		 383 aa  144  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.612375 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3901  hypothetical protein  25.83 
 
 		 394 aa  110  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0134044  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0273  hypothetical protein  23.95 
 
 		 378 aa  91.7  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.738007 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2448  hypothetical protein  24.11 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.373683  normal  0.317121 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  25.4 
 
 		 428 aa  49.7  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  25.99 
 
 		 439 aa  46.6  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  25.82 
 
 		 449 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3949  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.23 
 
 		 716 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782575  normal  0.167111 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  25.82 
 
 		 449 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  25.27 
 
 		 444 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2529  translocation protein TolB  26.16 
 
 		 445 aa  44.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000320948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  26.09 
 
 		 439 aa  44.3  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  32.53 
 
 		 441 aa  43.9  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  24.19 
 
 		 439 aa  43.5  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  23.53 
 
 		 462 aa  43.1  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  25.27 
 
 		 450 aa  42.7  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>