47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3293 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_3293  oligogalacturonide lyase  100 
 
 		 375 aa  789    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.489852 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1884  Oligogalacturonide lyase  65.79 
 
 		 388 aa  541  1e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00177498  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2176  Oligogalacturonide lyase  65.79 
 
 		 388 aa  540  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00249856  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2056  Oligogalacturonide lyase  65.79 
 
 		 388 aa  536  1e-151  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00529554  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1792  oligogalacturonide lyase  65.79 
 
 		 388 aa  536  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.512963  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2654  oligogalacturonate lyase  65.53 
 
 		 388 aa  534  1e-151  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.619254  normal  0.0112854 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1682  oligogalacturonide lyase  65.79 
 
 		 388 aa  536  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1948  Oligogalacturonide lyase  65.26 
 
 		 388 aa  532  1e-150  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000264473  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000912  oligogalacturonate lyase  60.26 
 
 		 385 aa  508  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3297  oligogalacturonide lyase  59.47 
 
 		 391 aa  486  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.367487  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0773  oligogalacturonide lyase  50.92 
 
 		 382 aa  418  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2370  oligogalacturonide lyase  27.94 
 
 		 383 aa  139  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.612375 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3901  hypothetical protein  25.94 
 
 		 394 aa  93.6  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0134044  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0273  hypothetical protein  22.19 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.738007 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  28.26 
 
 		 461 aa  60.5  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2448  hypothetical protein  21.11 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.373683  normal  0.317121 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  25.97 
 
 		 445 aa  53.5  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  25.33 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  25.33 
 
 		 430 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  25.16 
 
 		 441 aa  48.9  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  22.91 
 
 		 449 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  23.68 
 
 		 430 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  21.47 
 
 		 444 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  22.63 
 
 		 449 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  20 
 
 		 421 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0317  translocation protein TolB  23.71 
 
 		 431 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520547  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  25.43 
 
 		 1097 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  20.38 
 
 		 437 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0800  translocation protein TolB  24.27 
 
 		 431 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665253  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  20.9 
 
 		 444 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  22.63 
 
 		 444 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  20.9 
 
 		 444 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  23.77 
 
 		 434 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3889  translocation protein TolB  23.63 
 
 		 431 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  21.11 
 
 		 440 aa  43.5  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  21.11 
 
 		 443 aa  43.5  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1331  WD40 domain-containing protein  26.37 
 
 		 455 aa  43.5  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880519 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  23.12 
 
 		 1062 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  27.21 
 
 		 442 aa  43.5  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0769  translocation protein TolB  23.79 
 
 		 431 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  23.28 
 
 		 431 aa  43.1  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  21.01 
 
 		 429 aa  43.1  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3949  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.6 
 
 		 716 aa  43.1  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782575  normal  0.167111 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  23.78 
 
 		 407 aa  42.7  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  23.68 
 
 		 434 aa  42.7  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1398  translocation protein TolB  34.12 
 
 		 417 aa  42.7  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.468764  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  24.02 
 
 		 443 aa  42.7  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>