28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3901 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013744  Htur_3901  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  793    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0134044  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2370  oligogalacturonide lyase  41.12 
 
 		 383 aa  250  4e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.612375 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000912  oligogalacturonate lyase  25.83 
 
 		 385 aa  110  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2056  Oligogalacturonide lyase  27.27 
 
 		 388 aa  107  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00529554  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1792  oligogalacturonide lyase  28.01 
 
 		 388 aa  106  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.512963  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1682  oligogalacturonide lyase  28.01 
 
 		 388 aa  106  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2176  Oligogalacturonide lyase  26.85 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00249856  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1884  Oligogalacturonide lyase  26.85 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00177498  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1948  Oligogalacturonide lyase  27.52 
 
 		 388 aa  104  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000264473  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2654  oligogalacturonate lyase  28.01 
 
 		 388 aa  104  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.619254  normal  0.0112854 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3297  oligogalacturonide lyase  25.51 
 
 		 391 aa  98.6  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.367487  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0773  oligogalacturonide lyase  26.54 
 
 		 382 aa  98.2  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3293  oligogalacturonide lyase  25.94 
 
 		 375 aa  93.6  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.489852 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0273  hypothetical protein  26.38 
 
 		 378 aa  90.9  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.738007 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2448  hypothetical protein  27.2 
 
 		 391 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.373683  normal  0.317121 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1331  WD40 domain-containing protein  23.16 
 
 		 455 aa  63.5  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880519 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2086  translocation protein TolB  52.63 
 
 		 441 aa  48.9  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000540509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2564  translocation protein TolB  52.63 
 
 		 440 aa  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000866572  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  47.37 
 
 		 442 aa  46.2  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2060  WD40 domain-containing protein  41.38 
 
 		 1206 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.456517  normal  0.995925 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  52.63 
 
 		 442 aa  44.7  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  52.63 
 
 		 442 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  52.63 
 
 		 442 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  52.63 
 
 		 442 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  33.75 
 
 		 442 aa  44.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1689  peptidase, putative  45 
 
 		 684 aa  43.9  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.163482  normal  0.0910098 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  47.37 
 
 		 440 aa  42.7  0.01  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  47.37 
 
 		 437 aa  42.7  0.01  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>