16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0273 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0273  hypothetical protein  100 
 
 		 378 aa  791    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.738007 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2448  hypothetical protein  65.1 
 
 		 391 aa  490  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.373683  normal  0.317121 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2370  oligogalacturonide lyase  25.58 
 
 		 383 aa  109  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.612375 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0773  oligogalacturonide lyase  24.88 
 
 		 382 aa  100  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3297  oligogalacturonide lyase  26.12 
 
 		 391 aa  99.8  8e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.367487  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2176  Oligogalacturonide lyase  24.32 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00249856  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000912  oligogalacturonate lyase  23.95 
 
 		 385 aa  91.7  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3901  hypothetical protein  26.38 
 
 		 394 aa  90.9  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0134044  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1884  Oligogalacturonide lyase  24.07 
 
 		 388 aa  89.7  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00177498  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1682  oligogalacturonide lyase  24.5 
 
 		 388 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1792  oligogalacturonide lyase  24.5 
 
 		 388 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.512963  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2056  Oligogalacturonide lyase  22.94 
 
 		 388 aa  88.2  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00529554  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2654  oligogalacturonate lyase  24.26 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.619254  normal  0.0112854 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1948  Oligogalacturonide lyase  23.44 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000264473  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3293  oligogalacturonide lyase  22.19 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.489852 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1114  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  40.68 
 
 		 701 aa  43.9  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.131603 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>