20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2370 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2370  oligogalacturonide lyase  100 
 
 		 383 aa  791    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.612375 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3901  hypothetical protein  41.12 
 
 		 394 aa  250  3e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0134044  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2056  Oligogalacturonide lyase  30.58 
 
 		 388 aa  167  4e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00529554  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2176  Oligogalacturonide lyase  30.9 
 
 		 388 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00249856  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1884  Oligogalacturonide lyase  30.9 
 
 		 388 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00177498  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1682  oligogalacturonide lyase  29.62 
 
 		 388 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1792  oligogalacturonide lyase  29.62 
 
 		 388 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.512963  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2654  oligogalacturonate lyase  29.62 
 
 		 388 aa  161  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.619254  normal  0.0112854 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1948  Oligogalacturonide lyase  30.58 
 
 		 388 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000264473  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000912  oligogalacturonate lyase  27.89 
 
 		 385 aa  144  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3293  oligogalacturonide lyase  27.94 
 
 		 375 aa  139  6e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.489852 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3297  oligogalacturonide lyase  27.53 
 
 		 391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.367487  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0773  oligogalacturonide lyase  26.79 
 
 		 382 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0273  hypothetical protein  25.58 
 
 		 378 aa  109  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.738007 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2448  hypothetical protein  26.24 
 
 		 391 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.373683  normal  0.317121 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1331  WD40 domain-containing protein  24.03 
 
 		 455 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880519 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2086  translocation protein TolB  33.93 
 
 		 441 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000540509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  33.93 
 
 		 442 aa  43.5  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  33.93 
 
 		 442 aa  43.5  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  33.93 
 
 		 442 aa  43.5  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>