12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1331 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1331  WD40 domain-containing protein  100 
 
 		 455 aa  938    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880519 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3901  hypothetical protein  23.16 
 
 		 394 aa  63.5  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0134044  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2370  oligogalacturonide lyase  24.03 
 
 		 383 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.612375 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2654  oligogalacturonate lyase  22.38 
 
 		 388 aa  49.3  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.619254  normal  0.0112854 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0773  oligogalacturonide lyase  25.7 
 
 		 382 aa  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1682  oligogalacturonide lyase  22.14 
 
 		 388 aa  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1792  oligogalacturonide lyase  22.14 
 
 		 388 aa  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.512963  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2056  Oligogalacturonide lyase  25.75 
 
 		 388 aa  47  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00529554  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1948  Oligogalacturonide lyase  25.58 
 
 		 388 aa  43.5  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000264473  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2176  Oligogalacturonide lyase  25.23 
 
 		 388 aa  43.5  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00249856  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3293  oligogalacturonide lyase  26.37 
 
 		 375 aa  43.5  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.489852 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1884  Oligogalacturonide lyase  25.23 
 
 		 388 aa  43.1  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00177498  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>